RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.37■□□□□ 0.85
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NISCH-203ENST00000460759 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-203ENST00000460759 IQGAP2Q13576 1575 aa20.31■□□□□ 0.84
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NISCH-203ENST00000460759 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
NISCH-203ENST00000460759 ARAP1Q96P48 1450 aa20.29■□□□□ 0.84
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NISCH-203ENST00000460759 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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NISCH-203ENST00000460759 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.47■□□□□ 0.71
NISCH-203ENST00000460759 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.43■□□□□ 0.7
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NISCH-203ENST00000460759 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
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NISCH-203ENST00000460759 PREX2Q70Z35 1606 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-203ENST00000460759 WDR7Q9Y4E6 1490 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-203ENST00000460759 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.34■□□□□ 0.69
NISCH-203ENST00000460759 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.34■□□□□ 0.69
NISCH-203ENST00000460759 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.33■□□□□ 0.68
NISCH-203ENST00000460759 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
NISCH-203ENST00000460759 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.32■□□□□ 0.68
NISCH-203ENST00000460759 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.31■□□□□ 0.68
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