RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343855.5

ZBED6CL-201, Transcript of ZBED6 C-terminal like, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene ZBED6CL, Length 2,933 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6CL-201ENST00000343855 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.36■□□□□ 0.69
ZBED6CL-201ENST00000343855 NCAPD3P42695 1498 aa19.36■□□□□ 0.69
ZBED6CL-201ENST00000343855 TOP2BQ02880 1626 aa19.35■□□□□ 0.69
ZBED6CL-201ENST00000343855 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP19.35■□□□□ 0.69
ZBED6CL-201ENST00000343855 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.32■□□□□ 0.68
ZBED6CL-201ENST00000343855 WDR97A6NE52 1622 aa19.31■□□□□ 0.68
ZBED6CL-201ENST00000343855 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
ZBED6CL-201ENST00000343855 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.29■□□□□ 0.68
ZBED6CL-201ENST00000343855 KIF27Q86VH2 1401 aa19.27■□□□□ 0.68
ZBED6CL-201ENST00000343855 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.27■□□□□ 0.67
ZBED6CL-201ENST00000343855 ARAP1Q96P48 1450 aa19.25■□□□□ 0.67
ZBED6CL-201ENST00000343855 CUX2O14529 1486 aa19.24■□□□□ 0.67
ZBED6CL-201ENST00000343855 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.24■□□□□ 0.67
ZBED6CL-201ENST00000343855 PRXQ9BXM0 1461 aa19.24■□□□□ 0.67
ZBED6CL-201ENST00000343855 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
ZBED6CL-201ENST00000343855 CFTRP13569 1480 aa19.23■□□□□ 0.67
ZBED6CL-201ENST00000343855 MAPKBP1O60336 1514 aa19.23■□□□□ 0.67
ZBED6CL-201ENST00000343855 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
ZBED6CL-201ENST00000343855 CCER2I3L3R5 266 aa19.23■□□□□ 0.67
ZBED6CL-201ENST00000343855 HMGXB3Q12766 1538 aa19.19■□□□□ 0.66
ZBED6CL-201ENST00000343855 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.18■□□□□ 0.66
ZBED6CL-201ENST00000343855 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.17■□□□□ 0.66
ZBED6CL-201ENST00000343855 IGF1RP08069 1367 aa19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CL-201ENST00000343855 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
ZBED6CL-201ENST00000343855 NESP48681 1621 aa19.13■□□□□ 0.65
ZBED6CL-201ENST00000343855 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
ZBED6CL-201ENST00000343855 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.12■□□□□ 0.65
ZBED6CL-201ENST00000343855 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.12■□□□□ 0.65
ZBED6CL-201ENST00000343855 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
ZBED6CL-201ENST00000343855 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.11■□□□□ 0.65
ZBED6CL-201ENST00000343855 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.1■□□□□ 0.65
ZBED6CL-201ENST00000343855 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.1■□□□□ 0.65
ZBED6CL-201ENST00000343855 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.09■□□□□ 0.65
ZBED6CL-201ENST00000343855 CCDC184Q52MB2 194 aa19.09■□□□□ 0.65
ZBED6CL-201ENST00000343855 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.09■□□□□ 0.65
ZBED6CL-201ENST00000343855 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.08■□□□□ 0.64
ZBED6CL-201ENST00000343855 PPP4R2Q9NY27 417 aa19.07■□□□□ 0.64
ZBED6CL-201ENST00000343855 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.07■□□□□ 0.64
ZBED6CL-201ENST00000343855 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
ZBED6CL-201ENST00000343855 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
ZBED6CL-201ENST00000343855 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.04■□□□□ 0.64
ZBED6CL-201ENST00000343855 TONSLQ96HA7 1378 aa19.02■□□□□ 0.64
ZBED6CL-201ENST00000343855 ARID3CA6NKF2 412 aa19.02■□□□□ 0.64
ZBED6CL-201ENST00000343855 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.01■□□□□ 0.63
ZBED6CL-201ENST00000343855 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19■□□□□ 0.63
ZBED6CL-201ENST00000343855 IL27Q8NEV9 243 aa19■□□□□ 0.63
ZBED6CL-201ENST00000343855 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.98■□□□□ 0.63
ZBED6CL-201ENST00000343855 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
ZBED6CL-201ENST00000343855 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
ZBED6CL-201ENST00000343855 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.95■□□□□ 0.62
ZBED6CL-201ENST00000343855 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
ZBED6CL-201ENST00000343855 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
ZBED6CL-201ENST00000343855 MRS2Q9HD23 443 aa18.9■□□□□ 0.62
ZBED6CL-201ENST00000343855 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.89■□□□□ 0.61
ZBED6CL-201ENST00000343855 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.88■□□□□ 0.61
ZBED6CL-201ENST00000343855 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
ZBED6CL-201ENST00000343855 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
ZBED6CL-201ENST00000343855 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
ZBED6CL-201ENST00000343855 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
ZBED6CL-201ENST00000343855 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
ZBED6CL-201ENST00000343855 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
ZBED6CL-201ENST00000343855 TOPBP1Q92547 1522 aa18.81■□□□□ 0.6
ZBED6CL-201ENST00000343855 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.8■□□□□ 0.6
ZBED6CL-201ENST00000343855 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.8■□□□□ 0.6
ZBED6CL-201ENST00000343855 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.8■□□□□ 0.6
ZBED6CL-201ENST00000343855 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
ZBED6CL-201ENST00000343855 TIAM1Q13009 1591 aa18.78■□□□□ 0.6
ZBED6CL-201ENST00000343855 AKNAQ7Z591 1439 aa18.78■□□□□ 0.6
ZBED6CL-201ENST00000343855 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.77■□□□□ 0.59
ZBED6CL-201ENST00000343855 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
ZBED6CL-201ENST00000343855 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
ZBED6CL-201ENST00000343855 FOXD1Q16676 465 aa18.72■□□□□ 0.59
ZBED6CL-201ENST00000343855 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
ZBED6CL-201ENST00000343855 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.72■□□□□ 0.59
ZBED6CL-201ENST00000343855 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
ZBED6CL-201ENST00000343855 NEFMP07197 916 aa18.71■□□□□ 0.59
ZBED6CL-201ENST00000343855 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.71■□□□□ 0.59
ZBED6CL-201ENST00000343855 PRDM2Q13029 1718 aa18.71■□□□□ 0.59
ZBED6CL-201ENST00000343855 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.68■□□□□ 0.58
ZBED6CL-201ENST00000343855 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.68■□□□□ 0.58
ZBED6CL-201ENST00000343855 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.68■□□□□ 0.58
ZBED6CL-201ENST00000343855 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.68■□□□□ 0.58
ZBED6CL-201ENST00000343855 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.67■□□□□ 0.58
ZBED6CL-201ENST00000343855 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.58
ZBED6CL-201ENST00000343855 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
ZBED6CL-201ENST00000343855 PTPRKQ15262 1439 aa18.63■□□□□ 0.57
ZBED6CL-201ENST00000343855 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.62■□□□□ 0.57
ZBED6CL-201ENST00000343855 BRPF3Q9ULD4 1205 aa18.62■□□□□ 0.57
ZBED6CL-201ENST00000343855 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.61■□□□□ 0.57
ZBED6CL-201ENST00000343855 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.61■□□□□ 0.57
ZBED6CL-201ENST00000343855 SKAP1Q86WV1 359 aa18.6■□□□□ 0.57
ZBED6CL-201ENST00000343855 FBLN2P98095 1184 aa18.59■□□□□ 0.57
ZBED6CL-201ENST00000343855 UACAQ9BZF9 1416 aa18.58■□□□□ 0.56
ZBED6CL-201ENST00000343855 NUDCQ9Y266 331 aa18.58■□□□□ 0.56
ZBED6CL-201ENST00000343855 CCDC7Q96M83 1385 aa18.57■□□□□ 0.56
ZBED6CL-201ENST00000343855 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.55■□□□□ 0.56
ZBED6CL-201ENST00000343855 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
ZBED6CL-201ENST00000343855 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.55■□□□□ 0.56
ZBED6CL-201ENST00000343855 SLC4A3P48751 1232 aa18.54■□□□□ 0.56
ZBED6CL-201ENST00000343855 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms