RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316615.9

GRB2-201, Transcript of growth factor receptor bound protein 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GRB2, Length 3,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRB2-201ENST00000316615 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.26■■□□□ 1.15
GRB2-201ENST00000316615 PRXQ9BXM0 1461 aa22.23■■□□□ 1.15
GRB2-201ENST00000316615 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.22■■□□□ 1.15
GRB2-201ENST00000316615 BCANQ96GW7 911 aa22.2■■□□□ 1.14
GRB2-201ENST00000316615 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
GRB2-201ENST00000316615 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.19■■□□□ 1.14
GRB2-201ENST00000316615 HMGXB3Q12766 1538 aa22.17■■□□□ 1.14
GRB2-201ENST00000316615 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.15■■□□□ 1.14
GRB2-201ENST00000316615 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GRB2-201ENST00000316615 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.09■■□□□ 1.13
GRB2-201ENST00000316615 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.08■■□□□ 1.12
GRB2-201ENST00000316615 TRIM52Q96A61 297 aa22.03■■□□□ 1.12
GRB2-201ENST00000316615 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
GRB2-201ENST00000316615 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.01■■□□□ 1.11
GRB2-201ENST00000316615 KCNH8Q96L42 1107 aa22■■□□□ 1.11
GRB2-201ENST00000316615 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GRB2-201ENST00000316615 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
GRB2-201ENST00000316615 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.99■■□□□ 1.11
GRB2-201ENST00000316615 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.98■■□□□ 1.11
GRB2-201ENST00000316615 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
GRB2-201ENST00000316615 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.117e-7■■■■■ 30.6
GRB2-201ENST00000316615 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.97■■□□□ 1.11
GRB2-201ENST00000316615 FOXD1Q16676 465 aa21.96■■□□□ 1.11
GRB2-201ENST00000316615 TOPBP1Q92547 1522 aa21.94■■□□□ 1.1
GRB2-201ENST00000316615 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.88■■□□□ 1.09
GRB2-201ENST00000316615 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.85■■□□□ 1.09
GRB2-201ENST00000316615 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
GRB2-201ENST00000316615 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.83■■□□□ 1.09
GRB2-201ENST00000316615 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.82■■□□□ 1.08
GRB2-201ENST00000316615 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
GRB2-201ENST00000316615 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
GRB2-201ENST00000316615 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
GRB2-201ENST00000316615 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.78■■□□□ 1.08
GRB2-201ENST00000316615 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.77■■□□□ 1.07
GRB2-201ENST00000316615 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
GRB2-201ENST00000316615 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.75■■□□□ 1.07
GRB2-201ENST00000316615 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.72■■□□□ 1.07
GRB2-201ENST00000316615 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.72■■□□□ 1.07
GRB2-201ENST00000316615 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
GRB2-201ENST00000316615 ERCC6Q03468 1493 aa21.68■■□□□ 1.06
GRB2-201ENST00000316615 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.68■■□□□ 1.06
GRB2-201ENST00000316615 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.67■■□□□ 1.06
GRB2-201ENST00000316615 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
GRB2-201ENST00000316615 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
GRB2-201ENST00000316615 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
GRB2-201ENST00000316615 FKBP8Q14318 412 aa21.66■■□□□ 1.06
GRB2-201ENST00000316615 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.65■■□□□ 1.06
GRB2-201ENST00000316615 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.63■■□□□ 1.05
GRB2-201ENST00000316615 TIAM1Q13009 1591 aa21.62■■□□□ 1.05
GRB2-201ENST00000316615 TONSLQ96HA7 1378 aa21.62■■□□□ 1.05
GRB2-201ENST00000316615 PTPRKQ15262 1439 aa21.55■■□□□ 1.04
GRB2-201ENST00000316615 FMN1Q68DA7 1419 aa21.54■■□□□ 1.04
GRB2-201ENST00000316615 MSH5O43196 834 aa21.52■■□□□ 1.04
GRB2-201ENST00000316615 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.5■■□□□ 1.03
GRB2-201ENST00000316615 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
GRB2-201ENST00000316615 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GRB2-201ENST00000316615 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.49■■□□□ 1.03
GRB2-201ENST00000316615 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.49■■□□□ 1.03
GRB2-201ENST00000316615 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GRB2-201ENST00000316615 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
GRB2-201ENST00000316615 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.48■■□□□ 1.03
GRB2-201ENST00000316615 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
GRB2-201ENST00000316615 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
GRB2-201ENST00000316615 NCOA2Q15596 1464 aa21.46■■□□□ 1.03
GRB2-201ENST00000316615 JPH4Q96JJ6 628 aa21.46■■□□□ 1.03
GRB2-201ENST00000316615 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.037e-8■■□□□ 12.7
GRB2-201ENST00000316615 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
GRB2-201ENST00000316615 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
GRB2-201ENST00000316615 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
GRB2-201ENST00000316615 WDR97A6NE52 1622 aa21.44■■□□□ 1.02
GRB2-201ENST00000316615 ANP32CO43423 234 aa21.42■■□□□ 1.02
GRB2-201ENST00000316615 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.42■■□□□ 1.02
GRB2-201ENST00000316615 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.41■■□□□ 1.02
GRB2-201ENST00000316615 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.41■■□□□ 1.02
GRB2-201ENST00000316615 NBR1Q14596 966 aa21.4■■□□□ 1.02
GRB2-201ENST00000316615 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GRB2-201ENST00000316615 MAPKBP1O60336 1514 aa21.4■■□□□ 1.02
GRB2-201ENST00000316615 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.39■■□□□ 1.01
GRB2-201ENST00000316615 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.38■■□□□ 1.01
GRB2-201ENST00000316615 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
GRB2-201ENST00000316615 NEFLP07196 543 aa21.37■■□□□ 1.01
GRB2-201ENST00000316615 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.37■■□□□ 1.01
GRB2-201ENST00000316615 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.011e-8■■■■□ 21.9
GRB2-201ENST00000316615 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.36■■□□□ 1.01
GRB2-201ENST00000316615 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
GRB2-201ENST00000316615 RGL3Q3MIN7 710 aa21.34■■□□□ 1.01
GRB2-201ENST00000316615 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
GRB2-201ENST00000316615 PRDM2Q13029 1718 aa21.34■■□□□ 1.01
GRB2-201ENST00000316615 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.33■■□□□ 1.01
GRB2-201ENST00000316615 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.33■■□□□ 1.01
GRB2-201ENST00000316615 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.32■■□□□ 1
GRB2-201ENST00000316615 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.32■■□□□ 1
GRB2-201ENST00000316615 GRIN2BQ13224 1484 aa21.29■■□□□ 1
GRB2-201ENST00000316615 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.28■■□□□ 1
GRB2-201ENST00000316615 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.28■■□□□ 1
GRB2-201ENST00000316615 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
GRB2-201ENST00000316615 NAIPQ13075 1403 aa21.26■□□□□ 0.99
GRB2-201ENST00000316615 PKD2Q13563 968 aa21.24■□□□□ 0.99
GRB2-201ENST00000316615 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
GRB2-201ENST00000316615 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
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