RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-210ENST00000462363 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.96
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 CUX2O14529 1486 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 IGF1RP08069 1367 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 ABCB7O75027 752 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 CLIP1P30622 1438 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 CUL7Q14999 1698 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 ARAP1Q96P48 1450 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRC-210ENST00000462363 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRC-210ENST00000462363 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRC-210ENST00000462363 HRCP23327 699 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRC-210ENST00000462363 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRC-210ENST00000462363 WDR62O43379 1518 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-210ENST00000462363 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-210ENST00000462363 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-210ENST00000462363 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-210ENST00000462363 APLP2Q06481 763 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-210ENST00000462363 LHX8Q68G74 356 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-210ENST00000462363 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-210ENST00000462363 PBRM1Q86U86 1689 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-210ENST00000462363 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-210ENST00000462363 ADAMTS12P58397 1594 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-210ENST00000462363 SAMD9Q5K651 1589 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-210ENST00000462363 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-210ENST00000462363 MAP3K1Q13233 1512 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-210ENST00000462363 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 IFT140Q96RY7 1462 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 TIAM1Q13009 1591 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 GRIN2BQ13224 1484 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-210ENST00000462363 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-210ENST00000462363 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-210ENST00000462363 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-210ENST00000462363 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-210ENST00000462363 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-210ENST00000462363 IQGAP2Q13576 1575 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-210ENST00000462363 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRC-210ENST00000462363 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRC-210ENST00000462363 POLA2Q14181 598 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 ERCC6Q03468 1493 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 GRIN2AQ12879 1464 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 FMN1Q68DA7 1419 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 SYNJ2O15056 1496 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF11O15085 1522 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 CEP170Q5SW79 1584 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 DISP1Q96F81 1524 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA0556O60303 1618 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 NUP160Q12769 1436 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 HAX1O00165 279 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 HECW1Q76N89 1606 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 SHROOM2Q13796 1616 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 P3H3Q8IVL6 736 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 CHD1O14646 1710 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 NCOA2Q15596 1464 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 ABCA8O94911 1581 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 208.8 ms