RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.05■■■□□ 2.4
IMP4-208ENST00000460766 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.05■■■□□ 2.4
IMP4-208ENST00000460766 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
IMP4-208ENST00000460766 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.03■■■□□ 2.4
IMP4-208ENST00000460766 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.01■■■□□ 2.39
IMP4-208ENST00000460766 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
IMP4-208ENST00000460766 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.92■■■□□ 2.38
IMP4-208ENST00000460766 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.92■■■□□ 2.38
IMP4-208ENST00000460766 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
IMP4-208ENST00000460766 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.91■■■□□ 2.38
IMP4-208ENST00000460766 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
IMP4-208ENST00000460766 CUL7Q14999 1698 aa29.86■■■□□ 2.37
IMP4-208ENST00000460766 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.84■■■□□ 2.37
IMP4-208ENST00000460766 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.84■■■□□ 2.37
IMP4-208ENST00000460766 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.84■■■□□ 2.37
IMP4-208ENST00000460766 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
IMP4-208ENST00000460766 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
IMP4-208ENST00000460766 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.8■■■□□ 2.36
IMP4-208ENST00000460766 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.8■■■□□ 2.36
IMP4-208ENST00000460766 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.78■■■□□ 2.36
IMP4-208ENST00000460766 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
IMP4-208ENST00000460766 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.75■■■□□ 2.35
IMP4-208ENST00000460766 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.355e-7■■■■■ 37.2
IMP4-208ENST00000460766 MAPKBP1O60336 1514 aa29.73■■■□□ 2.35
IMP4-208ENST00000460766 WDR97A6NE52 1622 aa29.71■■■□□ 2.35
IMP4-208ENST00000460766 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.71■■■□□ 2.35
IMP4-208ENST00000460766 FMN1Q68DA7 1419 aa29.7■■■□□ 2.34
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.68■■■□□ 2.34
IMP4-208ENST00000460766 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.67■■■□□ 2.34
IMP4-208ENST00000460766 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.65■■■□□ 2.34
IMP4-208ENST00000460766 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.6■■■□□ 2.33
IMP4-208ENST00000460766 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.57■■■□□ 2.32
IMP4-208ENST00000460766 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.32
IMP4-208ENST00000460766 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.55■■■□□ 2.32
IMP4-208ENST00000460766 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.53■■■□□ 2.32
IMP4-208ENST00000460766 SAMD9Q5K651 1589 aa29.53■■■□□ 2.32
IMP4-208ENST00000460766 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.51■■■□□ 2.31
IMP4-208ENST00000460766 GRIN2BQ13224 1484 aa29.43■■■□□ 2.3
IMP4-208ENST00000460766 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
IMP4-208ENST00000460766 NCOA2Q15596 1464 aa29.39■■■□□ 2.3
IMP4-208ENST00000460766 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.38■■■□□ 2.29
IMP4-208ENST00000460766 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.38■■■□□ 2.29
IMP4-208ENST00000460766 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
IMP4-208ENST00000460766 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.35■■■□□ 2.29
IMP4-208ENST00000460766 PTPRKQ15262 1439 aa29.35■■■□□ 2.29
IMP4-208ENST00000460766 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.33■■■□□ 2.29
IMP4-208ENST00000460766 HFM1A2PYH4 1435 aa29.31■■■□□ 2.28
IMP4-208ENST00000460766 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.31■■■□□ 2.28
IMP4-208ENST00000460766 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
IMP4-208ENST00000460766 PBRM1Q86U86 1689 aa29.27■■■□□ 2.28
IMP4-208ENST00000460766 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.24■■■□□ 2.27
IMP4-208ENST00000460766 UACAQ9BZF9 1416 aa29.24■■■□□ 2.27
IMP4-208ENST00000460766 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
IMP4-208ENST00000460766 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.23■■■□□ 2.27
IMP4-208ENST00000460766 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.23■■■□□ 2.27
IMP4-208ENST00000460766 IQGAP2Q13576 1575 aa29.23■■■□□ 2.27
IMP4-208ENST00000460766 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.22■■■□□ 2.27
IMP4-208ENST00000460766 NAIPQ13075 1403 aa29.22■■■□□ 2.27
IMP4-208ENST00000460766 TONSLQ96HA7 1378 aa29.21■■■□□ 2.27
IMP4-208ENST00000460766 ADAMTS12P58397 1594 aa29.21■■■□□ 2.27
IMP4-208ENST00000460766 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
IMP4-208ENST00000460766 HECW1Q76N89 1606 aa29.18■■■□□ 2.26
IMP4-208ENST00000460766 ARHGEF11O15085 1522 aa29.17■■■□□ 2.26
IMP4-208ENST00000460766 KCNH8Q96L42 1107 aa29.17■■■□□ 2.26
IMP4-208ENST00000460766 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
IMP4-208ENST00000460766 ARID3CA6NKF2 412 aa29.13■■■□□ 2.25
IMP4-208ENST00000460766 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.12■■■□□ 2.25
IMP4-208ENST00000460766 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.12■■■□□ 2.25
IMP4-208ENST00000460766 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
IMP4-208ENST00000460766 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
IMP4-208ENST00000460766 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
IMP4-208ENST00000460766 IFT140Q96RY7 1462 aa29.05■■■□□ 2.24
IMP4-208ENST00000460766 WDR62O43379 1518 aa29.04■■■□□ 2.24
IMP4-208ENST00000460766 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
IMP4-208ENST00000460766 TRIM52Q96A61 297 aa28.99■■■□□ 2.23
IMP4-208ENST00000460766 MIA2Q96PC5 1412 aa28.99■■■□□ 2.23
IMP4-208ENST00000460766 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.95■■■□□ 2.23
IMP4-208ENST00000460766 ANP32CO43423 234 aa28.94■■■□□ 2.22
IMP4-208ENST00000460766 AKNAQ7Z591 1439 aa28.94■■■□□ 2.22
IMP4-208ENST00000460766 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.93■■■□□ 2.22
IMP4-208ENST00000460766 DISP1Q96F81 1524 aa28.91■■■□□ 2.22
IMP4-208ENST00000460766 KIAA0556O60303 1618 aa28.9■■■□□ 2.22
IMP4-208ENST00000460766 KDM6BO15054 1643 aa28.88■■■□□ 2.21
IMP4-208ENST00000460766 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.88■■■□□ 2.21
IMP4-208ENST00000460766 GRIN2AQ12879 1464 aa28.87■■■□□ 2.21
IMP4-208ENST00000460766 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
IMP4-208ENST00000460766 CCER2I3L3R5 266 aa28.86■■■□□ 2.21
IMP4-208ENST00000460766 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.85■■■□□ 2.21
IMP4-208ENST00000460766 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
IMP4-208ENST00000460766 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
IMP4-208ENST00000460766 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
IMP4-208ENST00000460766 DAPK1P53355 1430 aa28.8■■■□□ 2.2
IMP4-208ENST00000460766 ERCC6Q03468 1493 aa28.79■■■□□ 2.2
IMP4-208ENST00000460766 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
IMP4-208ENST00000460766 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.79■■■□□ 2.2
IMP4-208ENST00000460766 FOXD1Q16676 465 aa28.78■■■□□ 2.2
IMP4-208ENST00000460766 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
IMP4-208ENST00000460766 ROCK1Q13464 1354 aa28.75■■■□□ 2.19
IMP4-208ENST00000460766 ABCC5O15440 1437 aa28.75■■■□□ 2.19
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