RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349959.3

PKIG-201, Transcript of cAMP-dependent protein kinase inhibitor gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKIG, Length 1,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKIG-201ENST00000349959 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PKIG-201ENST00000349959 CLIP1P30622 1438 aa22.49■■□□□ 1.19
PKIG-201ENST00000349959 PBRM1Q86U86 1689 aa22.46■■□□□ 1.19
PKIG-201ENST00000349959 GRIN2BQ13224 1484 aa22.43■■□□□ 1.18
PKIG-201ENST00000349959 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
PKIG-201ENST00000349959 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PKIG-201ENST00000349959 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.38■■□□□ 1.17
PKIG-201ENST00000349959 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PKIG-201ENST00000349959 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.36■■□□□ 1.17
PKIG-201ENST00000349959 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PKIG-201ENST00000349959 ADAMTS12P58397 1594 aa22.33■■□□□ 1.17
PKIG-201ENST00000349959 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.32■■□□□ 1.16
PKIG-201ENST00000349959 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PKIG-201ENST00000349959 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.3■■□□□ 1.16
PKIG-201ENST00000349959 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.3■■□□□ 1.16
PKIG-201ENST00000349959 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PKIG-201ENST00000349959 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.24■■□□□ 1.15
PKIG-201ENST00000349959 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.23■■□□□ 1.15
PKIG-201ENST00000349959 ARAP1Q96P48 1450 aa22.22■■□□□ 1.15
PKIG-201ENST00000349959 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.21■■□□□ 1.15
PKIG-201ENST00000349959 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PKIG-201ENST00000349959 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PKIG-201ENST00000349959 APLP2Q06481 763 aa22.17■■□□□ 1.14
PKIG-201ENST00000349959 OSCARQ8IYS5 282 aa22.17■■□□□ 1.14
PKIG-201ENST00000349959 SYNJ2O15056 1496 aa22.15■■□□□ 1.14
PKIG-201ENST00000349959 GRIN2AQ12879 1464 aa22.14■■□□□ 1.13
PKIG-201ENST00000349959 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.12■■□□□ 1.13
PKIG-201ENST00000349959 IQGAP2Q13576 1575 aa22.1■■□□□ 1.13
PKIG-201ENST00000349959 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PKIG-201ENST00000349959 SAMD9Q5K651 1589 aa22.06■■□□□ 1.12
PKIG-201ENST00000349959 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.05■■□□□ 1.12
PKIG-201ENST00000349959 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PKIG-201ENST00000349959 FMN1Q68DA7 1419 aa22.01■■□□□ 1.11
PKIG-201ENST00000349959 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22■■□□□ 1.11
PKIG-201ENST00000349959 FBLN2P98095 1184 aa22■■□□□ 1.11
PKIG-201ENST00000349959 P3H3Q8IVL6 736 aa21.99■■□□□ 1.11
PKIG-201ENST00000349959 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.99■■□□□ 1.11
PKIG-201ENST00000349959 NUP160Q12769 1436 aa21.97■■□□□ 1.11
PKIG-201ENST00000349959 CEP170Q5SW79 1584 aa21.95■■□□□ 1.11
PKIG-201ENST00000349959 MAP3K1Q13233 1512 aa21.95■■□□□ 1.1
PKIG-201ENST00000349959 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PKIG-201ENST00000349959 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.94■■□□□ 1.1
PKIG-201ENST00000349959 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PKIG-201ENST00000349959 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.92■■□□□ 1.1
PKIG-201ENST00000349959 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
PKIG-201ENST00000349959 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.88■■□□□ 1.09
PKIG-201ENST00000349959 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.88■■□□□ 1.09
PKIG-201ENST00000349959 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.88■■□□□ 1.09
PKIG-201ENST00000349959 TIAM1Q13009 1591 aa21.87■■□□□ 1.09
PKIG-201ENST00000349959 CHD1O14646 1710 aa21.87■■□□□ 1.09
PKIG-201ENST00000349959 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PKIG-201ENST00000349959 KIAA0556O60303 1618 aa21.86■■□□□ 1.09
PKIG-201ENST00000349959 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.85■■□□□ 1.09
PKIG-201ENST00000349959 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.83■■□□□ 1.09
PKIG-201ENST00000349959 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PKIG-201ENST00000349959 DISP1Q96F81 1524 aa21.82■■□□□ 1.08
PKIG-201ENST00000349959 RNF39Q9H2S5 420 aa21.82■■□□□ 1.08
PKIG-201ENST00000349959 JPH4Q96JJ6 628 aa21.79■■□□□ 1.08
PKIG-201ENST00000349959 HECW1Q76N89 1606 aa21.78■■□□□ 1.08
PKIG-201ENST00000349959 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PKIG-201ENST00000349959 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.77■■□□□ 1.07
PKIG-201ENST00000349959 ARHGEF11O15085 1522 aa21.76■■□□□ 1.07
PKIG-201ENST00000349959 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.76■■□□□ 1.07
PKIG-201ENST00000349959 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PKIG-201ENST00000349959 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.69■■□□□ 1.06
PKIG-201ENST00000349959 SHROOM2Q13796 1616 aa21.66■■□□□ 1.06
PKIG-201ENST00000349959 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.66■■□□□ 1.06
PKIG-201ENST00000349959 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PKIG-201ENST00000349959 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.65■■□□□ 1.06
PKIG-201ENST00000349959 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.64■■□□□ 1.06
PKIG-201ENST00000349959 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PKIG-201ENST00000349959 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.63■■□□□ 1.05
PKIG-201ENST00000349959 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.62■■□□□ 1.05
PKIG-201ENST00000349959 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PKIG-201ENST00000349959 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PKIG-201ENST00000349959 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PKIG-201ENST00000349959 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.56■■□□□ 1.04
PKIG-201ENST00000349959 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PKIG-201ENST00000349959 PTPRGP23470 1445 aa21.55■■□□□ 1.04
PKIG-201ENST00000349959 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PKIG-201ENST00000349959 ABCA8O94911 1581 aa21.53■■□□□ 1.04
PKIG-201ENST00000349959 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.53■■□□□ 1.04
PKIG-201ENST00000349959 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PKIG-201ENST00000349959 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.51■■□□□ 1.03
PKIG-201ENST00000349959 HRCP23327 699 aa21.51■■□□□ 1.03
PKIG-201ENST00000349959 NCOA2Q15596 1464 aa21.49■■□□□ 1.03
PKIG-201ENST00000349959 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PKIG-201ENST00000349959 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PKIG-201ENST00000349959 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.47■■□□□ 1.03
PKIG-201ENST00000349959 ARID3CA6NKF2 412 aa21.44■■□□□ 1.02
PKIG-201ENST00000349959 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PKIG-201ENST00000349959 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
PKIG-201ENST00000349959 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.43■■□□□ 1.02
PKIG-201ENST00000349959 UACAQ9BZF9 1416 aa21.43■■□□□ 1.02
PKIG-201ENST00000349959 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PKIG-201ENST00000349959 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.41■■□□□ 1.02
PKIG-201ENST00000349959 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.4■■□□□ 1.02
PKIG-201ENST00000349959 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PKIG-201ENST00000349959 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PKIG-201ENST00000349959 ABCC2Q92887 1545 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms