RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
HPS3-202ENST00000460120 TOPBP1Q92547 1522 aa26.62■■□□□ 1.85
HPS3-202ENST00000460120 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.61■■□□□ 1.85
HPS3-202ENST00000460120 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.57■■□□□ 1.84
HPS3-202ENST00000460120 TIAM1Q13009 1591 aa26.56■■□□□ 1.84
HPS3-202ENST00000460120 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.55■■□□□ 1.84
HPS3-202ENST00000460120 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
HPS3-202ENST00000460120 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.52■■□□□ 1.84
HPS3-202ENST00000460120 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.51■■□□□ 1.83
HPS3-202ENST00000460120 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.5■■□□□ 1.83
HPS3-202ENST00000460120 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.5■■□□□ 1.83
HPS3-202ENST00000460120 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HPS3-202ENST00000460120 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.47■■□□□ 1.83
HPS3-202ENST00000460120 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
HPS3-202ENST00000460120 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.37■■□□□ 1.81
HPS3-202ENST00000460120 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.35■■□□□ 1.81
HPS3-202ENST00000460120 MAP3K1Q13233 1512 aa26.34■■□□□ 1.81
HPS3-202ENST00000460120 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.29■■□□□ 1.8
HPS3-202ENST00000460120 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.28■■□□□ 1.8
HPS3-202ENST00000460120 CUL7Q14999 1698 aa26.27■■□□□ 1.8
HPS3-202ENST00000460120 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.27■■□□□ 1.8
HPS3-202ENST00000460120 MAPKBP1O60336 1514 aa26.27■■□□□ 1.8
HPS3-202ENST00000460120 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.27■■□□□ 1.8
HPS3-202ENST00000460120 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.26■■□□□ 1.79
HPS3-202ENST00000460120 ARID3CA6NKF2 412 aa26.26■■□□□ 1.79
HPS3-202ENST00000460120 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.26■■□□□ 1.79
HPS3-202ENST00000460120 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.24■■□□□ 1.79
HPS3-202ENST00000460120 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.23■■□□□ 1.79
HPS3-202ENST00000460120 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.22■■□□□ 1.79
HPS3-202ENST00000460120 FMN1Q68DA7 1419 aa26.2■■□□□ 1.79
HPS3-202ENST00000460120 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
HPS3-202ENST00000460120 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.17■■□□□ 1.78
HPS3-202ENST00000460120 WDR97A6NE52 1622 aa26.16■■□□□ 1.78
HPS3-202ENST00000460120 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.15■■□□□ 1.78
HPS3-202ENST00000460120 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.14■■□□□ 1.77
HPS3-202ENST00000460120 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
HPS3-202ENST00000460120 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.11■■□□□ 1.77
HPS3-202ENST00000460120 KCNH8Q96L42 1107 aa26.07■■□□□ 1.76
HPS3-202ENST00000460120 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.06■■□□□ 1.76
HPS3-202ENST00000460120 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
HPS3-202ENST00000460120 PTPRKQ15262 1439 aa26.04■■□□□ 1.76
HPS3-202ENST00000460120 NCOA2Q15596 1464 aa26.02■■□□□ 1.76
HPS3-202ENST00000460120 SAMD9Q5K651 1589 aa26.01■■□□□ 1.75
HPS3-202ENST00000460120 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26■■□□□ 1.75
HPS3-202ENST00000460120 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.99■■□□□ 1.75
HPS3-202ENST00000460120 GRIN2BQ13224 1484 aa25.99■■□□□ 1.75
HPS3-202ENST00000460120 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
HPS3-202ENST00000460120 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.96■■□□□ 1.75
HPS3-202ENST00000460120 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.94■■□□□ 1.74
HPS3-202ENST00000460120 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
HPS3-202ENST00000460120 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HPS3-202ENST00000460120 TONSLQ96HA7 1378 aa25.91■■□□□ 1.74
HPS3-202ENST00000460120 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.9■■□□□ 1.74
HPS3-202ENST00000460120 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
HPS3-202ENST00000460120 TRIM52Q96A61 297 aa25.88■■□□□ 1.73
HPS3-202ENST00000460120 MYT1Q01538 1121 aa25.87■■□□□ 1.73
HPS3-202ENST00000460120 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
HPS3-202ENST00000460120 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.86■■□□□ 1.73
HPS3-202ENST00000460120 HFM1A2PYH4 1435 aa25.86■■□□□ 1.73
HPS3-202ENST00000460120 PBRM1Q86U86 1689 aa25.85■■□□□ 1.73
HPS3-202ENST00000460120 NAIPQ13075 1403 aa25.84■■□□□ 1.73
HPS3-202ENST00000460120 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
HPS3-202ENST00000460120 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.83■■□□□ 1.73
HPS3-202ENST00000460120 IQGAP2Q13576 1575 aa25.82■■□□□ 1.72
HPS3-202ENST00000460120 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.82■■□□□ 1.72
HPS3-202ENST00000460120 FBLN2P98095 1184 aa25.8■■□□□ 1.72
HPS3-202ENST00000460120 UACAQ9BZF9 1416 aa25.8■■□□□ 1.72
HPS3-202ENST00000460120 ADAMTS12P58397 1594 aa25.79■■□□□ 1.72
HPS3-202ENST00000460120 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
HPS3-202ENST00000460120 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.78■■□□□ 1.72
HPS3-202ENST00000460120 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.77■■□□□ 1.72
HPS3-202ENST00000460120 FOXD1Q16676 465 aa25.77■■□□□ 1.72
HPS3-202ENST00000460120 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
HPS3-202ENST00000460120 HECW1Q76N89 1606 aa25.73■■□□□ 1.71
HPS3-202ENST00000460120 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
HPS3-202ENST00000460120 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
HPS3-202ENST00000460120 IFT140Q96RY7 1462 aa25.66■■□□□ 1.7
HPS3-202ENST00000460120 ARHGEF11O15085 1522 aa25.66■■□□□ 1.7
HPS3-202ENST00000460120 ERCC6Q03468 1493 aa25.65■■□□□ 1.7
HPS3-202ENST00000460120 ANP32CO43423 234 aa25.65■■□□□ 1.7
HPS3-202ENST00000460120 WDR62O43379 1518 aa25.65■■□□□ 1.7
HPS3-202ENST00000460120 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
HPS3-202ENST00000460120 KDM6BO15054 1643 aa25.64■■□□□ 1.69
HPS3-202ENST00000460120 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.61■■□□□ 1.69
HPS3-202ENST00000460120 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
HPS3-202ENST00000460120 BCANQ96GW7 911 aa25.6■■□□□ 1.69
HPS3-202ENST00000460120 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
HPS3-202ENST00000460120 DISP1Q96F81 1524 aa25.58■■□□□ 1.69
HPS3-202ENST00000460120 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.56■■□□□ 1.68
HPS3-202ENST00000460120 GRIN2AQ12879 1464 aa25.55■■□□□ 1.68
HPS3-202ENST00000460120 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
HPS3-202ENST00000460120 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
HPS3-202ENST00000460120 KIAA0556O60303 1618 aa25.53■■□□□ 1.68
HPS3-202ENST00000460120 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
HPS3-202ENST00000460120 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
HPS3-202ENST00000460120 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
HPS3-202ENST00000460120 MIA2Q96PC5 1412 aa25.51■■□□□ 1.67
HPS3-202ENST00000460120 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.51■■□□□ 1.67
HPS3-202ENST00000460120 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
HPS3-202ENST00000460120 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms