RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.43■■□□□ 1.34
CTCF-201ENST00000264010 TOPBP1Q92547 1522 aa23.4■■□□□ 1.34
CTCF-201ENST00000264010 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTCF-201ENST00000264010 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.39■■□□□ 1.34
CTCF-201ENST00000264010 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CTCF-201ENST00000264010 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.35■■□□□ 1.33
CTCF-201ENST00000264010 FMN1Q68DA7 1419 aa23.32■■□□□ 1.32
CTCF-201ENST00000264010 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.3■■□□□ 1.32
CTCF-201ENST00000264010 PRDM2Q13029 1718 aa23.29■■□□□ 1.32
CTCF-201ENST00000264010 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CTCF-201ENST00000264010 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.27■■□□□ 1.32
CTCF-201ENST00000264010 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CTCF-201ENST00000264010 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.26■■□□□ 1.31
CTCF-201ENST00000264010 FBLN2P98095 1184 aa23.26■■□□□ 1.31
CTCF-201ENST00000264010 ARID3CA6NKF2 412 aa23.25■■□□□ 1.31
CTCF-201ENST00000264010 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.23■■□□□ 1.31
CTCF-201ENST00000264010 MIER1Q8N108 512 aa23.23■■□□□ 1.31
CTCF-201ENST00000264010 TRIM52Q96A61 297 aa23.21■■□□□ 1.31
CTCF-201ENST00000264010 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.21■■□□□ 1.31
CTCF-201ENST00000264010 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.2■■□□□ 1.3
CTCF-201ENST00000264010 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CTCF-201ENST00000264010 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.15■■□□□ 1.3
CTCF-201ENST00000264010 TIAM1Q13009 1591 aa23.15■■□□□ 1.3
CTCF-201ENST00000264010 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.13■■□□□ 1.29
CTCF-201ENST00000264010 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CTCF-201ENST00000264010 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CTCF-201ENST00000264010 MAP3K1Q13233 1512 aa23.12■■□□□ 1.29
CTCF-201ENST00000264010 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.11■■□□□ 1.29
CTCF-201ENST00000264010 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.11■■□□□ 1.29
CTCF-201ENST00000264010 CUL7Q14999 1698 aa23.11■■□□□ 1.29
CTCF-201ENST00000264010 ERCC6Q03468 1493 aa23.11■■□□□ 1.29
CTCF-201ENST00000264010 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.1■■□□□ 1.29
CTCF-201ENST00000264010 TONSLQ96HA7 1378 aa23.09■■□□□ 1.29
CTCF-201ENST00000264010 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.07■■□□□ 1.28
CTCF-201ENST00000264010 BCANQ96GW7 911 aa23.06■■□□□ 1.28
CTCF-201ENST00000264010 BCL11AQ9H165 835 aa23.04■■□□□ 1.28
CTCF-201ENST00000264010 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.04■■□□□ 1.28
CTCF-201ENST00000264010 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.01■■□□□ 1.27
CTCF-201ENST00000264010 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23■■□□□ 1.27
CTCF-201ENST00000264010 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.272e-10■■■■■ 52.3
CTCF-201ENST00000264010 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CTCF-201ENST00000264010 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.98■■□□□ 1.27
CTCF-201ENST00000264010 NEFLP07196 543 aa22.95■■□□□ 1.26
CTCF-201ENST00000264010 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.94■■□□□ 1.26
CTCF-201ENST00000264010 GRIN2BQ13224 1484 aa22.94■■□□□ 1.26
CTCF-201ENST00000264010 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CTCF-201ENST00000264010 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CTCF-201ENST00000264010 ANP32CO43423 234 aa22.91■■□□□ 1.26
CTCF-201ENST00000264010 IFT140Q96RY7 1462 aa22.86■■□□□ 1.25
CTCF-201ENST00000264010 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 32.9
CTCF-201ENST00000264010 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.85■■□□□ 1.25
CTCF-201ENST00000264010 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.85■■□□□ 1.25
CTCF-201ENST00000264010 NCOA2Q15596 1464 aa22.83■■□□□ 1.25
CTCF-201ENST00000264010 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.81■■□□□ 1.24
CTCF-201ENST00000264010 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CTCF-201ENST00000264010 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CTCF-201ENST00000264010 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.78■■□□□ 1.24
CTCF-201ENST00000264010 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CTCF-201ENST00000264010 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.78■■□□□ 1.24
CTCF-201ENST00000264010 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.76■■□□□ 1.23
CTCF-201ENST00000264010 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.75■■□□□ 1.23
CTCF-201ENST00000264010 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.75■■□□□ 1.23
CTCF-201ENST00000264010 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.75■■□□□ 1.23
CTCF-201ENST00000264010 IQGAP2Q13576 1575 aa22.73■■□□□ 1.23
CTCF-201ENST00000264010 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTCF-201ENST00000264010 JPH4Q96JJ6 628 aa22.69■■□□□ 1.22
CTCF-201ENST00000264010 UACAQ9BZF9 1416 aa22.69■■□□□ 1.22
CTCF-201ENST00000264010 HECW1Q76N89 1606 aa22.69■■□□□ 1.22
CTCF-201ENST00000264010 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CTCF-201ENST00000264010 TSPY4P0CV99 314 aa22.68■■□□□ 1.22
CTCF-201ENST00000264010 TSPY10P0CW01 314 aa22.68■■□□□ 1.22
CTCF-201ENST00000264010 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.67■■□□□ 1.22
CTCF-201ENST00000264010 HFM1A2PYH4 1435 aa22.66■■□□□ 1.22
CTCF-201ENST00000264010 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.66■■□□□ 1.22
CTCF-201ENST00000264010 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.66■■□□□ 1.22
CTCF-201ENST00000264010 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CTCF-201ENST00000264010 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
CTCF-201ENST00000264010 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CTCF-201ENST00000264010 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.63■■□□□ 1.21
CTCF-201ENST00000264010 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CTCF-201ENST00000264010 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CTCF-201ENST00000264010 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CTCF-201ENST00000264010 MIA2Q96PC5 1412 aa22.59■■□□□ 1.21
CTCF-201ENST00000264010 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CTCF-201ENST00000264010 SAMD9Q5K651 1589 aa22.59■■□□□ 1.21
CTCF-201ENST00000264010 WDR97A6NE52 1622 aa22.58■■□□□ 1.21
CTCF-201ENST00000264010 ADAMTS12P58397 1594 aa22.58■■□□□ 1.2
CTCF-201ENST00000264010 NAIPQ13075 1403 aa22.56■■□□□ 1.2
CTCF-201ENST00000264010 MAPKBP1O60336 1514 aa22.56■■□□□ 1.2
CTCF-201ENST00000264010 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CTCF-201ENST00000264010 GRIN2AQ12879 1464 aa22.55■■□□□ 1.2
CTCF-201ENST00000264010 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.54■■□□□ 1.2
CTCF-201ENST00000264010 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.52■■□□□ 1.2
CTCF-201ENST00000264010 FOXD1Q16676 465 aa22.51■■□□□ 1.19
CTCF-201ENST00000264010 PBRM1Q86U86 1689 aa22.51■■□□□ 1.19
CTCF-201ENST00000264010 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CTCF-201ENST00000264010 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.5■■□□□ 1.19
CTCF-201ENST00000264010 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CTCF-201ENST00000264010 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.48■■□□□ 1.19
CTCF-201ENST00000264010 PTPRKQ15262 1439 aa22.47■■□□□ 1.19
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