RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325222.8

CUL1-201, Transcript of cullin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUL1, Length 3,064 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1-201ENST00000325222 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.78■□□□□ 0.92
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CUL1-201ENST00000325222 TIAM1Q13009 1591 aa20.75■□□□□ 0.91
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CUL1-201ENST00000325222 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.44■□□□□ 0.86
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CUL1-201ENST00000325222 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.32■□□□□ 0.84
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CUL1-201ENST00000325222 HFM1A2PYH4 1435 aa20.3■□□□□ 0.84
CUL1-201ENST00000325222 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.3■□□□□ 0.84
CUL1-201ENST00000325222 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.3■□□□□ 0.84
CUL1-201ENST00000325222 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.29■□□□□ 0.84
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CUL1-201ENST00000325222 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.25■□□□□ 0.83
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CUL1-201ENST00000325222 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.13■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.12■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.11■□□□□ 0.81
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CUL1-201ENST00000325222 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.1■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 KDM6BO15054 1643 aa20.09■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.09■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.08■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 GRIN2BQ13224 1484 aa20.08■□□□□ 0.8
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CUL1-201ENST00000325222 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.06■□□□□ 0.8
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CUL1-201ENST00000325222 HECW1Q76N89 1606 aa20■□□□□ 0.79
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CUL1-201ENST00000325222 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CUL1-201ENST00000325222 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
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