RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408953.3

ZBED8-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED8, Length 2,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8-201ENST00000408953 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
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ZBED8-201ENST00000408953 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
ZBED8-201ENST00000408953 NEFLP07196 543 aa18.78■□□□□ 0.6
ZBED8-201ENST00000408953 TIAM1Q13009 1591 aa18.76■□□□□ 0.59
ZBED8-201ENST00000408953 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
ZBED8-201ENST00000408953 ANP32CO43423 234 aa18.73■□□□□ 0.59
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ZBED8-201ENST00000408953 IGF1RP08069 1367 aa18.73■□□□□ 0.59
ZBED8-201ENST00000408953 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.73■□□□□ 0.59
ZBED8-201ENST00000408953 BCL11AQ9H165 835 aa18.72■□□□□ 0.59
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ZBED8-201ENST00000408953 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.67■□□□□ 0.58
ZBED8-201ENST00000408953 CFTRP13569 1480 aa18.66■□□□□ 0.58
ZBED8-201ENST00000408953 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.66■□□□□ 0.58
ZBED8-201ENST00000408953 NCAPD3P42695 1498 aa18.65■□□□□ 0.58
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ZBED8-201ENST00000408953 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.58■□□□□ 0.56
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ZBED8-201ENST00000408953 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
ZBED8-201ENST00000408953 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.56
ZBED8-201ENST00000408953 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.54■□□□□ 0.56
ZBED8-201ENST00000408953 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.5■□□□□ 0.55
ZBED8-201ENST00000408953 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.5■□□□□ 0.55
ZBED8-201ENST00000408953 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.45■□□□□ 0.54
ZBED8-201ENST00000408953 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
ZBED8-201ENST00000408953 PTPRKQ15262 1439 aa18.45■□□□□ 0.54
ZBED8-201ENST00000408953 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
ZBED8-201ENST00000408953 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.44■□□□□ 0.54
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ZBED8-201ENST00000408953 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED8-201ENST00000408953 UACAQ9BZF9 1416 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED8-201ENST00000408953 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED8-201ENST00000408953 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED8-201ENST00000408953 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.39■□□□□ 0.53
ZBED8-201ENST00000408953 HFM1A2PYH4 1435 aa18.38■□□□□ 0.53
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ZBED8-201ENST00000408953 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.53
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ZBED8-201ENST00000408953 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.37■□□□□ 0.53
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ZBED8-201ENST00000408953 NAIPQ13075 1403 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED8-201ENST00000408953 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.34■□□□□ 0.53
ZBED8-201ENST00000408953 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.34■□□□□ 0.53
ZBED8-201ENST00000408953 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.34■□□□□ 0.53
ZBED8-201ENST00000408953 PRDM2Q13029 1718 aa18.33■□□□□ 0.52
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ZBED8-201ENST00000408953 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED8-201ENST00000408953 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED8-201ENST00000408953 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED8-201ENST00000408953 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED8-201ENST00000408953 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED8-201ENST00000408953 FMN1Q68DA7 1419 aa18.29■□□□□ 0.52
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ZBED8-201ENST00000408953 NCOA2Q15596 1464 aa18.26■□□□□ 0.51
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ZBED8-201ENST00000408953 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.25■□□□□ 0.51
ZBED8-201ENST00000408953 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
ZBED8-201ENST00000408953 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.24■□□□□ 0.51
ZBED8-201ENST00000408953 MRS2Q9HD23 443 aa18.23■□□□□ 0.51
ZBED8-201ENST00000408953 FOXD1Q16676 465 aa18.23■□□□□ 0.51
ZBED8-201ENST00000408953 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.22■□□□□ 0.51
ZBED8-201ENST00000408953 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.21■□□□□ 0.51
ZBED8-201ENST00000408953 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.21■□□□□ 0.51
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ZBED8-201ENST00000408953 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.5
ZBED8-201ENST00000408953 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.17■□□□□ 0.5
ZBED8-201ENST00000408953 CCDC7Q96M83 1385 aa18.17■□□□□ 0.5
ZBED8-201ENST00000408953 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.17■□□□□ 0.5
ZBED8-201ENST00000408953 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.16■□□□□ 0.5
ZBED8-201ENST00000408953 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.16■□□□□ 0.5
ZBED8-201ENST00000408953 TOPBP1Q92547 1522 aa18.15■□□□□ 0.5
ZBED8-201ENST00000408953 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
ZBED8-201ENST00000408953 GRIN2BQ13224 1484 aa18.14■□□□□ 0.49
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ZBED8-201ENST00000408953 NCOA1Q15788 1441 aa18.13■□□□□ 0.49
ZBED8-201ENST00000408953 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.13■□□□□ 0.49
ZBED8-201ENST00000408953 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.13■□□□□ 0.49
ZBED8-201ENST00000408953 KDM6BO15054 1643 aa18.13■□□□□ 0.49
ZBED8-201ENST00000408953 CUL7Q14999 1698 aa18.12■□□□□ 0.49
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ZBED8-201ENST00000408953 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
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ZBED8-201ENST00000408953 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.09■□□□□ 0.49
ZBED8-201ENST00000408953 ARID3CA6NKF2 412 aa18.09■□□□□ 0.49
ZBED8-201ENST00000408953 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
ZBED8-201ENST00000408953 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.09■□□□□ 0.49
ZBED8-201ENST00000408953 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.09■□□□□ 0.49
ZBED8-201ENST00000408953 NBR1Q14596 966 aa18.09■□□□□ 0.49
ZBED8-201ENST00000408953 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.09■□□□□ 0.49
ZBED8-201ENST00000408953 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ZBED8-201ENST00000408953 SAMD9Q5K651 1589 aa18.08■□□□□ 0.48
ZBED8-201ENST00000408953 NESP48681 1621 aa18.07■□□□□ 0.48
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