RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336425.9

TBXAS1-201, Transcript of thromboxane A synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TBXAS1, Length 2,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBXAS1-201ENST00000336425 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.15■■□□□ 1.3
TBXAS1-201ENST00000336425 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
TBXAS1-201ENST00000336425 CUL7Q14999 1698 aa23.11■■□□□ 1.29
TBXAS1-201ENST00000336425 TOPBP1Q92547 1522 aa23.1■■□□□ 1.29
TBXAS1-201ENST00000336425 MAPKBP1O60336 1514 aa23.1■■□□□ 1.29
TBXAS1-201ENST00000336425 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.1■■□□□ 1.29
TBXAS1-201ENST00000336425 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.09■■□□□ 1.29
TBXAS1-201ENST00000336425 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
TBXAS1-201ENST00000336425 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.07■■□□□ 1.28
TBXAS1-201ENST00000336425 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.07■■□□□ 1.28
TBXAS1-201ENST00000336425 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.06■■□□□ 1.28
TBXAS1-201ENST00000336425 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.05■■□□□ 1.28
TBXAS1-201ENST00000336425 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.04■■□□□ 1.28
TBXAS1-201ENST00000336425 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
TBXAS1-201ENST00000336425 WDR97A6NE52 1622 aa23.03■■□□□ 1.28
TBXAS1-201ENST00000336425 ITGAEP38570 1179 aa23■■□□□ 1.27
TBXAS1-201ENST00000336425 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.99■■□□□ 1.27
TBXAS1-201ENST00000336425 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.98■■□□□ 1.27
TBXAS1-201ENST00000336425 NESP48681 1621 aa22.97■■□□□ 1.27
TBXAS1-201ENST00000336425 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.95■■□□□ 1.26
TBXAS1-201ENST00000336425 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
TBXAS1-201ENST00000336425 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.91■■□□□ 1.26
TBXAS1-201ENST00000336425 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TBXAS1-201ENST00000336425 P3H3Q8IVL6 736 aa22.89■■□□□ 1.26
TBXAS1-201ENST00000336425 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.89■■□□□ 1.25
TBXAS1-201ENST00000336425 SAMD9Q5K651 1589 aa22.88■■□□□ 1.25
TBXAS1-201ENST00000336425 FMN1Q68DA7 1419 aa22.87■■□□□ 1.25
TBXAS1-201ENST00000336425 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TBXAS1-201ENST00000336425 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.82■■□□□ 1.24
TBXAS1-201ENST00000336425 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.8■■□□□ 1.24
TBXAS1-201ENST00000336425 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.79■■□□□ 1.24
TBXAS1-201ENST00000336425 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TBXAS1-201ENST00000336425 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.79■■□□□ 1.24
TBXAS1-201ENST00000336425 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
TBXAS1-201ENST00000336425 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.76■■□□□ 1.23
TBXAS1-201ENST00000336425 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.76■■□□□ 1.23
TBXAS1-201ENST00000336425 GRIN2BQ13224 1484 aa22.75■■□□□ 1.23
TBXAS1-201ENST00000336425 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.73■■□□□ 1.23
TBXAS1-201ENST00000336425 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TBXAS1-201ENST00000336425 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.71■■□□□ 1.23
TBXAS1-201ENST00000336425 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.69■■□□□ 1.22
TBXAS1-201ENST00000336425 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TBXAS1-201ENST00000336425 HFM1A2PYH4 1435 aa22.68■■□□□ 1.22
TBXAS1-201ENST00000336425 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TBXAS1-201ENST00000336425 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.68■■□□□ 1.22
TBXAS1-201ENST00000336425 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.68■■□□□ 1.22
