RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 TIAM1Q13009 1591 aa28.66■■■□□ 2.18
PPP1CC-201ENST00000335007 CCER2I3L3R5 266 aa28.65■■■□□ 2.18
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PPP1CC-201ENST00000335007 CUX1P39880 1505 aa28.63■■■□□ 2.17
PPP1CC-201ENST00000335007 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP1CC-201ENST00000335007 ANP32CO43423 234 aa28.54■■■□□ 2.16
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.51■■■□□ 2.15
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PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM52Q96A61 297 aa28.48■■■□□ 2.15
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PPP1CC-201ENST00000335007 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.43■■■□□ 2.14
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PPP1CC-201ENST00000335007 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.34■■■□□ 2.13
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PPP1CC-201ENST00000335007 TONSLQ96HA7 1378 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP1CC-201ENST00000335007 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP1CC-201ENST00000335007 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.18■■■□□ 2.1
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PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.11■■■□□ 2.09
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PPP1CC-201ENST00000335007 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.03■■■□□ 2.08
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PPP1CC-201ENST00000335007 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.76■■■□□ 2.03
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PPP1CC-201ENST00000335007 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.74■■■□□ 2.03
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PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC184Q52MB2 194 aa27.71■■■□□ 2.03
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.71■■■□□ 2.03
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PPP1CC-201ENST00000335007 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.68■■■□□ 2.02
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PPP1CC-201ENST00000335007 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.66■■■□□ 2.02
PPP1CC-201ENST00000335007 MRS2Q9HD23 443 aa27.66■■■□□ 2.02
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC7Q96M83 1385 aa27.66■■■□□ 2.02
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PPP1CC-201ENST00000335007 NBR1Q14596 966 aa27.53■■■□□ 2
PPP1CC-201ENST00000335007 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
PPP1CC-201ENST00000335007 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.52■■■□□ 2
PPP1CC-201ENST00000335007 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
PPP1CC-201ENST00000335007 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
PPP1CC-201ENST00000335007 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.5■■□□□ 1.99
PPP1CC-201ENST00000335007 KDM6BO15054 1643 aa27.5■■□□□ 1.99
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