RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

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Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 HMGXB3Q12766 1538 aa30.88■■■□□ 2.53
CLDN5-201ENST00000403084 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.85■■■□□ 2.53
CLDN5-201ENST00000403084 ITGAEP38570 1179 aa30.83■■■□□ 2.53
CLDN5-201ENST00000403084 TRIM52Q96A61 297 aa30.74■■■□□ 2.51
CLDN5-201ENST00000403084 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.73■■■□□ 2.51
CLDN5-201ENST00000403084 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.71■■■□□ 2.51
CLDN5-201ENST00000403084 ANP32CO43423 234 aa30.7■■■□□ 2.5
CLDN5-201ENST00000403084 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.67■■■□□ 2.5
CLDN5-201ENST00000403084 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.65■■■□□ 2.5
CLDN5-201ENST00000403084 MAP3K1Q13233 1512 aa30.64■■■□□ 2.5
CLDN5-201ENST00000403084 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.62■■■□□ 2.49
CLDN5-201ENST00000403084 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.61■■■□□ 2.49
CLDN5-201ENST00000403084 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
CLDN5-201ENST00000403084 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.6■■■□□ 2.49
CLDN5-201ENST00000403084 TIAM1Q13009 1591 aa30.59■■■□□ 2.49
CLDN5-201ENST00000403084 KIF27Q86VH2 1401 aa30.48■■■□□ 2.47
CLDN5-201ENST00000403084 ERICH6BQ5W0A0 696 aa30.48■■■□□ 2.47
CLDN5-201ENST00000403084 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
CLDN5-201ENST00000403084 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.44■■■□□ 2.46
CLDN5-201ENST00000403084 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.4■■■□□ 2.46
CLDN5-201ENST00000403084 CUX1P39880 1505 aa30.38■■■□□ 2.45
CLDN5-201ENST00000403084 CFTRP13569 1480 aa30.37■■■□□ 2.45
CLDN5-201ENST00000403084 DEKP35659 375 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
CLDN5-201ENST00000403084 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.33■■■□□ 2.45
CLDN5-201ENST00000403084 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.33■■■□□ 2.45
CLDN5-201ENST00000403084 PPP4R2Q9NY27 417 aa30.32■■■□□ 2.44
CLDN5-201ENST00000403084 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
CLDN5-201ENST00000403084 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
CLDN5-201ENST00000403084 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
CLDN5-201ENST00000403084 TONSLQ96HA7 1378 aa30.23■■■□□ 2.43
CLDN5-201ENST00000403084 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
CLDN5-201ENST00000403084 PRDM2Q13029 1718 aa30.2■■■□□ 2.43
CLDN5-201ENST00000403084 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.19■■■□□ 2.42
CLDN5-201ENST00000403084 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.17■■■□□ 2.42
CLDN5-201ENST00000403084 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
CLDN5-201ENST00000403084 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CLDN5-201ENST00000403084 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.1■■■□□ 2.41
CLDN5-201ENST00000403084 UACAQ9BZF9 1416 aa30.06■■■□□ 2.4
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.06■■■□□ 2.4
CLDN5-201ENST00000403084 IGF1RP08069 1367 aa30.05■■■□□ 2.4
CLDN5-201ENST00000403084 NCOA2Q15596 1464 aa30.03■■■□□ 2.4
CLDN5-201ENST00000403084 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa30.01■■■□□ 2.39
CLDN5-201ENST00000403084 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.99■■■□□ 2.39
CLDN5-201ENST00000403084 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.97■■■□□ 2.39
CLDN5-201ENST00000403084 HFM1A2PYH4 1435 aa29.97■■■□□ 2.39
CLDN5-201ENST00000403084 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CLDN5-201ENST00000403084 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.95■■■□□ 2.39
CLDN5-201ENST00000403084 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.95■■■□□ 2.39
CLDN5-201ENST00000403084 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.95■■■□□ 2.39
CLDN5-201ENST00000403084 NBR1Q14596 966 aa29.93■■■□□ 2.38
CLDN5-201ENST00000403084 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.93■■■□□ 2.38
CLDN5-201ENST00000403084 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.92■■■□□ 2.38
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC184Q52MB2 194 aa29.89■■■□□ 2.38
CLDN5-201ENST00000403084 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
CLDN5-201ENST00000403084 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.88■■■□□ 2.37
CLDN5-201ENST00000403084 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.86■■■□□ 2.37
CLDN5-201ENST00000403084 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.85■■■□□ 2.37
CLDN5-201ENST00000403084 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.84■■■□□ 2.37
CLDN5-201ENST00000403084 PTPRKQ15262 1439 aa29.84■■■□□ 2.37
CLDN5-201ENST00000403084 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
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CLDN5-201ENST00000403084 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CLDN5-201ENST00000403084 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.8■■■□□ 2.36
CLDN5-201ENST00000403084 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
CLDN5-201ENST00000403084 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CLDN5-201ENST00000403084 NESP48681 1621 aa29.76■■■□□ 2.36
CLDN5-201ENST00000403084 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.76■■■□□ 2.36
CLDN5-201ENST00000403084 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.76■■■□□ 2.35
CLDN5-201ENST00000403084 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.76■■■□□ 2.35
CLDN5-201ENST00000403084 NCOA1Q15788 1441 aa29.75■■■□□ 2.35
CLDN5-201ENST00000403084 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CLDN5-201ENST00000403084 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.75■■■□□ 2.35
CLDN5-201ENST00000403084 MRS2Q9HD23 443 aa29.74■■■□□ 2.35
CLDN5-201ENST00000403084 FMN1Q68DA7 1419 aa29.73■■■□□ 2.35
CLDN5-201ENST00000403084 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CLDN5-201ENST00000403084 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC7Q96M83 1385 aa29.71■■■□□ 2.35
CLDN5-201ENST00000403084 P3H3Q8IVL6 736 aa29.7■■■□□ 2.35
CLDN5-201ENST00000403084 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.69■■■□□ 2.34
CLDN5-201ENST00000403084 HECW1Q76N89 1606 aa29.69■■■□□ 2.34
CLDN5-201ENST00000403084 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
CLDN5-201ENST00000403084 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.66■■■□□ 2.34
CLDN5-201ENST00000403084 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
CLDN5-201ENST00000403084 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.64■■■□□ 2.34
CLDN5-201ENST00000403084 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
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CLDN5-201ENST00000403084 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
CLDN5-201ENST00000403084 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
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CLDN5-201ENST00000403084 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.61■■■□□ 2.33
CLDN5-201ENST00000403084 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.61■■■□□ 2.33
CLDN5-201ENST00000403084 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.6■■■□□ 2.33
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.6■■■□□ 2.33
CLDN5-201ENST00000403084 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.57■■■□□ 2.32
CLDN5-201ENST00000403084 TOPBP1Q92547 1522 aa29.57■■■□□ 2.32
CLDN5-201ENST00000403084 NUDCQ9Y266 331 aa29.57■■■□□ 2.32
CLDN5-201ENST00000403084 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.56■■■□□ 2.32
CLDN5-201ENST00000403084 IL27Q8NEV9 243 aa29.54■■■□□ 2.32
CLDN5-201ENST00000403084 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.53■■■□□ 2.32
CLDN5-201ENST00000403084 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.53■■■□□ 2.32
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