TBXAS1-201ENST00000336425 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.67■■□□□ 1.22
TBXAS1-201ENST00000336425 NCOA2Q15596 1464 aa22.67■■□□□ 1.22
TBXAS1-201ENST00000336425 PTPRKQ15262 1439 aa22.65■■□□□ 1.22
TBXAS1-201ENST00000336425 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.65■■□□□ 1.22
TBXAS1-201ENST00000336425 ARHGEF11O15085 1522 aa22.64■■□□□ 1.21
TBXAS1-201ENST00000336425 UACAQ9BZF9 1416 aa22.63■■□□□ 1.21
TBXAS1-201ENST00000336425 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TBXAS1-201ENST00000336425 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.61■■□□□ 1.21
TBXAS1-201ENST00000336425 PBRM1Q86U86 1689 aa22.61■■□□□ 1.21
TBXAS1-201ENST00000336425 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TBXAS1-201ENST00000336425 NAIPQ13075 1403 aa22.59■■□□□ 1.21
TBXAS1-201ENST00000336425 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.57■■□□□ 1.2
TBXAS1-201ENST00000336425 HECW1Q76N89 1606 aa22.55■■□□□ 1.2
TBXAS1-201ENST00000336425 KCNH8Q96L42 1107 aa22.54■■□□□ 1.2
TBXAS1-201ENST00000336425 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TBXAS1-201ENST00000336425 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.53■■□□□ 1.2
TBXAS1-201ENST00000336425 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TBXAS1-201ENST00000336425 ADAMTS12P58397 1594 aa22.52■■□□□ 1.2
TBXAS1-201ENST00000336425 IQGAP2Q13576 1575 aa22.51■■□□□ 1.19
TBXAS1-201ENST00000336425 TONSLQ96HA7 1378 aa22.51■■□□□ 1.19
TBXAS1-201ENST00000336425 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.49■■□□□ 1.19
TBXAS1-201ENST00000336425 AKNAQ7Z591 1439 aa22.47■■□□□ 1.19
TBXAS1-201ENST00000336425 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TBXAS1-201ENST00000336425 WDR62O43379 1518 aa22.44■■□□□ 1.18
TBXAS1-201ENST00000336425 CCER2I3L3R5 266 aa22.43■■□□□ 1.18
TBXAS1-201ENST00000336425 MIA2Q96PC5 1412 aa22.4■■□□□ 1.18
TBXAS1-201ENST00000336425 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.39■■□□□ 1.18
TBXAS1-201ENST00000336425 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
TBXAS1-201ENST00000336425 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TBXAS1-201ENST00000336425 MYT1Q01538 1121 aa22.37■■□□□ 1.17
TBXAS1-201ENST00000336425 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TBXAS1-201ENST00000336425 KDM6BO15054 1643 aa22.35■■□□□ 1.17
TBXAS1-201ENST00000336425 ANP32CO43423 234 aa22.34■■□□□ 1.17
TBXAS1-201ENST00000336425 KIAA0556O60303 1618 aa22.29■■□□□ 1.16
TBXAS1-201ENST00000336425 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.29■■□□□ 1.16
TBXAS1-201ENST00000336425 IFT140Q96RY7 1462 aa22.28■■□□□ 1.16
TBXAS1-201ENST00000336425 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TBXAS1-201ENST00000336425 DISP1Q96F81 1524 aa22.25■■□□□ 1.15
TBXAS1-201ENST00000336425 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.25■■□□□ 1.15
TBXAS1-201ENST00000336425 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.25■■□□□ 1.15
TBXAS1-201ENST00000336425 ROCK1Q13464 1354 aa22.23■■□□□ 1.15
TBXAS1-201ENST00000336425 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TBXAS1-201ENST00000336425 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.22■■□□□ 1.15
TBXAS1-201ENST00000336425 DAPK1P53355 1430 aa22.21■■□□□ 1.15
TBXAS1-201ENST00000336425 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.21■■□□□ 1.15
TBXAS1-201ENST00000336425 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
TBXAS1-201ENST00000336425 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.18■■□□□ 1.14
TBXAS1-201ENST00000336425 TRIM52Q96A61 297 aa22.18■■□□□ 1.14
TBXAS1-201ENST00000336425 GRIN2AQ12879 1464 aa22.16■■□□□ 1.14
TBXAS1-201ENST00000336425 ABCC5O15440 1437 aa22.16■■□□□ 1.14
TBXAS1-201ENST00000336425 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TBXAS1-201ENST00000336425 FKBP8Q14318 412 aa22.15■■□□□ 1.14
TBXAS1-201ENST00000336425 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TBXAS1-201ENST00000336425 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.7 ms