RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249647.7

SNAP23-201, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAP23, Length 2,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-201ENST00000249647 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.56■■□□□ 1.68
SNAP23-201ENST00000249647 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SNAP23-201ENST00000249647 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.51■■□□□ 1.67
SNAP23-201ENST00000249647 MAPKBP1O60336 1514 aa25.51■■□□□ 1.67
SNAP23-201ENST00000249647 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.5■■□□□ 1.67
SNAP23-201ENST00000249647 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SNAP23-201ENST00000249647 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.49■■□□□ 1.67
SNAP23-201ENST00000249647 BCANQ96GW7 911 aa25.48■■□□□ 1.67
SNAP23-201ENST00000249647 IGF1RP08069 1367 aa25.47■■□□□ 1.67
SNAP23-201ENST00000249647 TOPBP1Q92547 1522 aa25.45■■□□□ 1.67
SNAP23-201ENST00000249647 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.43■■□□□ 1.66
SNAP23-201ENST00000249647 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.41■■□□□ 1.66
SNAP23-201ENST00000249647 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SNAP23-201ENST00000249647 TIAM1Q13009 1591 aa25.41■■□□□ 1.66
SNAP23-201ENST00000249647 FKBP8Q14318 412 aa25.4■■□□□ 1.66
SNAP23-201ENST00000249647 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SNAP23-201ENST00000249647 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.39■■□□□ 1.65
SNAP23-201ENST00000249647 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.38■■□□□ 1.65
SNAP23-201ENST00000249647 P3H3Q8IVL6 736 aa25.38■■□□□ 1.65
SNAP23-201ENST00000249647 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.38■■□□□ 1.65
SNAP23-201ENST00000249647 WDR97A6NE52 1622 aa25.37■■□□□ 1.65
SNAP23-201ENST00000249647 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SNAP23-201ENST00000249647 MAP3K1Q13233 1512 aa25.35■■□□□ 1.65
SNAP23-201ENST00000249647 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SNAP23-201ENST00000249647 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
SNAP23-201ENST00000249647 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.31■■□□□ 1.64
SNAP23-201ENST00000249647 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.28■■□□□ 1.64
SNAP23-201ENST00000249647 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.28■■□□□ 1.64
SNAP23-201ENST00000249647 TRIM52Q96A61 297 aa25.26■■□□□ 1.63
SNAP23-201ENST00000249647 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.26■■□□□ 1.63
SNAP23-201ENST00000249647 NEFLP07196 543 aa25.25■■□□□ 1.63
SNAP23-201ENST00000249647 ANP32CO43423 234 aa25.24■■□□□ 1.63
SNAP23-201ENST00000249647 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.23■■□□□ 1.63
SNAP23-201ENST00000249647 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.21■■□□□ 1.63
SNAP23-201ENST00000249647 CCER2I3L3R5 266 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAP23-201ENST00000249647 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.14■■□□□ 1.62
SNAP23-201ENST00000249647 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SNAP23-201ENST00000249647 WDR62O43379 1518 aa25.13■■□□□ 1.61
SNAP23-201ENST00000249647 TONSLQ96HA7 1378 aa25.1■■□□□ 1.61
SNAP23-201ENST00000249647 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SNAP23-201ENST00000249647 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SNAP23-201ENST00000249647 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.07■■□□□ 1.6
SNAP23-201ENST00000249647 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.05■■□□□ 1.6
SNAP23-201ENST00000249647 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
SNAP23-201ENST00000249647 ERCC6Q03468 1493 aa25.02■■□□□ 1.6
SNAP23-201ENST00000249647 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SNAP23-201ENST00000249647 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.01■■□□□ 1.59
SNAP23-201ENST00000249647 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.01■■□□□ 1.59
SNAP23-201ENST00000249647 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.98■■□□□ 1.59
SNAP23-201ENST00000249647 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.96■■□□□ 1.59
SNAP23-201ENST00000249647 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.96■■□□□ 1.59
SNAP23-201ENST00000249647 CUL7Q14999 1698 aa24.95■■□□□ 1.59
SNAP23-201ENST00000249647 IFT140Q96RY7 1462 aa24.95■■□□□ 1.58
SNAP23-201ENST00000249647 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.95■■□□□ 1.58
SNAP23-201ENST00000249647 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SNAP23-201ENST00000249647 PTPRKQ15262 1439 aa24.92■■□□□ 1.58
SNAP23-201ENST00000249647 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
SNAP23-201ENST00000249647 UACAQ9BZF9 1416 aa24.92■■□□□ 1.58
SNAP23-201ENST00000249647 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
SNAP23-201ENST00000249647 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.91■■□□□ 1.58
SNAP23-201ENST00000249647 HFM1A2PYH4 1435 aa24.9■■□□□ 1.58
SNAP23-201ENST00000249647 FMN1Q68DA7 1419 aa24.89■■□□□ 1.57
SNAP23-201ENST00000249647 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SNAP23-201ENST00000249647 NAIPQ13075 1403 aa24.82■■□□□ 1.56
SNAP23-201ENST00000249647 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.81■■□□□ 1.56
SNAP23-201ENST00000249647 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.79■■□□□ 1.56
SNAP23-201ENST00000249647 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.79■■□□□ 1.56
SNAP23-201ENST00000249647 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SNAP23-201ENST00000249647 PBRM1Q86U86 1689 aa24.78■■□□□ 1.56
SNAP23-201ENST00000249647 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.78■■□□□ 1.56
SNAP23-201ENST00000249647 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.77■■□□□ 1.56
SNAP23-201ENST00000249647 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SNAP23-201ENST00000249647 GRIN2BQ13224 1484 aa24.77■■□□□ 1.56
SNAP23-201ENST00000249647 NCOA2Q15596 1464 aa24.77■■□□□ 1.56
SNAP23-201ENST00000249647 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.76■■□□□ 1.55
SNAP23-201ENST00000249647 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SNAP23-201ENST00000249647 MSH5O43196 834 aa24.75■■□□□ 1.55
SNAP23-201ENST00000249647 BCL11AQ9H165 835 aa24.74■■□□□ 1.55
SNAP23-201ENST00000249647 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.71■■□□□ 1.55
SNAP23-201ENST00000249647 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
SNAP23-201ENST00000249647 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.69■■□□□ 1.54
SNAP23-201ENST00000249647 ADAMTS12P58397 1594 aa24.69■■□□□ 1.54
SNAP23-201ENST00000249647 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SNAP23-201ENST00000249647 CCDC184Q52MB2 194 aa24.67■■□□□ 1.54
SNAP23-201ENST00000249647 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.62■■□□□ 1.53
SNAP23-201ENST00000249647 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.62■■□□□ 1.53
SNAP23-201ENST00000249647 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.61■■□□□ 1.53
SNAP23-201ENST00000249647 FOXD1Q16676 465 aa24.59■■□□□ 1.53
SNAP23-201ENST00000249647 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.59■■□□□ 1.53
SNAP23-201ENST00000249647 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SNAP23-201ENST00000249647 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SNAP23-201ENST00000249647 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.59■■□□□ 1.53
SNAP23-201ENST00000249647 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.58■■□□□ 1.53
SNAP23-201ENST00000249647 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.58■■□□□ 1.52
SNAP23-201ENST00000249647 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.57■■□□□ 1.52
SNAP23-201ENST00000249647 SAMD9Q5K651 1589 aa24.57■■□□□ 1.52
SNAP23-201ENST00000249647 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.57■■□□□ 1.52
SNAP23-201ENST00000249647 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SNAP23-201ENST00000249647 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.56■■□□□ 1.52
SNAP23-201ENST00000249647 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
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