RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336604.8

IFFO1-201, Transcript of intermediate filament family orphan 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFFO1, Length 2,686 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1-201ENST00000336604 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.94■■□□□ 1.74
IFFO1-201ENST00000336604 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.91■■□□□ 1.74
IFFO1-201ENST00000336604 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.91■■□□□ 1.74
IFFO1-201ENST00000336604 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
IFFO1-201ENST00000336604 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.88■■□□□ 1.73
IFFO1-201ENST00000336604 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
IFFO1-201ENST00000336604 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
IFFO1-201ENST00000336604 MAPKBP1O60336 1514 aa25.83■■□□□ 1.73
IFFO1-201ENST00000336604 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
IFFO1-201ENST00000336604 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.83■■□□□ 1.73
IFFO1-201ENST00000336604 NESP48681 1621 aa25.83■■□□□ 1.72
IFFO1-201ENST00000336604 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.83■■□□□ 1.72
IFFO1-201ENST00000336604 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.81■■□□□ 1.72
IFFO1-201ENST00000336604 TOPBP1Q92547 1522 aa25.81■■□□□ 1.72
IFFO1-201ENST00000336604 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.81■■□□□ 1.72
IFFO1-201ENST00000336604 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.76■■□□□ 1.71
IFFO1-201ENST00000336604 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.7■■□□□ 1.7
IFFO1-201ENST00000336604 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.69■■□□□ 1.7
IFFO1-201ENST00000336604 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.68■■□□□ 1.7
IFFO1-201ENST00000336604 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.67■■□□□ 1.7
IFFO1-201ENST00000336604 CUL7Q14999 1698 aa25.65■■□□□ 1.7
IFFO1-201ENST00000336604 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.694e-8■■■■□ 24.3
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IFFO1-201ENST00000336604 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.6■■□□□ 1.69
IFFO1-201ENST00000336604 WDR97A6NE52 1622 aa25.58■■□□□ 1.69
IFFO1-201ENST00000336604 FMN1Q68DA7 1419 aa25.58■■□□□ 1.68
IFFO1-201ENST00000336604 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.55■■□□□ 1.68
IFFO1-201ENST00000336604 KCNH8Q96L42 1107 aa25.53■■□□□ 1.68
IFFO1-201ENST00000336604 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.68
IFFO1-201ENST00000336604 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.52■■□□□ 1.68
IFFO1-201ENST00000336604 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.52■■□□□ 1.68
IFFO1-201ENST00000336604 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.51■■□□□ 1.67
IFFO1-201ENST00000336604 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.48■■□□□ 1.67
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IFFO1-201ENST00000336604 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
IFFO1-201ENST00000336604 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.47■■□□□ 1.67
IFFO1-201ENST00000336604 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.45■■□□□ 1.66
IFFO1-201ENST00000336604 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
IFFO1-201ENST00000336604 PTPRKQ15262 1439 aa25.43■■□□□ 1.66
IFFO1-201ENST00000336604 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
IFFO1-201ENST00000336604 SAMD9Q5K651 1589 aa25.43■■□□□ 1.66
IFFO1-201ENST00000336604 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
IFFO1-201ENST00000336604 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.4■■□□□ 1.66
IFFO1-201ENST00000336604 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.39■■□□□ 1.66
IFFO1-201ENST00000336604 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.39■■□□□ 1.65
IFFO1-201ENST00000336604 GRIN2BQ13224 1484 aa25.38■■□□□ 1.65
IFFO1-201ENST00000336604 NCOA2Q15596 1464 aa25.38■■□□□ 1.65
IFFO1-201ENST00000336604 HFM1A2PYH4 1435 aa25.37■■□□□ 1.65
IFFO1-201ENST00000336604 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.35■■□□□ 1.65
IFFO1-201ENST00000336604 UACAQ9BZF9 1416 aa25.31■■□□□ 1.64
IFFO1-201ENST00000336604 TONSLQ96HA7 1378 aa25.31■■□□□ 1.64
IFFO1-201ENST00000336604 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.31■■□□□ 1.64
IFFO1-201ENST00000336604 NAIPQ13075 1403 aa25.3■■□□□ 1.64
IFFO1-201ENST00000336604 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.29■■□□□ 1.64
IFFO1-201ENST00000336604 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
IFFO1-201ENST00000336604 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.26■■□□□ 1.64
IFFO1-201ENST00000336604 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
IFFO1-201ENST00000336604 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
IFFO1-201ENST00000336604 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.25■■□□□ 1.63
IFFO1-201ENST00000336604 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.22■■□□□ 1.63
IFFO1-201ENST00000336604 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.2■■□□□ 1.62
IFFO1-201ENST00000336604 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.2■■□□□ 1.62
IFFO1-201ENST00000336604 ARHGEF11O15085 1522 aa25.19■■□□□ 1.62
IFFO1-201ENST00000336604 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.17■■□□□ 1.62
IFFO1-201ENST00000336604 ARID3CA6NKF2 412 aa25.16■■□□□ 1.62
IFFO1-201ENST00000336604 ANP32CO43423 234 aa25.16■■□□□ 1.62
IFFO1-201ENST00000336604 IQGAP2Q13576 1575 aa25.12■■□□□ 1.61
IFFO1-201ENST00000336604 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
IFFO1-201ENST00000336604 PBRM1Q86U86 1689 aa25.11■■□□□ 1.61
IFFO1-201ENST00000336604 HECW1Q76N89 1606 aa25.11■■□□□ 1.61
IFFO1-201ENST00000336604 CCER2I3L3R5 266 aa25.1■■□□□ 1.61
IFFO1-201ENST00000336604 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
IFFO1-201ENST00000336604 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.09■■□□□ 1.61
IFFO1-201ENST00000336604 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.09■■□□□ 1.61
IFFO1-201ENST00000336604 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
IFFO1-201ENST00000336604 TRIM52Q96A61 297 aa25.09■■□□□ 1.61
IFFO1-201ENST00000336604 ADAMTS12P58397 1594 aa25.07■■□□□ 1.6
IFFO1-201ENST00000336604 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
IFFO1-201ENST00000336604 BCANQ96GW7 911 aa25.05■■□□□ 1.6
IFFO1-201ENST00000336604 KDM6BO15054 1643 aa25.03■■□□□ 1.6
IFFO1-201ENST00000336604 FKBP8Q14318 412 aa25.02■■□□□ 1.6
IFFO1-201ENST00000336604 WDR62O43379 1518 aa25.01■■□□□ 1.59
IFFO1-201ENST00000336604 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25■■□□□ 1.59
IFFO1-201ENST00000336604 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.99■■□□□ 1.59
IFFO1-201ENST00000336604 MIA2Q96PC5 1412 aa24.99■■□□□ 1.59
IFFO1-201ENST00000336604 AKNAQ7Z591 1439 aa24.97■■□□□ 1.59
IFFO1-201ENST00000336604 FOXD1Q16676 465 aa24.97■■□□□ 1.59
IFFO1-201ENST00000336604 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.97■■□□□ 1.59
IFFO1-201ENST00000336604 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
IFFO1-201ENST00000336604 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
IFFO1-201ENST00000336604 BCL11AQ9H165 835 aa24.92■■□□□ 1.58
IFFO1-201ENST00000336604 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.92■■□□□ 1.58
IFFO1-201ENST00000336604 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
IFFO1-201ENST00000336604 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.89■■□□□ 1.58
IFFO1-201ENST00000336604 DISP1Q96F81 1524 aa24.88■■□□□ 1.57
IFFO1-201ENST00000336604 DAPK1P53355 1430 aa24.86■■□□□ 1.57
IFFO1-201ENST00000336604 NEFLP07196 543 aa24.86■■□□□ 1.57
IFFO1-201ENST00000336604 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
IFFO1-201ENST00000336604 IFT140Q96RY7 1462 aa24.86■■□□□ 1.57
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