RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409109.5

NLRX1-202, Transcript of NLR family member X1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NLRX1, Length 4,092 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1-202ENST00000409109 SMARCA2P51531 1590 aa21.77■■□□□ 1.08
NLRX1-202ENST00000409109 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.74■■□□□ 1.07
NLRX1-202ENST00000409109 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.73■■□□□ 1.07
NLRX1-202ENST00000409109 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
NLRX1-202ENST00000409109 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.68■■□□□ 1.06
NLRX1-202ENST00000409109 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.67■■□□□ 1.06
NLRX1-202ENST00000409109 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.61■■□□□ 1.05
NLRX1-202ENST00000409109 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NLRX1-202ENST00000409109 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.59■■□□□ 1.05
NLRX1-202ENST00000409109 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NLRX1-202ENST00000409109 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.56■■□□□ 1.04
NLRX1-202ENST00000409109 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NLRX1-202ENST00000409109 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.55■■□□□ 1.04
NLRX1-202ENST00000409109 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
NLRX1-202ENST00000409109 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NLRX1-202ENST00000409109 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.52■■□□□ 1.04
NLRX1-202ENST00000409109 TONSLQ96HA7 1378 aa21.5■■□□□ 1.03
NLRX1-202ENST00000409109 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NLRX1-202ENST00000409109 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.46■■□□□ 1.03
NLRX1-202ENST00000409109 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.46■■□□□ 1.03
NLRX1-202ENST00000409109 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
NLRX1-202ENST00000409109 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
NLRX1-202ENST00000409109 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NLRX1-202ENST00000409109 SYNJ1O43426 1573 aa21.42■■□□□ 1.02
NLRX1-202ENST00000409109 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NLRX1-202ENST00000409109 FOXD1Q16676 465 aa21.4■■□□□ 1.02
NLRX1-202ENST00000409109 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.4■■□□□ 1.02
NLRX1-202ENST00000409109 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.39■■□□□ 1.02
NLRX1-202ENST00000409109 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
NLRX1-202ENST00000409109 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
NLRX1-202ENST00000409109 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
NLRX1-202ENST00000409109 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.36■■□□□ 1.01
NLRX1-202ENST00000409109 IGF1RP08069 1367 aa21.33■■□□□ 1.01
NLRX1-202ENST00000409109 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.33■■□□□ 1.01
NLRX1-202ENST00000409109 NCAPD3P42695 1498 aa21.33■■□□□ 1
NLRX1-202ENST00000409109 MSH5O43196 834 aa21.31■■□□□ 1
NLRX1-202ENST00000409109 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
NLRX1-202ENST00000409109 MRS2Q9HD23 443 aa21.3■■□□□ 1
NLRX1-202ENST00000409109 NESP48681 1621 aa21.29■■□□□ 1
NLRX1-202ENST00000409109 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
NLRX1-202ENST00000409109 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.27■■□□□ 1
NLRX1-202ENST00000409109 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.27■■□□□ 1
NLRX1-202ENST00000409109 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.27■■□□□ 1
NLRX1-202ENST00000409109 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
NLRX1-202ENST00000409109 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.23■□□□□ 0.99
NLRX1-202ENST00000409109 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.23■□□□□ 0.99
NLRX1-202ENST00000409109 ERCC6Q03468 1493 aa21.23■□□□□ 0.99
NLRX1-202ENST00000409109 RGL3Q3MIN7 710 aa21.22■□□□□ 0.99
NLRX1-202ENST00000409109 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
NLRX1-202ENST00000409109 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.21■□□□□ 0.99
NLRX1-202ENST00000409109 CCER2I3L3R5 266 aa21.21■□□□□ 0.99
NLRX1-202ENST00000409109 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
NLRX1-202ENST00000409109 TSPY4P0CV99 314 aa21.19■□□□□ 0.98
NLRX1-202ENST00000409109 TSPY10P0CW01 314 aa21.19■□□□□ 0.98
NLRX1-202ENST00000409109 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
NLRX1-202ENST00000409109 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.18■□□□□ 0.98
NLRX1-202ENST00000409109 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.17■□□□□ 0.98
NLRX1-202ENST00000409109 ARAP1Q96P48 1450 aa21.16■□□□□ 0.98
NLRX1-202ENST00000409109 KIF21BO75037 1637 aa21.16■□□□□ 0.98
NLRX1-202ENST00000409109 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
NLRX1-202ENST00000409109 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.14■□□□□ 0.97
NLRX1-202ENST00000409109 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.13■□□□□ 0.97
NLRX1-202ENST00000409109 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
NLRX1-202ENST00000409109 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.12■□□□□ 0.97
NLRX1-202ENST00000409109 CUX1P39880 1505 aa21.11■□□□□ 0.97
NLRX1-202ENST00000409109 CFTRP13569 1480 aa21.09■□□□□ 0.97
NLRX1-202ENST00000409109 HMGXB3Q12766 1538 aa21.07■□□□□ 0.96
NLRX1-202ENST00000409109 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
NLRX1-202ENST00000409109 NEFMP07197 916 aa21.07■□□□□ 0.96
NLRX1-202ENST00000409109 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
NLRX1-202ENST00000409109 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.04■□□□□ 0.96
NLRX1-202ENST00000409109 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.04■□□□□ 0.96
NLRX1-202ENST00000409109 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.96
NLRX1-202ENST00000409109 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
NLRX1-202ENST00000409109 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
NLRX1-202ENST00000409109 PRXQ9BXM0 1461 aa20.99■□□□□ 0.95
NLRX1-202ENST00000409109 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.99■□□□□ 0.95
NLRX1-202ENST00000409109 ARXQ96QS3 562 aa20.97■□□□□ 0.95
NLRX1-202ENST00000409109 TMC1Q8TDI8 760 aa20.94■□□□□ 0.94
NLRX1-202ENST00000409109 FMN1Q68DA7 1419 aa20.93■□□□□ 0.94
NLRX1-202ENST00000409109 TOP2BQ02880 1626 aa20.93■□□□□ 0.94
NLRX1-202ENST00000409109 JPH4Q96JJ6 628 aa20.93■□□□□ 0.94
NLRX1-202ENST00000409109 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.93■□□□□ 0.94
NLRX1-202ENST00000409109 IL27Q8NEV9 243 aa20.92■□□□□ 0.94
NLRX1-202ENST00000409109 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
NLRX1-202ENST00000409109 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
NLRX1-202ENST00000409109 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.9■□□□□ 0.94
NLRX1-202ENST00000409109 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.94
NLRX1-202ENST00000409109 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.89■□□□□ 0.93
NLRX1-202ENST00000409109 PKD2Q13563 968 aa20.89■□□□□ 0.93
NLRX1-202ENST00000409109 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.86■□□□□ 0.93
NLRX1-202ENST00000409109 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.85■□□□□ 0.93
NLRX1-202ENST00000409109 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
NLRX1-202ENST00000409109 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.84■□□□□ 0.93
NLRX1-202ENST00000409109 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
NLRX1-202ENST00000409109 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.82■□□□□ 0.92
NLRX1-202ENST00000409109 CCDC184Q52MB2 194 aa20.79■□□□□ 0.92
NLRX1-202ENST00000409109 TOPBP1Q92547 1522 aa20.79■□□□□ 0.92
NLRX1-202ENST00000409109 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.78■□□□□ 0.92
NLRX1-202ENST00000409109 WDR97A6NE52 1622 aa20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms