RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468255.5

CSNK2B-206, Transcript of casein kinase 2 beta, humanhuman

TSL 5

Gene CSNK2B, Length 1,792 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2B-206ENST00000468255 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.89■■□□□ 1.09
CSNK2B-206ENST00000468255 CUL7Q14999 1698 aa21.88■■□□□ 1.09
CSNK2B-206ENST00000468255 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.87■■□□□ 1.09
CSNK2B-206ENST00000468255 MIER1Q8N108 512 aa21.86■■□□□ 1.09
CSNK2B-206ENST00000468255 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.093e-8■■■■□ 24.7
CSNK2B-206ENST00000468255 TOPBP1Q92547 1522 aa21.8■■□□□ 1.08
CSNK2B-206ENST00000468255 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.79■■□□□ 1.08
CSNK2B-206ENST00000468255 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
CSNK2B-206ENST00000468255 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CSNK2B-206ENST00000468255 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.76■■□□□ 1.07
CSNK2B-206ENST00000468255 ERCC6Q03468 1493 aa21.76■■□□□ 1.07
CSNK2B-206ENST00000468255 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.76■■□□□ 1.07
CSNK2B-206ENST00000468255 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CSNK2B-206ENST00000468255 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.75■■□□□ 1.07
CSNK2B-206ENST00000468255 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.74■■□□□ 1.07
CSNK2B-206ENST00000468255 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.74■■□□□ 1.07
CSNK2B-206ENST00000468255 WDR97A6NE52 1622 aa21.71■■□□□ 1.07
CSNK2B-206ENST00000468255 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.69■■□□□ 1.06
CSNK2B-206ENST00000468255 FMN1Q68DA7 1419 aa21.68■■□□□ 1.06
CSNK2B-206ENST00000468255 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.68■■□□□ 1.06
CSNK2B-206ENST00000468255 MAPKBP1O60336 1514 aa21.68■■□□□ 1.06
CSNK2B-206ENST00000468255 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.67■■□□□ 1.06
CSNK2B-206ENST00000468255 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CSNK2B-206ENST00000468255 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CSNK2B-206ENST00000468255 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.61■■□□□ 1.05
CSNK2B-206ENST00000468255 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.61■■□□□ 1.05
CSNK2B-206ENST00000468255 SAMD9Q5K651 1589 aa21.58■■□□□ 1.05
CSNK2B-206ENST00000468255 ITGAEP38570 1179 aa21.58■■□□□ 1.04
CSNK2B-206ENST00000468255 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CSNK2B-206ENST00000468255 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK2B-206ENST00000468255 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK2B-206ENST00000468255 NESP48681 1621 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK2B-206ENST00000468255 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK2B-206ENST00000468255 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CSNK2B-206ENST00000468255 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.51■■□□□ 1.03
CSNK2B-206ENST00000468255 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.5■■□□□ 1.03
CSNK2B-206ENST00000468255 P3H3Q8IVL6 736 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK2B-206ENST00000468255 GRIN2BQ13224 1484 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK2B-206ENST00000468255 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK2B-206ENST00000468255 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK2B-206ENST00000468255 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CSNK2B-206ENST00000468255 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CSNK2B-206ENST00000468255 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK2B-206ENST00000468255 HFM1A2PYH4 1435 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK2B-206ENST00000468255 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.4■■□□□ 1.02
CSNK2B-206ENST00000468255 MYT1Q01538 1121 aa21.38■■□□□ 1.01
CSNK2B-206ENST00000468255 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CSNK2B-206ENST00000468255 UACAQ9BZF9 1416 aa21.38■■□□□ 1.01
CSNK2B-206ENST00000468255 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK2B-206ENST00000468255 NCOA2Q15596 1464 aa21.37■■□□□ 1.01
CSNK2B-206ENST00000468255 ARHGEF11O15085 1522 aa21.36■■□□□ 1.01
CSNK2B-206ENST00000468255 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CSNK2B-206ENST00000468255 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.35■■□□□ 1.01
CSNK2B-206ENST00000468255 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CSNK2B-206ENST00000468255 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.34■■□□□ 1.01
CSNK2B-206ENST00000468255 HECW1Q76N89 1606 aa21.33■■□□□ 1.01
CSNK2B-206ENST00000468255 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CSNK2B-206ENST00000468255 PBRM1Q86U86 1689 aa21.31■■□□□ 1
CSNK2B-206ENST00000468255 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.31■■□□□ 1
CSNK2B-206ENST00000468255 AKNAQ7Z591 1439 aa21.31■■□□□ 1
CSNK2B-206ENST00000468255 NAIPQ13075 1403 aa21.28■■□□□ 1
CSNK2B-206ENST00000468255 IQGAP2Q13576 1575 aa21.27■■□□□ 1
CSNK2B-206ENST00000468255 TONSLQ96HA7 1378 aa21.27■■□□□ 1
CSNK2B-206ENST00000468255 ADAMTS12P58397 1594 aa21.26■□□□□ 0.99
CSNK2B-206ENST00000468255 CCER2I3L3R5 266 aa21.25■□□□□ 0.99
CSNK2B-206ENST00000468255 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.25■□□□□ 0.99
CSNK2B-206ENST00000468255 PTPRKQ15262 1439 aa21.24■□□□□ 0.99
CSNK2B-206ENST00000468255 MIA2Q96PC5 1412 aa21.23■□□□□ 0.99
CSNK2B-206ENST00000468255 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.21■□□□□ 0.99
CSNK2B-206ENST00000468255 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.99
CSNK2B-206ENST00000468255 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CSNK2B-206ENST00000468255 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CSNK2B-206ENST00000468255 WDR62O43379 1518 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK2B-206ENST00000468255 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK2B-206ENST00000468255 ANP32CO43423 234 aa21.14■□□□□ 0.97
CSNK2B-206ENST00000468255 IFT140Q96RY7 1462 aa21.14■□□□□ 0.97
CSNK2B-206ENST00000468255 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.08■□□□□ 0.97
CSNK2B-206ENST00000468255 ROCK1Q13464 1354 aa21.07■□□□□ 0.96
CSNK2B-206ENST00000468255 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.07■□□□□ 0.96
CSNK2B-206ENST00000468255 KIAA0556O60303 1618 aa21.03■□□□□ 0.96
CSNK2B-206ENST00000468255 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CSNK2B-206ENST00000468255 KCNH8Q96L42 1107 aa21■□□□□ 0.95
CSNK2B-206ENST00000468255 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
CSNK2B-206ENST00000468255 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.98■□□□□ 0.95
CSNK2B-206ENST00000468255 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
CSNK2B-206ENST00000468255 DISP1Q96F81 1524 aa20.97■□□□□ 0.95
CSNK2B-206ENST00000468255 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CSNK2B-206ENST00000468255 DAPK1P53355 1430 aa20.96■□□□□ 0.95
CSNK2B-206ENST00000468255 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.95■□□□□ 0.94
CSNK2B-206ENST00000468255 NEFLP07196 543 aa20.93■□□□□ 0.94
CSNK2B-206ENST00000468255 TRIM52Q96A61 297 aa20.93■□□□□ 0.94
CSNK2B-206ENST00000468255 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.93■□□□□ 0.94
CSNK2B-206ENST00000468255 GRIN2AQ12879 1464 aa20.93■□□□□ 0.94
CSNK2B-206ENST00000468255 KDM6BO15054 1643 aa20.92■□□□□ 0.94
CSNK2B-206ENST00000468255 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
CSNK2B-206ENST00000468255 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CSNK2B-206ENST00000468255 OSCARQ8IYS5 282 aa20.91■□□□□ 0.94
CSNK2B-206ENST00000468255 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.91■□□□□ 0.94
CSNK2B-206ENST00000468255 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
CSNK2B-206ENST00000468255 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.89■□□□□ 0.93
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