RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438055.5

TTC3-209, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTC3, Length 3,606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-209ENST00000438055 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.01■■□□□ 1.43
TTC3-209ENST00000438055 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TTC3-209ENST00000438055 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24■■□□□ 1.43
TTC3-209ENST00000438055 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.98■■□□□ 1.43
TTC3-209ENST00000438055 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
TTC3-209ENST00000438055 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.93■■□□□ 1.42
TTC3-209ENST00000438055 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.93■■□□□ 1.42
TTC3-209ENST00000438055 NESP48681 1621 aa23.92■■□□□ 1.42
TTC3-209ENST00000438055 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TTC3-209ENST00000438055 ARID3CA6NKF2 412 aa23.9■■□□□ 1.42
TTC3-209ENST00000438055 TIAM1Q13009 1591 aa23.9■■□□□ 1.42
TTC3-209ENST00000438055 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.9■■□□□ 1.42
TTC3-209ENST00000438055 KCNH8Q96L42 1107 aa23.85■■□□□ 1.41
TTC3-209ENST00000438055 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
TTC3-209ENST00000438055 TOPBP1Q92547 1522 aa23.79■■□□□ 1.4
TTC3-209ENST00000438055 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.78■■□□□ 1.4
TTC3-209ENST00000438055 TONSLQ96HA7 1378 aa23.76■■□□□ 1.39
TTC3-209ENST00000438055 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
TTC3-209ENST00000438055 TRIM52Q96A61 297 aa23.75■■□□□ 1.39
TTC3-209ENST00000438055 BCANQ96GW7 911 aa23.75■■□□□ 1.39
TTC3-209ENST00000438055 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.72■■□□□ 1.39
TTC3-209ENST00000438055 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
TTC3-209ENST00000438055 FMN1Q68DA7 1419 aa23.72■■□□□ 1.39
TTC3-209ENST00000438055 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.71■■□□□ 1.39
TTC3-209ENST00000438055 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.71■■□□□ 1.39
TTC3-209ENST00000438055 MAP3K1Q13233 1512 aa23.71■■□□□ 1.39
TTC3-209ENST00000438055 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.7■■□□□ 1.39
TTC3-209ENST00000438055 MAPKBP1O60336 1514 aa23.7■■□□□ 1.38
TTC3-209ENST00000438055 ANP32CO43423 234 aa23.7■■□□□ 1.38
TTC3-209ENST00000438055 PRDM2Q13029 1718 aa23.69■■□□□ 1.38
TTC3-209ENST00000438055 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.68■■□□□ 1.38
TTC3-209ENST00000438055 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
TTC3-209ENST00000438055 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.65■■□□□ 1.38
TTC3-209ENST00000438055 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.62■■□□□ 1.37
TTC3-209ENST00000438055 WDR97A6NE52 1622 aa23.62■■□□□ 1.37
TTC3-209ENST00000438055 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC3-209ENST00000438055 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC3-209ENST00000438055 NEFLP07196 543 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC3-209ENST00000438055 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC3-209ENST00000438055 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC3-209ENST00000438055 FKBP8Q14318 412 aa23.56■■□□□ 1.36
TTC3-209ENST00000438055 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
TTC3-209ENST00000438055 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.54■■□□□ 1.36
TTC3-209ENST00000438055 NCOA2Q15596 1464 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC3-209ENST00000438055 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC3-209ENST00000438055 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.352e-7■■■□□ 15.5
TTC3-209ENST00000438055 CUL7Q14999 1698 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC3-209ENST00000438055 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC3-209ENST00000438055 PTPRKQ15262 1439 aa23.45■■□□□ 1.35
TTC3-209ENST00000438055 FOXD1Q16676 465 aa23.45■■□□□ 1.34
TTC3-209ENST00000438055 FBLN2P98095 1184 aa23.44■■□□□ 1.34
TTC3-209ENST00000438055 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TTC3-209ENST00000438055 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.343e-9■■■■□ 21.4
TTC3-209ENST00000438055 UACAQ9BZF9 1416 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC3-209ENST00000438055 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC3-209ENST00000438055 HFM1A2PYH4 1435 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC3-209ENST00000438055 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.39■■□□□ 1.34
TTC3-209ENST00000438055 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TTC3-209ENST00000438055 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC3-209ENST00000438055 NAIPQ13075 1403 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC3-209ENST00000438055 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC3-209ENST00000438055 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
TTC3-209ENST00000438055 CCER2I3L3R5 266 aa23.35■■□□□ 1.33
TTC3-209ENST00000438055 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TTC3-209ENST00000438055 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.323e-6■■■□□ 15.8
TTC3-209ENST00000438055 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.32■■□□□ 1.32
TTC3-209ENST00000438055 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
TTC3-209ENST00000438055 MYT1Q01538 1121 aa23.31■■□□□ 1.32
TTC3-209ENST00000438055 GRIN2BQ13224 1484 aa23.3■■□□□ 1.32
TTC3-209ENST00000438055 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
TTC3-209ENST00000438055 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TTC3-209ENST00000438055 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.29■■□□□ 1.32
TTC3-209ENST00000438055 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC3-209ENST00000438055 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC3-209ENST00000438055 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC3-209ENST00000438055 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TTC3-209ENST00000438055 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TTC3-209ENST00000438055 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TTC3-209ENST00000438055 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TTC3-209ENST00000438055 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TTC3-209ENST00000438055 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC3-209ENST00000438055 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC3-209ENST00000438055 SAMD9Q5K651 1589 aa23.19■■□□□ 1.3
TTC3-209ENST00000438055 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
TTC3-209ENST00000438055 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
TTC3-209ENST00000438055 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.17■■□□□ 1.3
TTC3-209ENST00000438055 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.16■■□□□ 1.3
TTC3-209ENST00000438055 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.15■■□□□ 1.3
TTC3-209ENST00000438055 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.15■■□□□ 1.3
TTC3-209ENST00000438055 IQGAP2Q13576 1575 aa23.14■■□□□ 1.29
TTC3-209ENST00000438055 MRS2Q9HD23 443 aa23.13■■□□□ 1.29
TTC3-209ENST00000438055 HECW1Q76N89 1606 aa23.12■■□□□ 1.29
TTC3-209ENST00000438055 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
TTC3-209ENST00000438055 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
TTC3-209ENST00000438055 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC3-209ENST00000438055 MIA2Q96PC5 1412 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC3-209ENST00000438055 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC3-209ENST00000438055 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC3-209ENST00000438055 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TTC3-209ENST00000438055 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
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