RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GOLGA3Q08378 1498 aa15.78■□□□□ 0.12
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.11
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.77■□□□□ 0.11
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRXQ9BXM0 1461 aa15.76■□□□□ 0.11
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.75■□□□□ 0.11
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.73■□□□□ 0.11
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.73■□□□□ 0.11
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.69■□□□□ 0.1
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADAMTS12P58397 1594 aa15.69■□□□□ 0.1
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.67■□□□□ 0.1
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CEP162Q5TB80 1403 aa15.66■□□□□ 0.1
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SYNJ2O15056 1496 aa15.62■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.58■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GRIN2AQ12879 1464 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FBLN2P98095 1184 aa15.53■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLIP1P30622 1438 aa15.52■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHD1O14646 1710 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IQGAP2Q13576 1575 aa15.47■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.47■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NUP160Q12769 1436 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CEP170Q5SW79 1584 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCGF6Q9BYE7 350 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARAP1Q96P48 1450 aa15.4■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SAMD9Q5K651 1589 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.34■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 JPH4Q96JJ6 628 aa15.32■□□□□ 0.04
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.32■□□□□ 0.04
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OSCARQ8IYS5 282 aa15.31■□□□□ 0.04
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIAA0556O60303 1618 aa15.3■□□□□ 0.04
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FMN1Q68DA7 1419 aa15.3■□□□□ 0.04
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SHROOM2Q13796 1616 aa15.3■□□□□ 0.04
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.28■□□□□ 0.04
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 P3H3Q8IVL6 736 aa15.27■□□□□ 0.03
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DISP1Q96F81 1524 aa15.27■□□□□ 0.03
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 APLP2Q06481 763 aa15.24■□□□□ 0.03
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.21■□□□□ 0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.19■□□□□ 0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HECW1Q76N89 1606 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTPRGP23470 1445 aa15.15■□□□□ 0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAP3K1Q13233 1512 aa15.14■□□□□ 0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.14■□□□□ 0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.13■□□□□ 0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.11■□□□□ 0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.1■□□□□ 0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TIAM1Q13009 1591 aa15.1■□□□□ 0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCA8O94911 1581 aa15.09■□□□□ 0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UACAQ9BZF9 1416 aa15.07■□□□□ 0
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.06■□□□□ 0
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.04■□□□□ -0
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HRCP23327 699 aa15.04■□□□□ -0
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCC2Q92887 1545 aa15.04■□□□□ -0
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARHGEF11O15085 1522 aa15.03■□□□□ -0
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.02■□□□□ -0
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.02□□□□□ -0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MTUS2Q5JR59 1369 aa15□□□□□ -0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATP10BO94823 1461 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARID3CA6NKF2 412 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.9□□□□□ -0.02
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF14Q15058 1648 aa14.88□□□□□ -0.03
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms