RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381218.8

ZBED1-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 2,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-201ENST00000381218 PRDM2Q13029 1718 aa22.35■■□□□ 1.17
ZBED1-201ENST00000381218 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.28■■□□□ 1.16
ZBED1-201ENST00000381218 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.27■■□□□ 1.15
ZBED1-201ENST00000381218 ARID3CA6NKF2 412 aa22.25■■□□□ 1.15
ZBED1-201ENST00000381218 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.25■■□□□ 1.15
ZBED1-201ENST00000381218 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.22■■□□□ 1.15
ZBED1-201ENST00000381218 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.21■■□□□ 1.15
ZBED1-201ENST00000381218 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.18■■□□□ 1.14
ZBED1-201ENST00000381218 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.18■■□□□ 1.14
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ZBED1-201ENST00000381218 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
ZBED1-201ENST00000381218 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.14■■□□□ 1.14
ZBED1-201ENST00000381218 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.12■■□□□ 1.13
ZBED1-201ENST00000381218 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.07■■□□□ 1.12
ZBED1-201ENST00000381218 FBLN2P98095 1184 aa22.05■■□□□ 1.12
ZBED1-201ENST00000381218 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ZBED1-201ENST00000381218 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
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ZBED1-201ENST00000381218 ERCC6Q03468 1493 aa22■■□□□ 1.11
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ZBED1-201ENST00000381218 BCANQ96GW7 911 aa21.93■■□□□ 1.1
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ZBED1-201ENST00000381218 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.91■■□□□ 1.1
ZBED1-201ENST00000381218 MAP3K1Q13233 1512 aa21.9■■□□□ 1.1
ZBED1-201ENST00000381218 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.9■■□□□ 1.1
ZBED1-201ENST00000381218 TIAM1Q13009 1591 aa21.89■■□□□ 1.1
ZBED1-201ENST00000381218 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.89■■□□□ 1.09
ZBED1-201ENST00000381218 WDR97A6NE52 1622 aa21.88■■□□□ 1.09
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ZBED1-201ENST00000381218 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.85■■□□□ 1.09
ZBED1-201ENST00000381218 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.83■■□□□ 1.09
ZBED1-201ENST00000381218 KCNH8Q96L42 1107 aa21.82■■□□□ 1.08
ZBED1-201ENST00000381218 CUL7Q14999 1698 aa21.8■■□□□ 1.08
ZBED1-201ENST00000381218 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.75■■□□□ 1.07
ZBED1-201ENST00000381218 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.74■■□□□ 1.07
ZBED1-201ENST00000381218 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ZBED1-201ENST00000381218 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.73■■□□□ 1.07
ZBED1-201ENST00000381218 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.72■■□□□ 1.07
ZBED1-201ENST00000381218 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.72■■□□□ 1.07
ZBED1-201ENST00000381218 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.71■■□□□ 1.07
ZBED1-201ENST00000381218 PBRM1Q86U86 1689 aa21.7■■□□□ 1.06
ZBED1-201ENST00000381218 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.69■■□□□ 1.06
ZBED1-201ENST00000381218 GRIN2BQ13224 1484 aa21.69■■□□□ 1.06
ZBED1-201ENST00000381218 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.68■■□□□ 1.06
ZBED1-201ENST00000381218 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.68■■□□□ 1.06
ZBED1-201ENST00000381218 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.68■■□□□ 1.06
ZBED1-201ENST00000381218 WDR62O43379 1518 aa21.65■■□□□ 1.06
ZBED1-201ENST00000381218 FKBP8Q14318 412 aa21.65■■□□□ 1.06
ZBED1-201ENST00000381218 IFT140Q96RY7 1462 aa21.64■■□□□ 1.05
ZBED1-201ENST00000381218 FMN1Q68DA7 1419 aa21.64■■□□□ 1.05
ZBED1-201ENST00000381218 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
ZBED1-201ENST00000381218 ADAMTS12P58397 1594 aa21.63■■□□□ 1.05
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ZBED1-201ENST00000381218 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.58■■□□□ 1.05
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ZBED1-201ENST00000381218 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ZBED1-201ENST00000381218 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.55■■□□□ 1.04
ZBED1-201ENST00000381218 SAMD9Q5K651 1589 aa21.55■■□□□ 1.04
ZBED1-201ENST00000381218 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
ZBED1-201ENST00000381218 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ZBED1-201ENST00000381218 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ZBED1-201ENST00000381218 GRIN2AQ12879 1464 aa21.52■■□□□ 1.03
ZBED1-201ENST00000381218 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ZBED1-201ENST00000381218 PTPRKQ15262 1439 aa21.51■■□□□ 1.03
ZBED1-201ENST00000381218 NCOA2Q15596 1464 aa21.5■■□□□ 1.03
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ZBED1-201ENST00000381218 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.48■■□□□ 1.03
ZBED1-201ENST00000381218 JPH4Q96JJ6 628 aa21.46■■□□□ 1.03
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ZBED1-201ENST00000381218 MSH5O43196 834 aa21.45■■□□□ 1.02
ZBED1-201ENST00000381218 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.44■■□□□ 1.02
ZBED1-201ENST00000381218 DISP1Q96F81 1524 aa21.44■■□□□ 1.02
ZBED1-201ENST00000381218 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ZBED1-201ENST00000381218 CEP170Q5SW79 1584 aa21.42■■□□□ 1.02
ZBED1-201ENST00000381218 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.41■■□□□ 1.02
ZBED1-201ENST00000381218 TRIM52Q96A61 297 aa21.41■■□□□ 1.02
ZBED1-201ENST00000381218 FOXD1Q16676 465 aa21.4■■□□□ 1.02
ZBED1-201ENST00000381218 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.4■■□□□ 1.02
ZBED1-201ENST00000381218 NEFLP07196 543 aa21.37■■□□□ 1.01
ZBED1-201ENST00000381218 SYNJ2O15056 1496 aa21.36■■□□□ 1.01
ZBED1-201ENST00000381218 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.36■■□□□ 1.01
ZBED1-201ENST00000381218 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
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ZBED1-201ENST00000381218 KIAA0556O60303 1618 aa21.33■■□□□ 1.01
ZBED1-201ENST00000381218 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
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ZBED1-201ENST00000381218 HFM1A2PYH4 1435 aa21.32■■□□□ 1
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.32■■□□□ 1
ZBED1-201ENST00000381218 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
ZBED1-201ENST00000381218 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
ZBED1-201ENST00000381218 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
ZBED1-201ENST00000381218 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.3■■□□□ 1
ZBED1-201ENST00000381218 HECW1Q76N89 1606 aa21.29■■□□□ 1
ZBED1-201ENST00000381218 UACAQ9BZF9 1416 aa21.27■■□□□ 1
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