RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222271.6

COMP-201, Transcript of cartilage oligomeric matrix protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COMP, Length 2,461 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMP-201ENST00000222271 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
COMP-201ENST00000222271 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
COMP-201ENST00000222271 IGF1RP08069 1367 aa22.47■■□□□ 1.19
COMP-201ENST00000222271 IFT140Q96RY7 1462 aa22.45■■□□□ 1.18
COMP-201ENST00000222271 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.44■■□□□ 1.18
COMP-201ENST00000222271 PRXQ9BXM0 1461 aa22.43■■□□□ 1.18
COMP-201ENST00000222271 APLP2Q06481 763 aa22.43■■□□□ 1.18
COMP-201ENST00000222271 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.42■■□□□ 1.18
COMP-201ENST00000222271 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.4■■□□□ 1.18
COMP-201ENST00000222271 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.37■■□□□ 1.17
COMP-201ENST00000222271 MIER1Q8N108 512 aa22.36■■□□□ 1.17
COMP-201ENST00000222271 ARAP1Q96P48 1450 aa22.34■■□□□ 1.17
COMP-201ENST00000222271 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
COMP-201ENST00000222271 PBRM1Q86U86 1689 aa22.3■■□□□ 1.16
COMP-201ENST00000222271 GRIN2BQ13224 1484 aa22.26■■□□□ 1.15
COMP-201ENST00000222271 FBLN2P98095 1184 aa22.22■■□□□ 1.15
COMP-201ENST00000222271 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
COMP-201ENST00000222271 CUL7Q14999 1698 aa22.22■■□□□ 1.15
COMP-201ENST00000222271 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.22■■□□□ 1.15
COMP-201ENST00000222271 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.14■■□□□ 1.14
COMP-201ENST00000222271 ADAMTS12P58397 1594 aa22.14■■□□□ 1.13
COMP-201ENST00000222271 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.14■■□□□ 1.13
COMP-201ENST00000222271 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
COMP-201ENST00000222271 BCL11AQ9H165 835 aa22.11■■□□□ 1.13
COMP-201ENST00000222271 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.09■■□□□ 1.13
COMP-201ENST00000222271 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
COMP-201ENST00000222271 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
COMP-201ENST00000222271 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
COMP-201ENST00000222271 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
COMP-201ENST00000222271 P3H3Q8IVL6 736 aa22.03■■□□□ 1.12
COMP-201ENST00000222271 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.02■■□□□ 1.12
COMP-201ENST00000222271 SYNJ2O15056 1496 aa22.02■■□□□ 1.11
COMP-201ENST00000222271 GRIN2AQ12879 1464 aa22.01■■□□□ 1.11
COMP-201ENST00000222271 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.99■■□□□ 1.11
COMP-201ENST00000222271 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.99■■□□□ 1.11
COMP-201ENST00000222271 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.96■■□□□ 1.11
COMP-201ENST00000222271 CHD1O14646 1710 aa21.91■■□□□ 1.1
COMP-201ENST00000222271 TIAM1Q13009 1591 aa21.91■■□□□ 1.1
COMP-201ENST00000222271 CEP170Q5SW79 1584 aa21.9■■□□□ 1.1
COMP-201ENST00000222271 ITGAEP38570 1179 aa21.89■■□□□ 1.09
COMP-201ENST00000222271 IQGAP2Q13576 1575 aa21.86■■□□□ 1.09
COMP-201ENST00000222271 MAP3K1Q13233 1512 aa21.85■■□□□ 1.09
COMP-201ENST00000222271 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.84■■□□□ 1.09
COMP-201ENST00000222271 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.82■■□□□ 1.08
COMP-201ENST00000222271 NUP160Q12769 1436 aa21.81■■□□□ 1.08
COMP-201ENST00000222271 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.81■■□□□ 1.08
COMP-201ENST00000222271 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
COMP-201ENST00000222271 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
COMP-201ENST00000222271 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.77■■□□□ 1.08
COMP-201ENST00000222271 JPH4Q96JJ6 628 aa21.77■■□□□ 1.08
COMP-201ENST00000222271 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.76■■□□□ 1.07
COMP-201ENST00000222271 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.76■■□□□ 1.07
COMP-201ENST00000222271 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.72■■□□□ 1.07
COMP-201ENST00000222271 SAMD9Q5K651 1589 aa21.71■■□□□ 1.07
COMP-201ENST00000222271 MAPKBP1O60336 1514 aa21.71■■□□□ 1.07
COMP-201ENST00000222271 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.69■■□□□ 1.06
COMP-201ENST00000222271 DISP1Q96F81 1524 aa21.67■■□□□ 1.06
COMP-201ENST00000222271 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.67■■□□□ 1.06
COMP-201ENST00000222271 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
COMP-201ENST00000222271 ARID3CA6NKF2 412 aa21.65■■□□□ 1.06
COMP-201ENST00000222271 KIAA0556O60303 1618 aa21.64■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.63■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 OSCARQ8IYS5 282 aa21.61■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.61■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 FMN1Q68DA7 1419 aa21.59■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 BCANQ96GW7 911 aa21.59■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.59■■□□□ 1.05
COMP-201ENST00000222271 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.57■■□□□ 1.04
COMP-201ENST00000222271 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.57■■□□□ 1.04
COMP-201ENST00000222271 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.54■■□□□ 1.04
COMP-201ENST00000222271 KCNH8Q96L42 1107 aa21.53■■□□□ 1.04
COMP-201ENST00000222271 SHROOM2Q13796 1616 aa21.51■■□□□ 1.03
COMP-201ENST00000222271 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.49■■□□□ 1.03
COMP-201ENST00000222271 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.49■■□□□ 1.03
COMP-201ENST00000222271 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
COMP-201ENST00000222271 FKBP8Q14318 412 aa21.47■■□□□ 1.03
COMP-201ENST00000222271 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
COMP-201ENST00000222271 PTPRGP23470 1445 aa21.46■■□□□ 1.03
COMP-201ENST00000222271 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.45■■□□□ 1.02
COMP-201ENST00000222271 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.42■■□□□ 1.02
COMP-201ENST00000222271 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
COMP-201ENST00000222271 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.4■■□□□ 1.02
COMP-201ENST00000222271 HECW1Q76N89 1606 aa21.39■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 PTPRKQ15262 1439 aa21.38■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 NCOA2Q15596 1464 aa21.35■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.34■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.34■■□□□ 1.01
COMP-201ENST00000222271 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 MSH5O43196 834 aa21.32■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 ABCA8O94911 1581 aa21.31■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.31■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.31■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 HFM1A2PYH4 1435 aa21.3■■□□□ 1
COMP-201ENST00000222271 UACAQ9BZF9 1416 aa21.29■■□□□ 1
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