RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 ARAP1Q96P48 1450 aa19.48■□□□□ 0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 CFTRP13569 1480 aa19.47■□□□□ 0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.47■□□□□ 0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.45■□□□□ 0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.45■□□□□ 0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.44■□□□□ 0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 TOP2BQ02880 1626 aa19.43■□□□□ 0.7
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RABGEF1-210ENST00000437078 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
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RABGEF1-210ENST00000437078 HMGXB3Q12766 1538 aa19.32■□□□□ 0.68
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RABGEF1-210ENST00000437078 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.1■□□□□ 0.65
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RABGEF1-210ENST00000437078 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.07■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 16.6
RABGEF1-210ENST00000437078 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
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RABGEF1-210ENST00000437078 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
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RABGEF1-210ENST00000437078 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
RABGEF1-210ENST00000437078 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.96■□□□□ 0.63
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RABGEF1-210ENST00000437078 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
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RABGEF1-210ENST00000437078 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.93■□□□□ 0.62
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RABGEF1-210ENST00000437078 TSPY10P0CW01 314 aa18.86■□□□□ 0.61
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
RABGEF1-210ENST00000437078 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.84■□□□□ 0.61
RABGEF1-210ENST00000437078 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.84■□□□□ 0.61
RABGEF1-210ENST00000437078 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
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RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.81■□□□□ 0.6
RABGEF1-210ENST00000437078 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
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RABGEF1-210ENST00000437078 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 NUP155O75694 1391 aa18.63■□□□□ 0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.61■□□□□ 0.57
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RABGEF1-210ENST00000437078 NAIPQ13075 1403 aa18.6■□□□□ 0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.6■□□□□ 0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.58■□□□□ 0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
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