RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.33■□□□□ 0.04
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CNGA3-201ENST00000272602 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGA3-201ENST00000272602 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNGA3-201ENST00000272602 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGA3-201ENST00000272602 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CNGA3-201ENST00000272602 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.93□□□□□ -0.02
CNGA3-201ENST00000272602 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.92□□□□□ -0.02
CNGA3-201ENST00000272602 TOP2BQ02880 1626 aa14.92□□□□□ -0.02
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CNGA3-201ENST00000272602 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
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CNGA3-201ENST00000272602 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
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CNGA3-201ENST00000272602 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.86□□□□□ -0.03
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CNGA3-201ENST00000272602 CCER2I3L3R5 266 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-201ENST00000272602 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-201ENST00000272602 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-201ENST00000272602 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-201ENST00000272602 GRIN2BQ13224 1484 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-201ENST00000272602 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.83□□□□□ -0.04
CNGA3-201ENST00000272602 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CNGA3-201ENST00000272602 ARAP1Q96P48 1450 aa14.81□□□□□ -0.04
CNGA3-201ENST00000272602 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.81□□□□□ -0.04
CNGA3-201ENST00000272602 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CNGA3-201ENST00000272602 PTPRGP23470 1445 aa14.8□□□□□ -0.04
CNGA3-201ENST00000272602 IFT140Q96RY7 1462 aa14.8□□□□□ -0.04
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CNGA3-201ENST00000272602 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-201ENST00000272602 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
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CNGA3-201ENST00000272602 TSPY4P0CV99 314 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-201ENST00000272602 TSPY10P0CW01 314 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-201ENST00000272602 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-201ENST00000272602 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-201ENST00000272602 PRXQ9BXM0 1461 aa14.77□□□□□ -0.05
CNGA3-201ENST00000272602 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.77□□□□□ -0.05
CNGA3-201ENST00000272602 TONSLQ96HA7 1378 aa14.76□□□□□ -0.05
CNGA3-201ENST00000272602 RGL3Q3MIN7 710 aa14.76□□□□□ -0.05
CNGA3-201ENST00000272602 KIF21BO75037 1637 aa14.76□□□□□ -0.05
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CNGA3-201ENST00000272602 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.75□□□□□ -0.05
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CNGA3-201ENST00000272602 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.74□□□□□ -0.05
CNGA3-201ENST00000272602 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CNGA3-201ENST00000272602 WDR97A6NE52 1622 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-201ENST00000272602 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-201ENST00000272602 GGT6Q6P531 493 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-201ENST00000272602 IL27Q8NEV9 243 aa14.71□□□□□ -0.05
CNGA3-201ENST00000272602 MRS2Q9HD23 443 aa14.71□□□□□ -0.06
CNGA3-201ENST00000272602 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
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