RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 NEFMP07197 916 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 NEUROD1Q13562 356 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 BECN1Q14457 450 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 HMGXB3Q12766 1538 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 DEKP35659 375 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 P3H3Q8IVL6 736 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 ITGAEP38570 1179 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 PRXQ9BXM0 1461 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 CUX1P39880 1505 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 MSNP26038 577 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 CUX2O14529 1486 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 SYNJ1O43426 1573 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 CEP162Q5TB80 1403 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 EEA1Q15075 1411 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 APPP05067 770 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 KIF27Q86VH2 1401 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 CLIP1P30622 1438 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 TOPBP1Q92547 1522 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 SETQ01105 290 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 GOLGA3Q08378 1498 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARID3CA6NKF2 412 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 NRDCO43847 1150 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 FBLN2P98095 1184 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARAP1Q96P48 1450 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYH10P35580 1976 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 USP35Q9P2H5 1018 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 VPS8Q8N3P4 1428 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRIM52Q96A61 297 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARID3AQ99856 593 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 JPH4Q96JJ6 628 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 TOP2BQ02880 1626 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYO10Q9HD67 2058 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 CASC1Q6TDU7 716 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 MIER1Q8N108 512 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 DRC7Q8IY82 874 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMC1Q8TDI8 760 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 PLCB2Q00722 1185 aa7.11□□□□□ -1.27
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