RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468135.5

TMEM39B-205, Transcript of transmembrane protein 39B, humanhuman

TSL 5

Gene TMEM39B, Length 1,834 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39B-205ENST00000468135 CUL7Q14999 1698 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM39B-205ENST00000468135 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.21■■□□□ 1.63
TMEM39B-205ENST00000468135 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.2■■□□□ 1.63
TMEM39B-205ENST00000468135 TOPBP1Q92547 1522 aa25.18■■□□□ 1.62
TMEM39B-205ENST00000468135 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TMEM39B-205ENST00000468135 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TMEM39B-205ENST00000468135 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.613e-6■■■□□ 18.4
TMEM39B-205ENST00000468135 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.12■■□□□ 1.61
TMEM39B-205ENST00000468135 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM39B-205ENST00000468135 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM39B-205ENST00000468135 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM39B-205ENST00000468135 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TMEM39B-205ENST00000468135 ITGAEP38570 1179 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM39B-205ENST00000468135 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM39B-205ENST00000468135 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM39B-205ENST00000468135 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.07■■□□□ 1.6
TMEM39B-205ENST00000468135 NESP48681 1621 aa25.06■■□□□ 1.6
TMEM39B-205ENST00000468135 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.04■■□□□ 1.6
TMEM39B-205ENST00000468135 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
TMEM39B-205ENST00000468135 FMN1Q68DA7 1419 aa25.03■■□□□ 1.6
TMEM39B-205ENST00000468135 WDR97A6NE52 1622 aa25.01■■□□□ 1.59
TMEM39B-205ENST00000468135 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25■■□□□ 1.59
TMEM39B-205ENST00000468135 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TMEM39B-205ENST00000468135 MAPKBP1O60336 1514 aa24.98■■□□□ 1.59
TMEM39B-205ENST00000468135 P3H3Q8IVL6 736 aa24.98■■□□□ 1.59
TMEM39B-205ENST00000468135 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TMEM39B-205ENST00000468135 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.97■■□□□ 1.59
TMEM39B-205ENST00000468135 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.93■■□□□ 1.58
TMEM39B-205ENST00000468135 ERCC6Q03468 1493 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM39B-205ENST00000468135 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TMEM39B-205ENST00000468135 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM39B-205ENST00000468135 SAMD9Q5K651 1589 aa24.87■■□□□ 1.57
TMEM39B-205ENST00000468135 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.86■■□□□ 1.57
TMEM39B-205ENST00000468135 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TMEM39B-205ENST00000468135 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.84■■□□□ 1.57
TMEM39B-205ENST00000468135 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.82■■□□□ 1.56
TMEM39B-205ENST00000468135 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.81■■□□□ 1.56
TMEM39B-205ENST00000468135 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.81■■□□□ 1.56
TMEM39B-205ENST00000468135 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TMEM39B-205ENST00000468135 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TMEM39B-205ENST00000468135 GRIN2BQ13224 1484 aa24.74■■□□□ 1.55
TMEM39B-205ENST00000468135 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM39B-205ENST00000468135 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.69■■□□□ 1.54
TMEM39B-205ENST00000468135 HFM1A2PYH4 1435 aa24.69■■□□□ 1.54
TMEM39B-205ENST00000468135 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.69■■□□□ 1.54
TMEM39B-205ENST00000468135 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.68■■□□□ 1.54
TMEM39B-205ENST00000468135 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
TMEM39B-205ENST00000468135 NCOA2Q15596 1464 aa24.68■■□□□ 1.54
TMEM39B-205ENST00000468135 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.67■■□□□ 1.54
TMEM39B-205ENST00000468135 UACAQ9BZF9 1416 aa24.65■■□□□ 1.54
TMEM39B-205ENST00000468135 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
TMEM39B-205ENST00000468135 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.63■■□□□ 1.53
TMEM39B-205ENST00000468135 PBRM1Q86U86 1689 aa24.62■■□□□ 1.53
TMEM39B-205ENST00000468135 HECW1Q76N89 1606 aa24.61■■□□□ 1.53
TMEM39B-205ENST00000468135 TONSLQ96HA7 1378 aa24.6■■□□□ 1.53
TMEM39B-205ENST00000468135 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM39B-205ENST00000468135 ARHGEF11O15085 1522 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM39B-205ENST00000468135 IQGAP2Q13576 1575 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM39B-205ENST00000468135 NAIPQ13075 1403 aa24.55■■□□□ 1.52
TMEM39B-205ENST00000468135 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.54■■□□□ 1.52
TMEM39B-205ENST00000468135 PTPRKQ15262 1439 aa24.53■■□□□ 1.52
TMEM39B-205ENST00000468135 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TMEM39B-205ENST00000468135 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
TMEM39B-205ENST00000468135 ADAMTS12P58397 1594 aa24.52■■□□□ 1.52
TMEM39B-205ENST00000468135 AKNAQ7Z591 1439 aa24.48■■□□□ 1.51
TMEM39B-205ENST00000468135 MYT1Q01538 1121 aa24.47■■□□□ 1.51
TMEM39B-205ENST00000468135 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
TMEM39B-205ENST00000468135 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.47■■□□□ 1.51
TMEM39B-205ENST00000468135 CCER2I3L3R5 266 aa24.47■■□□□ 1.51
TMEM39B-205ENST00000468135 MIA2Q96PC5 1412 aa24.47■■□□□ 1.51
TMEM39B-205ENST00000468135 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
TMEM39B-205ENST00000468135 WDR62O43379 1518 aa24.44■■□□□ 1.5
TMEM39B-205ENST00000468135 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.44■■□□□ 1.5
TMEM39B-205ENST00000468135 ANP32CO43423 234 aa24.44■■□□□ 1.5
TMEM39B-205ENST00000468135 IFT140Q96RY7 1462 aa24.39■■□□□ 1.5
TMEM39B-205ENST00000468135 KCNH8Q96L42 1107 aa24.33■■□□□ 1.49
TMEM39B-205ENST00000468135 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.32■■□□□ 1.48
TMEM39B-205ENST00000468135 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.31■■□□□ 1.48
TMEM39B-205ENST00000468135 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TMEM39B-205ENST00000468135 TRIM52Q96A61 297 aa24.29■■□□□ 1.48
TMEM39B-205ENST00000468135 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TMEM39B-205ENST00000468135 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TMEM39B-205ENST00000468135 ROCK1Q13464 1354 aa24.27■■□□□ 1.48
TMEM39B-205ENST00000468135 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.27■■□□□ 1.48
TMEM39B-205ENST00000468135 KIAA0556O60303 1618 aa24.27■■□□□ 1.48
TMEM39B-205ENST00000468135 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.25■■□□□ 1.47
TMEM39B-205ENST00000468135 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.21■■□□□ 1.47
TMEM39B-205ENST00000468135 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.21■■□□□ 1.47
TMEM39B-205ENST00000468135 DISP1Q96F81 1524 aa24.21■■□□□ 1.47
TMEM39B-205ENST00000468135 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TMEM39B-205ENST00000468135 DAPK1P53355 1430 aa24.19■■□□□ 1.46
TMEM39B-205ENST00000468135 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TMEM39B-205ENST00000468135 NEFLP07196 543 aa24.19■■□□□ 1.46
TMEM39B-205ENST00000468135 GRIN2AQ12879 1464 aa24.18■■□□□ 1.46
TMEM39B-205ENST00000468135 KDM6BO15054 1643 aa24.17■■□□□ 1.46
TMEM39B-205ENST00000468135 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TMEM39B-205ENST00000468135 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
TMEM39B-205ENST00000468135 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
TMEM39B-205ENST00000468135 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TMEM39B-205ENST00000468135 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms