RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412349.6

ROR1-AS1-201, ROR1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ROR1-AS1, Length 1,574 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1-AS1-201ENST00000412349 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
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ROR1-AS1-201ENST00000412349 CCDC88BA6NC98 1476 aa12.15□□□□□ -0.46
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ROR1-AS1-201ENST00000412349 NESP48681 1621 aa11.98□□□□□ -0.49
ROR1-AS1-201ENST00000412349 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.97□□□□□ -0.49
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ROR1-AS1-201ENST00000412349 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.88□□□□□ -0.51
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ROR1-AS1-201ENST00000412349 LHX8Q68G74 356 aa11.7□□□□□ -0.54
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ROR1-AS1-201ENST00000412349 CEP164Q9UPV0 1460 aa11.69□□□□□ -0.54
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ROR1-AS1-201ENST00000412349 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.64□□□□□ -0.55
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ROR1-AS1-201ENST00000412349 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa11.63□□□□□ -0.55
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ROR1-AS1-201ENST00000412349 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.61□□□□□ -0.55
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ROR1-AS1-201ENST00000412349 ERCC6Q03468 1493 aa11.6□□□□□ -0.55
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ROR1-AS1-201ENST00000412349 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
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ROR1-AS1-201ENST00000412349 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.37□□□□□ -0.59
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ROR1-AS1-201ENST00000412349 POTEB2H3BUK9 544 aa11.32□□□□□ -0.6
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ROR1-AS1-201ENST00000412349 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.31□□□□□ -0.6
ROR1-AS1-201ENST00000412349 ADAMTS12P58397 1594 aa11.3□□□□□ -0.6
ROR1-AS1-201ENST00000412349 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.29□□□□□ -0.6
ROR1-AS1-201ENST00000412349 GRIN2BQ13224 1484 aa11.29□□□□□ -0.6
ROR1-AS1-201ENST00000412349 OTUD5Q96G74 571 aa11.28□□□□□ -0.6
ROR1-AS1-201ENST00000412349 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa11.28□□□□□ -0.6
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ROR1-AS1-201ENST00000412349 C7P10643 843 aa11.27□□□□□ -0.61
ROR1-AS1-201ENST00000412349 SLC39A7Q92504 469 aa11.27□□□□□ -0.61
ROR1-AS1-201ENST00000412349 METRNQ9UJH8 293 aa11.27□□□□□ -0.61
ROR1-AS1-201ENST00000412349 MAP3K13O43283 966 aa11.25□□□□□ -0.61
ROR1-AS1-201ENST00000412349 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
ROR1-AS1-201ENST00000412349 GOLGA3Q08378 1498 aa11.24□□□□□ -0.61
ROR1-AS1-201ENST00000412349 CHD1O14646 1710 aa11.23□□□□□ -0.61
ROR1-AS1-201ENST00000412349 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
ROR1-AS1-201ENST00000412349 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.21□□□□□ -0.61
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