RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
SPNS1-201ENST00000311008 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.82■■■□□ 2.2
SPNS1-201ENST00000311008 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
SPNS1-201ENST00000311008 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
SPNS1-201ENST00000311008 WDR97A6NE52 1622 aa28.81■■■□□ 2.2
SPNS1-201ENST00000311008 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.8■■■□□ 2.2
SPNS1-201ENST00000311008 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.78■■■□□ 2.2
SPNS1-201ENST00000311008 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.77■■■□□ 2.2
SPNS1-201ENST00000311008 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.76■■■□□ 2.19
SPNS1-201ENST00000311008 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
SPNS1-201ENST00000311008 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
SPNS1-201ENST00000311008 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.72■■■□□ 2.19
SPNS1-201ENST00000311008 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.71■■■□□ 2.19
SPNS1-201ENST00000311008 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.69■■■□□ 2.18
SPNS1-201ENST00000311008 FMN1Q68DA7 1419 aa28.67■■■□□ 2.18
SPNS1-201ENST00000311008 NEUROD1Q13562 356 aa28.67■■■□□ 2.18
SPNS1-201ENST00000311008 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.66■■■□□ 2.18
SPNS1-201ENST00000311008 P3H3Q8IVL6 736 aa28.65■■■□□ 2.18
SPNS1-201ENST00000311008 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.65■■■□□ 2.18
SPNS1-201ENST00000311008 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.61■■■□□ 2.17
SPNS1-201ENST00000311008 ITGAEP38570 1179 aa28.61■■■□□ 2.17
SPNS1-201ENST00000311008 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.6■■■□□ 2.17
SPNS1-201ENST00000311008 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.6■■■□□ 2.17
SPNS1-201ENST00000311008 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SPNS1-201ENST00000311008 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
SPNS1-201ENST00000311008 SAMD9Q5K651 1589 aa28.55■■■□□ 2.16
SPNS1-201ENST00000311008 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.55■■■□□ 2.16
SPNS1-201ENST00000311008 MIER1Q8N108 512 aa28.53■■■□□ 2.16
SPNS1-201ENST00000311008 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.52■■■□□ 2.16
SPNS1-201ENST00000311008 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
SPNS1-201ENST00000311008 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
SPNS1-201ENST00000311008 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
SPNS1-201ENST00000311008 MAPKBP1O60336 1514 aa28.45■■■□□ 2.15
SPNS1-201ENST00000311008 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.42■■■□□ 2.14
SPNS1-201ENST00000311008 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.39■■■□□ 2.14
SPNS1-201ENST00000311008 GRIN2BQ13224 1484 aa28.39■■■□□ 2.13
SPNS1-201ENST00000311008 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.38■■■□□ 2.13
SPNS1-201ENST00000311008 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.37■■■□□ 2.13
SPNS1-201ENST00000311008 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.35■■■□□ 2.13
SPNS1-201ENST00000311008 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-201ENST00000311008 PBRM1Q86U86 1689 aa28.33■■■□□ 2.13
SPNS1-201ENST00000311008 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.3■■■□□ 2.12
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.28■■■□□ 2.12
SPNS1-201ENST00000311008 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SPNS1-201ENST00000311008 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-201ENST00000311008 ADAMTS12P58397 1594 aa28.26■■■□□ 2.12
SPNS1-201ENST00000311008 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
SPNS1-201ENST00000311008 NCOA2Q15596 1464 aa28.25■■■□□ 2.11
SPNS1-201ENST00000311008 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.25■■■□□ 2.11
SPNS1-201ENST00000311008 IQGAP2Q13576 1575 aa28.24■■■□□ 2.11
SPNS1-201ENST00000311008 HFM1A2PYH4 1435 aa28.2■■■□□ 2.1
SPNS1-201ENST00000311008 IFT140Q96RY7 1462 aa28.19■■■□□ 2.1
SPNS1-201ENST00000311008 HECW1Q76N89 1606 aa28.19■■■□□ 2.1
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF11O15085 1522 aa28.17■■■□□ 2.1
SPNS1-201ENST00000311008 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.17■■■□□ 2.1
SPNS1-201ENST00000311008 WDR62O43379 1518 aa28.13■■■□□ 2.09
SPNS1-201ENST00000311008 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.11■■■□□ 2.09
SPNS1-201ENST00000311008 UACAQ9BZF9 1416 aa28.11■■■□□ 2.09
SPNS1-201ENST00000311008 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.11■■■□□ 2.09
SPNS1-201ENST00000311008 MYT1Q01538 1121 aa28.1■■■□□ 2.09
SPNS1-201ENST00000311008 PTPRKQ15262 1439 aa28.09■■■□□ 2.09
SPNS1-201ENST00000311008 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
SPNS1-201ENST00000311008 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
SPNS1-201ENST00000311008 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.07■■■□□ 2.08
SPNS1-201ENST00000311008 NAIPQ13075 1403 aa28.06■■■□□ 2.08
SPNS1-201ENST00000311008 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.02■■■□□ 2.08
SPNS1-201ENST00000311008 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
SPNS1-201ENST00000311008 MIA2Q96PC5 1412 aa28.01■■■□□ 2.07
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
SPNS1-201ENST00000311008 AKNAQ7Z591 1439 aa27.98■■■□□ 2.07
SPNS1-201ENST00000311008 TONSLQ96HA7 1378 aa27.95■■■□□ 2.06
SPNS1-201ENST00000311008 KIAA0556O60303 1618 aa27.92■■■□□ 2.06
SPNS1-201ENST00000311008 GRIN2AQ12879 1464 aa27.91■■■□□ 2.06
SPNS1-201ENST00000311008 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
SPNS1-201ENST00000311008 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.91■■■□□ 2.06
SPNS1-201ENST00000311008 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
SPNS1-201ENST00000311008 DISP1Q96F81 1524 aa27.89■■■□□ 2.06
SPNS1-201ENST00000311008 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-201ENST00000311008 ERCC6Q03468 1493 aa27.83■■■□□ 2.05
SPNS1-201ENST00000311008 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-201ENST00000311008 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-201ENST00000311008 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
SPNS1-201ENST00000311008 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.79■■■□□ 2.04
SPNS1-201ENST00000311008 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
SPNS1-201ENST00000311008 ROCK1Q13464 1354 aa27.76■■■□□ 2.04
SPNS1-201ENST00000311008 SYNJ2O15056 1496 aa27.76■■■□□ 2.03
SPNS1-201ENST00000311008 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.75■■■□□ 2.03
SPNS1-201ENST00000311008 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
SPNS1-201ENST00000311008 DAPK1P53355 1430 aa27.7■■■□□ 2.03
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM52Q96A61 297 aa27.69■■■□□ 2.02
SPNS1-201ENST00000311008 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
SPNS1-201ENST00000311008 ARID3CA6NKF2 412 aa27.68■■■□□ 2.02
SPNS1-201ENST00000311008 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.68■■■□□ 2.02
SPNS1-201ENST00000311008 CEP170Q5SW79 1584 aa27.67■■■□□ 2.02
SPNS1-201ENST00000311008 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.66■■■□□ 2.02
SPNS1-201ENST00000311008 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
SPNS1-201ENST00000311008 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
SPNS1-201ENST00000311008 CCER2I3L3R5 266 aa27.65■■■□□ 2.02
SPNS1-201ENST00000311008 KDM6BO15054 1643 aa27.64■■■□□ 2.02
SPNS1-201ENST00000311008 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.64■■■□□ 2.01
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