RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PRPF39-201ENST00000355765 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.58■■□□□ 1.85
PRPF39-201ENST00000355765 ANP32CO43423 234 aa26.58■■□□□ 1.85
PRPF39-201ENST00000355765 CCER2I3L3R5 266 aa26.54■■□□□ 1.84
PRPF39-201ENST00000355765 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.53■■□□□ 1.84
PRPF39-201ENST00000355765 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PRPF39-201ENST00000355765 PRXQ9BXM0 1461 aa26.47■■□□□ 1.83
PRPF39-201ENST00000355765 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.45■■□□□ 1.82
PRPF39-201ENST00000355765 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.44■■□□□ 1.82
PRPF39-201ENST00000355765 TOP2BQ02880 1626 aa26.4■■□□□ 1.82
PRPF39-201ENST00000355765 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
PRPF39-201ENST00000355765 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PRPF39-201ENST00000355765 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PRPF39-201ENST00000355765 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.36■■□□□ 1.81
PRPF39-201ENST00000355765 CFTRP13569 1480 aa26.31■■□□□ 1.8
PRPF39-201ENST00000355765 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
PRPF39-201ENST00000355765 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.25■■□□□ 1.79
PRPF39-201ENST00000355765 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.22■■□□□ 1.79
PRPF39-201ENST00000355765 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.21■■□□□ 1.79
PRPF39-201ENST00000355765 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.21■■□□□ 1.79
PRPF39-201ENST00000355765 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.21■■□□□ 1.79
PRPF39-201ENST00000355765 NBR1Q14596 966 aa26.2■■□□□ 1.78
PRPF39-201ENST00000355765 TIAM1Q13009 1591 aa26.18■■□□□ 1.78
PRPF39-201ENST00000355765 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.17■■□□□ 1.78
PRPF39-201ENST00000355765 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.17■■□□□ 1.78
PRPF39-201ENST00000355765 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.17■■□□□ 1.78
PRPF39-201ENST00000355765 KIF27Q86VH2 1401 aa26.16■■□□□ 1.78
PRPF39-201ENST00000355765 TONSLQ96HA7 1378 aa26.15■■□□□ 1.78
PRPF39-201ENST00000355765 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PRPF39-201ENST00000355765 CUX1P39880 1505 aa26.13■■□□□ 1.77
PRPF39-201ENST00000355765 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.12■■□□□ 1.77
PRPF39-201ENST00000355765 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PRPF39-201ENST00000355765 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PRPF39-201ENST00000355765 NESP48681 1621 aa26.07■■□□□ 1.76
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC184Q52MB2 194 aa26.05■■□□□ 1.76
PRPF39-201ENST00000355765 P3H3Q8IVL6 736 aa26.04■■□□□ 1.76
PRPF39-201ENST00000355765 PRDM2Q13029 1718 aa26.03■■□□□ 1.76
PRPF39-201ENST00000355765 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.02■■□□□ 1.76
PRPF39-201ENST00000355765 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PRPF39-201ENST00000355765 MAP3K1Q13233 1512 aa25.98■■□□□ 1.75
PRPF39-201ENST00000355765 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.98■■□□□ 1.75
PRPF39-201ENST00000355765 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.96■■□□□ 1.75
PRPF39-201ENST00000355765 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.95■■□□□ 1.74
PRPF39-201ENST00000355765 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.86■■□□□ 1.73
PRPF39-201ENST00000355765 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.86■■□□□ 1.73
PRPF39-201ENST00000355765 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PRPF39-201ENST00000355765 IGF1RP08069 1367 aa25.85■■□□□ 1.73
PRPF39-201ENST00000355765 MRS2Q9HD23 443 aa25.84■■□□□ 1.73
PRPF39-201ENST00000355765 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PRPF39-201ENST00000355765 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.81■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.81■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.78■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 UACAQ9BZF9 1416 aa25.78■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.78■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.77■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 IL27Q8NEV9 243 aa25.77■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PRPF39-201ENST00000355765 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.76■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 PTPRKQ15262 1439 aa25.75■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.75■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.75■■□□□ 1.712e-7■■■■□ 20.5
PRPF39-201ENST00000355765 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.75■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 AKNAQ7Z591 1439 aa25.72■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.71■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.71■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.7■■□□□ 1.71
PRPF39-201ENST00000355765 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 TOPBP1Q92547 1522 aa25.69■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 HFM1A2PYH4 1435 aa25.68■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.68■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 NCOA2Q15596 1464 aa25.67■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.67■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.67■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.64■■□□□ 1.7
PRPF39-201ENST00000355765 NAIPQ13075 1403 aa25.63■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC7Q96M83 1385 aa25.62■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.6■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.59■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.58■■□□□ 1.69
PRPF39-201ENST00000355765 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.57■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.57■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.55■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 FMN1Q68DA7 1419 aa25.55■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.54■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 NCOA1Q15788 1441 aa25.54■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 FOXD1Q16676 465 aa25.53■■□□□ 1.68
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