RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RPRD1B-201ENST00000373433 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
RPRD1B-201ENST00000373433 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.15■□□□□ 0.18
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RPRD1B-201ENST00000373433 TSPY10P0CW01 314 aa15.67■□□□□ 0.1
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RPRD1B-201ENST00000373433 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
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RPRD1B-201ENST00000373433 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.58■□□□□ 0.08
RPRD1B-201ENST00000373433 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.58■□□□□ 0.08
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RPRD1B-201ENST00000373433 NCOA2Q15596 1464 aa15.46■□□□□ 0.07
RPRD1B-201ENST00000373433 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RPRD1B-201ENST00000373433 NUP160Q12769 1436 aa15.46■□□□□ 0.06
RPRD1B-201ENST00000373433 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 27.2
RPRD1B-201ENST00000373433 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.45■□□□□ 0.06
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RPRD1B-201ENST00000373433 HECW1Q76N89 1606 aa15.44■□□□□ 0.06
RPRD1B-201ENST00000373433 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.44■□□□□ 0.06
RPRD1B-201ENST00000373433 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
RPRD1B-201ENST00000373433 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.44■□□□□ 0.06
RPRD1B-201ENST00000373433 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.44■□□□□ 0.06
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