RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GINS3-202ENST00000328514 FKBP8Q14318 412 aa16.01■□□□□ 0.15
GINS3-202ENST00000328514 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.01■□□□□ 0.15
GINS3-202ENST00000328514 WDR97A6NE52 1622 aa15.99■□□□□ 0.15
GINS3-202ENST00000328514 TIAM1Q13009 1591 aa15.98■□□□□ 0.15
GINS3-202ENST00000328514 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GINS3-202ENST00000328514 CUX1P39880 1505 aa15.96■□□□□ 0.15
GINS3-202ENST00000328514 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
GINS3-202ENST00000328514 NEFLP07196 543 aa15.95■□□□□ 0.14
GINS3-202ENST00000328514 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
GINS3-202ENST00000328514 BCANQ96GW7 911 aa15.92■□□□□ 0.14
GINS3-202ENST00000328514 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.91■□□□□ 0.14
GINS3-202ENST00000328514 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
GINS3-202ENST00000328514 HMGXB3Q12766 1538 aa15.88■□□□□ 0.13
GINS3-202ENST00000328514 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.86■□□□□ 0.13
GINS3-202ENST00000328514 NCAPD3P42695 1498 aa15.86■□□□□ 0.13
GINS3-202ENST00000328514 ANP32CO43423 234 aa15.86■□□□□ 0.13
GINS3-202ENST00000328514 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.86■□□□□ 0.13
GINS3-202ENST00000328514 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.85■□□□□ 0.13
GINS3-202ENST00000328514 ITGAEP38570 1179 aa15.84■□□□□ 0.13
GINS3-202ENST00000328514 CFTRP13569 1480 aa15.83■□□□□ 0.12
GINS3-202ENST00000328514 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.82■□□□□ 0.12
GINS3-202ENST00000328514 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.82■□□□□ 0.12
GINS3-202ENST00000328514 IGF1RP08069 1367 aa15.81■□□□□ 0.12
GINS3-202ENST00000328514 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.8■□□□□ 0.12
GINS3-202ENST00000328514 MSH5O43196 834 aa15.79■□□□□ 0.12
GINS3-202ENST00000328514 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.78■□□□□ 0.12
GINS3-202ENST00000328514 TRIM52Q96A61 297 aa15.78■□□□□ 0.12
GINS3-202ENST00000328514 OSCARQ8IYS5 282 aa15.75■□□□□ 0.11
GINS3-202ENST00000328514 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.74■□□□□ 0.11
GINS3-202ENST00000328514 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.74■□□□□ 0.11
GINS3-202ENST00000328514 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.74■□□□□ 0.11
GINS3-202ENST00000328514 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.74■□□□□ 0.11
GINS3-202ENST00000328514 PRDM2Q13029 1718 aa15.73■□□□□ 0.11
GINS3-202ENST00000328514 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.73■□□□□ 0.11
GINS3-202ENST00000328514 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
GINS3-202ENST00000328514 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.72■□□□□ 0.11
GINS3-202ENST00000328514 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.72■□□□□ 0.11
GINS3-202ENST00000328514 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
GINS3-202ENST00000328514 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
GINS3-202ENST00000328514 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.69■□□□□ 0.1
GINS3-202ENST00000328514 UACAQ9BZF9 1416 aa15.69■□□□□ 0.1
GINS3-202ENST00000328514 TONSLQ96HA7 1378 aa15.69■□□□□ 0.1
GINS3-202ENST00000328514 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
GINS3-202ENST00000328514 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.68■□□□□ 0.1
GINS3-202ENST00000328514 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.68■□□□□ 0.1
GINS3-202ENST00000328514 HFM1A2PYH4 1435 aa15.67■□□□□ 0.1
GINS3-202ENST00000328514 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.67■□□□□ 0.1
GINS3-202ENST00000328514 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.67■□□□□ 0.1
GINS3-202ENST00000328514 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.65■□□□□ 0.1
GINS3-202ENST00000328514 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
GINS3-202ENST00000328514 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.64■□□□□ 0.09
GINS3-202ENST00000328514 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.63■□□□□ 0.09
GINS3-202ENST00000328514 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.62■□□□□ 0.09
GINS3-202ENST00000328514 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.62■□□□□ 0.09
GINS3-202ENST00000328514 NCOA2Q15596 1464 aa15.61■□□□□ 0.09
GINS3-202ENST00000328514 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
GINS3-202ENST00000328514 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.59■□□□□ 0.09
GINS3-202ENST00000328514 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.58■□□□□ 0.08
GINS3-202ENST00000328514 WDR62O43379 1518 aa15.57■□□□□ 0.08
GINS3-202ENST00000328514 NAIPQ13075 1403 aa15.57■□□□□ 0.08
GINS3-202ENST00000328514 ARHGEF11O15085 1522 aa15.57■□□□□ 0.08
GINS3-202ENST00000328514 PTPRKQ15262 1439 aa15.56■□□□□ 0.08
GINS3-202ENST00000328514 FMN1Q68DA7 1419 aa15.55■□□□□ 0.08
GINS3-202ENST00000328514 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.54■□□□□ 0.08
GINS3-202ENST00000328514 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.54■□□□□ 0.08
GINS3-202ENST00000328514 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.54■□□□□ 0.08
GINS3-202ENST00000328514 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.53■□□□□ 0.08
GINS3-202ENST00000328514 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.51■□□□□ 0.07
GINS3-202ENST00000328514 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.51■□□□□ 0.07
GINS3-202ENST00000328514 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.5■□□□□ 0.07
GINS3-202ENST00000328514 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.5■□□□□ 0.07
GINS3-202ENST00000328514 CUL7Q14999 1698 aa15.49■□□□□ 0.07
GINS3-202ENST00000328514 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.49■□□□□ 0.07
GINS3-202ENST00000328514 HECW1Q76N89 1606 aa15.49■□□□□ 0.07
GINS3-202ENST00000328514 AKNAQ7Z591 1439 aa15.49■□□□□ 0.07
GINS3-202ENST00000328514 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.48■□□□□ 0.07
GINS3-202ENST00000328514 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GINS3-202ENST00000328514 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GINS3-202ENST00000328514 NCOA1Q15788 1441 aa15.47■□□□□ 0.07
GINS3-202ENST00000328514 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.45■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.45■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 SAMD9Q5K651 1589 aa15.44■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 DEKP35659 375 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 P3H3Q8IVL6 736 aa15.44■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.43■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.43■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 CCDC7Q96M83 1385 aa15.43■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 GRIN2BQ13224 1484 aa15.42■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.42■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.41■□□□□ 0.06
GINS3-202ENST00000328514 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms