RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243918.9

SYS1-201, Transcript of SYS1, golgi trafficking protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYS1, Length 2,862 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-201ENST00000243918 TRIM52Q96A61 297 aa17.41■□□□□ 0.38
SYS1-201ENST00000243918 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SYS1-201ENST00000243918 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SYS1-201ENST00000243918 TIAM1Q13009 1591 aa17.4■□□□□ 0.38
SYS1-201ENST00000243918 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SYS1-201ENST00000243918 BCL11AQ9H165 835 aa17.39■□□□□ 0.37
SYS1-201ENST00000243918 PHLDB1Q86UU1 1377 aa17.38■□□□□ 0.37
SYS1-201ENST00000243918 CCER2I3L3R5 266 aa17.36■□□□□ 0.37
SYS1-201ENST00000243918 MAP3K1Q13233 1512 aa17.36■□□□□ 0.37
SYS1-201ENST00000243918 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17.36■□□□□ 0.37
SYS1-201ENST00000243918 ANP32CO43423 234 aa17.36■□□□□ 0.37
SYS1-201ENST00000243918 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa17.35■□□□□ 0.37
SYS1-201ENST00000243918 IGF1RP08069 1367 aa17.31■□□□□ 0.36
SYS1-201ENST00000243918 CFTRP13569 1480 aa17.28■□□□□ 0.36
SYS1-201ENST00000243918 NCAPD3P42695 1498 aa17.28■□□□□ 0.36
SYS1-201ENST00000243918 HMGXB3Q12766 1538 aa17.27■□□□□ 0.35
SYS1-201ENST00000243918 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SYS1-201ENST00000243918 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.26■□□□□ 0.35
SYS1-201ENST00000243918 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.24■□□□□ 0.35
SYS1-201ENST00000243918 P3H3Q8IVL6 736 aa17.23■□□□□ 0.35
SYS1-201ENST00000243918 TONSLQ96HA7 1378 aa17.21■□□□□ 0.35
SYS1-201ENST00000243918 MSH5O43196 834 aa17.2■□□□□ 0.34
SYS1-201ENST00000243918 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
SYS1-201ENST00000243918 CFAP43Q8NDM7 1665 aa17.18■□□□□ 0.34
SYS1-201ENST00000243918 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.17■□□□□ 0.34
SYS1-201ENST00000243918 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.34
SYS1-201ENST00000243918 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.34
SYS1-201ENST00000243918 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP17.14■□□□□ 0.33
SYS1-201ENST00000243918 FHOD3Q2V2M9 1422 aa17.13■□□□□ 0.33
SYS1-201ENST00000243918 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SYS1-201ENST00000243918 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.12■□□□□ 0.33
SYS1-201ENST00000243918 FANCIQ9NVI1 1328 aa17.11■□□□□ 0.33
SYS1-201ENST00000243918 CCDC18Q5T9S5 1454 aa17.1■□□□□ 0.33
SYS1-201ENST00000243918 FYCO1Q9BQS8 1478 aa17.09■□□□□ 0.33
SYS1-201ENST00000243918 FGD6Q6ZV73 1430 aa17.09■□□□□ 0.33
SYS1-201ENST00000243918 UACAQ9BZF9 1416 aa17.08■□□□□ 0.33
SYS1-201ENST00000243918 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa17.07■□□□□ 0.32
SYS1-201ENST00000243918 ERICH6Q7L0X2 663 aa17.06■□□□□ 0.32
SYS1-201ENST00000243918 HFM1A2PYH4 1435 aa17.06■□□□□ 0.32
SYS1-201ENST00000243918 PTPRKQ15262 1439 aa17.05■□□□□ 0.32
SYS1-201ENST00000243918 PRDM2Q13029 1718 aa17.03■□□□□ 0.32
SYS1-201ENST00000243918 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.02■□□□□ 0.32
SYS1-201ENST00000243918 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.02■□□□□ 0.32
SYS1-201ENST00000243918 WASHC2AQ641Q2 1341 aa17.01■□□□□ 0.31
SYS1-201ENST00000243918 MTUS2Q5JR59 1369 aa17.01■□□□□ 0.31
SYS1-201ENST00000243918 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.01■□□□□ 0.31
SYS1-201ENST00000243918 PTPN23Q9H3S7 1636 aa17■□□□□ 0.31
SYS1-201ENST00000243918 NAIPQ13075 1403 aa16.99■□□□□ 0.31
SYS1-201ENST00000243918 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.99■□□□□ 0.31
SYS1-201ENST00000243918 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SYS1-201ENST00000243918 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.99■□□□□ 0.31
SYS1-201ENST00000243918 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.98■□□□□ 0.31
SYS1-201ENST00000243918 FMN1Q68DA7 1419 aa16.97■□□□□ 0.31
SYS1-201ENST00000243918 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.96■□□□□ 0.31
SYS1-201ENST00000243918 CCDC184Q52MB2 194 aa16.96■□□□□ 0.31
SYS1-201ENST00000243918 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.93■□□□□ 0.3
SYS1-201ENST00000243918 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.93■□□□□ 0.3
SYS1-201ENST00000243918 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.92■□□□□ 0.3
SYS1-201ENST00000243918 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.92■□□□□ 0.3
SYS1-201ENST00000243918 NESP48681 1621 aa16.92■□□□□ 0.3
SYS1-201ENST00000243918 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa16.91■□□□□ 0.3
SYS1-201ENST00000243918 NCOA2Q15596 1464 aa16.91■□□□□ 0.3
SYS1-201ENST00000243918 FAM9BQ8IZU0 186 aa16.91■□□□□ 0.3
SYS1-201ENST00000243918 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.91■□□□□ 0.3
SYS1-201ENST00000243918 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.9■□□□□ 0.3
SYS1-201ENST00000243918 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
SYS1-201ENST00000243918 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.88■□□□□ 0.29
SYS1-201ENST00000243918 MRS2Q9HD23 443 aa16.88■□□□□ 0.29
SYS1-201ENST00000243918 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.87■□□□□ 0.29
SYS1-201ENST00000243918 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.87■□□□□ 0.29
SYS1-201ENST00000243918 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.86■□□□□ 0.29
SYS1-201ENST00000243918 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.86■□□□□ 0.29
SYS1-201ENST00000243918 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SYS1-201ENST00000243918 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.85■□□□□ 0.29
SYS1-201ENST00000243918 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SYS1-201ENST00000243918 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SYS1-201ENST00000243918 CCDC7Q96M83 1385 aa16.83■□□□□ 0.29
SYS1-201ENST00000243918 CUL7Q14999 1698 aa16.83■□□□□ 0.28
SYS1-201ENST00000243918 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.83■□□□□ 0.28
SYS1-201ENST00000243918 NCOA1Q15788 1441 aa16.82■□□□□ 0.28
SYS1-201ENST00000243918 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SYS1-201ENST00000243918 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.81■□□□□ 0.28
SYS1-201ENST00000243918 GRIN2BQ13224 1484 aa16.81■□□□□ 0.28
SYS1-201ENST00000243918 DEKP35659 375 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SYS1-201ENST00000243918 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.8■□□□□ 0.28
SYS1-201ENST00000243918 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.8■□□□□ 0.28
SYS1-201ENST00000243918 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.79■□□□□ 0.28
SYS1-201ENST00000243918 TOPBP1Q92547 1522 aa16.79■□□□□ 0.28
SYS1-201ENST00000243918 FOXD1Q16676 465 aa16.79■□□□□ 0.28
SYS1-201ENST00000243918 HECW1Q76N89 1606 aa16.78■□□□□ 0.28
SYS1-201ENST00000243918 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.78■□□□□ 0.28
SYS1-201ENST00000243918 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SYS1-201ENST00000243918 SAMD9Q5K651 1589 aa16.77■□□□□ 0.27
SYS1-201ENST00000243918 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SYS1-201ENST00000243918 KDM6BO15054 1643 aa16.75■□□□□ 0.27
SYS1-201ENST00000243918 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.74■□□□□ 0.27
SYS1-201ENST00000243918 ARHGEF11O15085 1522 aa16.74■□□□□ 0.27
SYS1-201ENST00000243918 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.74■□□□□ 0.27
SYS1-201ENST00000243918 NBR1Q14596 966 aa16.74■□□□□ 0.27
SYS1-201ENST00000243918 KIF7Q2M1P5 1343 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 159.4 ms