RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SPNS3-201ENST00000355530 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS3-201ENST00000355530 MAPKBP1O60336 1514 aa26.54■■□□□ 1.84
SPNS3-201ENST00000355530 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.54■■□□□ 1.84
SPNS3-201ENST00000355530 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.54■■□□□ 1.84
SPNS3-201ENST00000355530 CUL7Q14999 1698 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS3-201ENST00000355530 ITGAEP38570 1179 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS3-201ENST00000355530 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS3-201ENST00000355530 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS3-201ENST00000355530 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS3-201ENST00000355530 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS3-201ENST00000355530 TOPBP1Q92547 1522 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS3-201ENST00000355530 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SPNS3-201ENST00000355530 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
SPNS3-201ENST00000355530 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.42■■□□□ 1.82
SPNS3-201ENST00000355530 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS3-201ENST00000355530 WDR97A6NE52 1622 aa26.39■■□□□ 1.81
SPNS3-201ENST00000355530 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.39■■□□□ 1.81
SPNS3-201ENST00000355530 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
SPNS3-201ENST00000355530 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SPNS3-201ENST00000355530 NESP48681 1621 aa26.3■■□□□ 1.8
SPNS3-201ENST00000355530 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.3■■□□□ 1.8
SPNS3-201ENST00000355530 FMN1Q68DA7 1419 aa26.3■■□□□ 1.8
SPNS3-201ENST00000355530 P3H3Q8IVL6 736 aa26.3■■□□□ 1.8
SPNS3-201ENST00000355530 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.26■■□□□ 1.79
SPNS3-201ENST00000355530 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.26■■□□□ 1.79
SPNS3-201ENST00000355530 SAMD9Q5K651 1589 aa26.24■■□□□ 1.79
SPNS3-201ENST00000355530 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
SPNS3-201ENST00000355530 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.23■■□□□ 1.79
SPNS3-201ENST00000355530 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SPNS3-201ENST00000355530 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.2■■□□□ 1.79
SPNS3-201ENST00000355530 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SPNS3-201ENST00000355530 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.15■■□□□ 1.78
SPNS3-201ENST00000355530 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.15■■□□□ 1.78
SPNS3-201ENST00000355530 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.12■■□□□ 1.77
SPNS3-201ENST00000355530 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS3-201ENST00000355530 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.1■■□□□ 1.77
SPNS3-201ENST00000355530 GRIN2BQ13224 1484 aa26.09■■□□□ 1.77
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.09■■□□□ 1.77
SPNS3-201ENST00000355530 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SPNS3-201ENST00000355530 HFM1A2PYH4 1435 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS3-201ENST00000355530 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS3-201ENST00000355530 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS3-201ENST00000355530 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SPNS3-201ENST00000355530 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-201ENST00000355530 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-201ENST00000355530 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-201ENST00000355530 NCOA2Q15596 1464 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-201ENST00000355530 UACAQ9BZF9 1416 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS3-201ENST00000355530 MYT1Q01538 1121 aa26.01■■□□□ 1.75
SPNS3-201ENST00000355530 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SPNS3-201ENST00000355530 PTPRKQ15262 1439 aa25.98■■□□□ 1.75
SPNS3-201ENST00000355530 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SPNS3-201ENST00000355530 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGEF11O15085 1522 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS3-201ENST00000355530 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SPNS3-201ENST00000355530 TONSLQ96HA7 1378 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS3-201ENST00000355530 NAIPQ13075 1403 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS3-201ENST00000355530 PBRM1Q86U86 1689 aa25.93■■□□□ 1.74
SPNS3-201ENST00000355530 KCNH8Q96L42 1107 aa25.93■■□□□ 1.74
SPNS3-201ENST00000355530 HECW1Q76N89 1606 aa25.92■■□□□ 1.74
SPNS3-201ENST00000355530 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.89■■□□□ 1.74
SPNS3-201ENST00000355530 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.87■■□□□ 1.73
SPNS3-201ENST00000355530 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
SPNS3-201ENST00000355530 IQGAP2Q13576 1575 aa25.85■■□□□ 1.73
SPNS3-201ENST00000355530 CCER2I3L3R5 266 aa25.84■■□□□ 1.73
SPNS3-201ENST00000355530 ADAMTS12P58397 1594 aa25.83■■□□□ 1.72
SPNS3-201ENST00000355530 AKNAQ7Z591 1439 aa25.82■■□□□ 1.72
SPNS3-201ENST00000355530 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.79■■□□□ 1.72
SPNS3-201ENST00000355530 ANP32CO43423 234 aa25.78■■□□□ 1.72
SPNS3-201ENST00000355530 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SPNS3-201ENST00000355530 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SPNS3-201ENST00000355530 WDR62O43379 1518 aa25.75■■□□□ 1.71
SPNS3-201ENST00000355530 MIA2Q96PC5 1412 aa25.73■■□□□ 1.71
SPNS3-201ENST00000355530 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
SPNS3-201ENST00000355530 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.67■■□□□ 1.7
SPNS3-201ENST00000355530 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
SPNS3-201ENST00000355530 KDM6BO15054 1643 aa25.65■■□□□ 1.7
SPNS3-201ENST00000355530 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS3-201ENST00000355530 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.61■■□□□ 1.69
SPNS3-201ENST00000355530 KIAA0556O60303 1618 aa25.58■■□□□ 1.68
SPNS3-201ENST00000355530 FKBP8Q14318 412 aa25.57■■□□□ 1.68
SPNS3-201ENST00000355530 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.57■■□□□ 1.68
SPNS3-201ENST00000355530 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
SPNS3-201ENST00000355530 NEFLP07196 543 aa25.55■■□□□ 1.68
SPNS3-201ENST00000355530 IFT140Q96RY7 1462 aa25.54■■□□□ 1.68
SPNS3-201ENST00000355530 ROCK1Q13464 1354 aa25.54■■□□□ 1.68
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM52Q96A61 297 aa25.54■■□□□ 1.68
SPNS3-201ENST00000355530 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.52■■□□□ 1.68
SPNS3-201ENST00000355530 DAPK1P53355 1430 aa25.52■■□□□ 1.68
SPNS3-201ENST00000355530 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.5■■□□□ 1.67
SPNS3-201ENST00000355530 DISP1Q96F81 1524 aa25.5■■□□□ 1.67
SPNS3-201ENST00000355530 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.49■■□□□ 1.67
SPNS3-201ENST00000355530 BCANQ96GW7 911 aa25.48■■□□□ 1.67
SPNS3-201ENST00000355530 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SPNS3-201ENST00000355530 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SPNS3-201ENST00000355530 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.47■■□□□ 1.67
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SPNS3-201ENST00000355530 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
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