RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439248.5

TTLL1-203, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL1, Length 1,659 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-203ENST00000439248 GRIN2BQ13224 1484 aa21.38■■□□□ 1.01
TTLL1-203ENST00000439248 PRXQ9BXM0 1461 aa21.38■■□□□ 1.01
TTLL1-203ENST00000439248 OSCARQ8IYS5 282 aa21.37■■□□□ 1.01
TTLL1-203ENST00000439248 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TTLL1-203ENST00000439248 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.36■■□□□ 1.01
TTLL1-203ENST00000439248 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.35■■□□□ 1.01
TTLL1-203ENST00000439248 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TTLL1-203ENST00000439248 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
TTLL1-203ENST00000439248 ADAMTS12P58397 1594 aa21.31■■□□□ 1
TTLL1-203ENST00000439248 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.31■■□□□ 1
TTLL1-203ENST00000439248 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.31■■□□□ 1
TTLL1-203ENST00000439248 APLP2Q06481 763 aa21.3■■□□□ 1
TTLL1-203ENST00000439248 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
TTLL1-203ENST00000439248 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.24■□□□□ 0.99
TTLL1-203ENST00000439248 SYNJ2O15056 1496 aa21.19■□□□□ 0.98
TTLL1-203ENST00000439248 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
TTLL1-203ENST00000439248 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.17■□□□□ 0.98
TTLL1-203ENST00000439248 CHD1O14646 1710 aa21.17■□□□□ 0.98
TTLL1-203ENST00000439248 ARAP1Q96P48 1450 aa21.15■□□□□ 0.98
TTLL1-203ENST00000439248 NEUROD1Q13562 356 aa21.15■□□□□ 0.98
TTLL1-203ENST00000439248 GRIN2AQ12879 1464 aa21.13■□□□□ 0.97
TTLL1-203ENST00000439248 FBLN2P98095 1184 aa21.13■□□□□ 0.97
TTLL1-203ENST00000439248 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
TTLL1-203ENST00000439248 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
TTLL1-203ENST00000439248 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
TTLL1-203ENST00000439248 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
TTLL1-203ENST00000439248 MAP3K1Q13233 1512 aa21.07■□□□□ 0.96
TTLL1-203ENST00000439248 CEP170Q5SW79 1584 aa21.05■□□□□ 0.96
TTLL1-203ENST00000439248 NUP160Q12769 1436 aa21■□□□□ 0.95
TTLL1-203ENST00000439248 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.99■□□□□ 0.95
TTLL1-203ENST00000439248 IQGAP2Q13576 1575 aa20.99■□□□□ 0.95
TTLL1-203ENST00000439248 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
TTLL1-203ENST00000439248 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.96■□□□□ 0.95
TTLL1-203ENST00000439248 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.96■□□□□ 0.95
TTLL1-203ENST00000439248 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.94■□□□□ 0.94
TTLL1-203ENST00000439248 ARHGEF11O15085 1522 aa20.89■□□□□ 0.94
TTLL1-203ENST00000439248 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.89■□□□□ 0.93
TTLL1-203ENST00000439248 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.89■□□□□ 0.93
TTLL1-203ENST00000439248 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.89■□□□□ 0.93
TTLL1-203ENST00000439248 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.89■□□□□ 0.93
TTLL1-203ENST00000439248 SAMD9Q5K651 1589 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL1-203ENST00000439248 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
TTLL1-203ENST00000439248 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL1-203ENST00000439248 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.84■□□□□ 0.93
TTLL1-203ENST00000439248 P3H3Q8IVL6 736 aa20.84■□□□□ 0.93
TTLL1-203ENST00000439248 TIAM1Q13009 1591 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL1-203ENST00000439248 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL1-203ENST00000439248 MIER1Q8N108 512 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL1-203ENST00000439248 SHROOM2Q13796 1616 aa20.81■□□□□ 0.92
TTLL1-203ENST00000439248 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.8■□□□□ 0.92
TTLL1-203ENST00000439248 JPH4Q96JJ6 628 aa20.79■□□□□ 0.92
TTLL1-203ENST00000439248 KIAA0556O60303 1618 aa20.78■□□□□ 0.92
TTLL1-203ENST00000439248 DISP1Q96F81 1524 aa20.78■□□□□ 0.92
TTLL1-203ENST00000439248 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.74■□□□□ 0.91
TTLL1-203ENST00000439248 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.73■□□□□ 0.91
TTLL1-203ENST00000439248 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.91
TTLL1-203ENST00000439248 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
TTLL1-203ENST00000439248 MYT1Q01538 1121 aa20.7■□□□□ 0.91
TTLL1-203ENST00000439248 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.7■□□□□ 0.9
TTLL1-203ENST00000439248 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.68■□□□□ 0.9
TTLL1-203ENST00000439248 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.67■□□□□ 0.9
TTLL1-203ENST00000439248 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
TTLL1-203ENST00000439248 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.65■□□□□ 0.9
TTLL1-203ENST00000439248 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.64■□□□□ 0.89
TTLL1-203ENST00000439248 FMN1Q68DA7 1419 aa20.64■□□□□ 0.89
TTLL1-203ENST00000439248 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL1-203ENST00000439248 MAPKBP1O60336 1514 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL1-203ENST00000439248 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL1-203ENST00000439248 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL1-203ENST00000439248 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TTLL1-203ENST00000439248 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TTLL1-203ENST00000439248 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TTLL1-203ENST00000439248 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.55■□□□□ 0.88
TTLL1-203ENST00000439248 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL1-203ENST00000439248 PTPRGP23470 1445 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL1-203ENST00000439248 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL1-203ENST00000439248 HECW1Q76N89 1606 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL1-203ENST00000439248 ABCA8O94911 1581 aa20.49■□□□□ 0.87
TTLL1-203ENST00000439248 ARID3CA6NKF2 412 aa20.45■□□□□ 0.86
TTLL1-203ENST00000439248 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
TTLL1-203ENST00000439248 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TTLL1-203ENST00000439248 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TTLL1-203ENST00000439248 UACAQ9BZF9 1416 aa20.4■□□□□ 0.86
TTLL1-203ENST00000439248 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.4■□□□□ 0.86
TTLL1-203ENST00000439248 ABCC2Q92887 1545 aa20.38■□□□□ 0.85
TTLL1-203ENST00000439248 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.37■□□□□ 0.85
TTLL1-203ENST00000439248 ITGAEP38570 1179 aa20.36■□□□□ 0.85
TTLL1-203ENST00000439248 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.36■□□□□ 0.85
TTLL1-203ENST00000439248 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.35■□□□□ 0.85
TTLL1-203ENST00000439248 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.33■□□□□ 0.85
TTLL1-203ENST00000439248 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TTLL1-203ENST00000439248 HFM1A2PYH4 1435 aa20.33■□□□□ 0.85
TTLL1-203ENST00000439248 ATP10BO94823 1461 aa20.33■□□□□ 0.84
TTLL1-203ENST00000439248 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TTLL1-203ENST00000439248 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.3■□□□□ 0.84
TTLL1-203ENST00000439248 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TTLL1-203ENST00000439248 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.29■□□□□ 0.84
TTLL1-203ENST00000439248 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TTLL1-203ENST00000439248 CCER2I3L3R5 266 aa20.27■□□□□ 0.84
TTLL1-203ENST00000439248 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms