RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215570.7

TIMM13-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMM13, Length 1,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM13-201ENST00000215570 TOPBP1Q92547 1522 aa27.28■■□□□ 1.96
TIMM13-201ENST00000215570 ITGAEP38570 1179 aa27.28■■□□□ 1.96
TIMM13-201ENST00000215570 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.27■■□□□ 1.96
TIMM13-201ENST00000215570 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.26■■□□□ 1.95
TIMM13-201ENST00000215570 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.25■■□□□ 1.95
TIMM13-201ENST00000215570 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
TIMM13-201ENST00000215570 CUL7Q14999 1698 aa27.25■■□□□ 1.95
TIMM13-201ENST00000215570 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.22■■□□□ 1.95
TIMM13-201ENST00000215570 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.22■■□□□ 1.95
TIMM13-201ENST00000215570 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
TIMM13-201ENST00000215570 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.2■■□□□ 1.95
TIMM13-201ENST00000215570 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
TIMM13-201ENST00000215570 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.19■■□□□ 1.94
TIMM13-201ENST00000215570 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.16■■□□□ 1.94
TIMM13-201ENST00000215570 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.13■■□□□ 1.93
TIMM13-201ENST00000215570 P3H3Q8IVL6 736 aa27.13■■□□□ 1.93
TIMM13-201ENST00000215570 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.12■■□□□ 1.93
TIMM13-201ENST00000215570 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.12■■□□□ 1.932e-6■■■■□ 19.8
TIMM13-201ENST00000215570 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.12■■□□□ 1.93
TIMM13-201ENST00000215570 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
TIMM13-201ENST00000215570 MAPKBP1O60336 1514 aa27.11■■□□□ 1.93
TIMM13-201ENST00000215570 NESP48681 1621 aa27.1■■□□□ 1.93
TIMM13-201ENST00000215570 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
TIMM13-201ENST00000215570 FMN1Q68DA7 1419 aa27.09■■□□□ 1.93
TIMM13-201ENST00000215570 WDR97A6NE52 1622 aa27.03■■□□□ 1.92
TIMM13-201ENST00000215570 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.03■■□□□ 1.92
TIMM13-201ENST00000215570 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
TIMM13-201ENST00000215570 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.97■■□□□ 1.91
TIMM13-201ENST00000215570 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.96■■□□□ 1.91
TIMM13-201ENST00000215570 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.93■■□□□ 1.9
TIMM13-201ENST00000215570 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.93■■□□□ 1.9
TIMM13-201ENST00000215570 SAMD9Q5K651 1589 aa26.91■■□□□ 1.9
TIMM13-201ENST00000215570 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.91■■□□□ 1.9
TIMM13-201ENST00000215570 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.89■■□□□ 1.9
TIMM13-201ENST00000215570 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
TIMM13-201ENST00000215570 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
TIMM13-201ENST00000215570 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.84■■□□□ 1.89
TIMM13-201ENST00000215570 GRIN2BQ13224 1484 aa26.81■■□□□ 1.88
TIMM13-201ENST00000215570 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.77■■□□□ 1.88
TIMM13-201ENST00000215570 HFM1A2PYH4 1435 aa26.76■■□□□ 1.87
TIMM13-201ENST00000215570 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.76■■□□□ 1.87
TIMM13-201ENST00000215570 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.75■■□□□ 1.87
TIMM13-201ENST00000215570 NCOA2Q15596 1464 aa26.75■■□□□ 1.87
TIMM13-201ENST00000215570 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.74■■□□□ 1.87
TIMM13-201ENST00000215570 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
TIMM13-201ENST00000215570 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
TIMM13-201ENST00000215570 UACAQ9BZF9 1416 aa26.71■■□□□ 1.87
TIMM13-201ENST00000215570 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TIMM13-201ENST00000215570 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.71■■□□□ 1.87
TIMM13-201ENST00000215570 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.69■■□□□ 1.86
TIMM13-201ENST00000215570 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.68■■□□□ 1.86
TIMM13-201ENST00000215570 TONSLQ96HA7 1378 aa26.66■■□□□ 1.86
TIMM13-201ENST00000215570 PTPRKQ15262 1439 aa26.65■■□□□ 1.86
TIMM13-201ENST00000215570 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
TIMM13-201ENST00000215570 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.64■■□□□ 1.86
TIMM13-201ENST00000215570 NAIPQ13075 1403 aa26.63■■□□□ 1.85
TIMM13-201ENST00000215570 ARHGEF11O15085 1522 aa26.62■■□□□ 1.85
TIMM13-201ENST00000215570 HECW1Q76N89 1606 aa26.61■■□□□ 1.85
TIMM13-201ENST00000215570 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
TIMM13-201ENST00000215570 PBRM1Q86U86 1689 aa26.59■■□□□ 1.85
TIMM13-201ENST00000215570 IQGAP2Q13576 1575 aa26.58■■□□□ 1.85
TIMM13-201ENST00000215570 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
TIMM13-201ENST00000215570 ADAMTS12P58397 1594 aa26.53■■□□□ 1.84
TIMM13-201ENST00000215570 CCER2I3L3R5 266 aa26.53■■□□□ 1.84
TIMM13-201ENST00000215570 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.51■■□□□ 1.83
TIMM13-201ENST00000215570 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.51■■□□□ 1.83
TIMM13-201ENST00000215570 AKNAQ7Z591 1439 aa26.51■■□□□ 1.83
TIMM13-201ENST00000215570 KCNH8Q96L42 1107 aa26.5■■□□□ 1.83
TIMM13-201ENST00000215570 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
TIMM13-201ENST00000215570 MIA2Q96PC5 1412 aa26.5■■□□□ 1.83
TIMM13-201ENST00000215570 ANP32CO43423 234 aa26.49■■□□□ 1.83
TIMM13-201ENST00000215570 MYT1Q01538 1121 aa26.47■■□□□ 1.83
TIMM13-201ENST00000215570 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.45■■□□□ 1.83
TIMM13-201ENST00000215570 WDR62O43379 1518 aa26.43■■□□□ 1.82
TIMM13-201ENST00000215570 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
TIMM13-201ENST00000215570 IFT140Q96RY7 1462 aa26.4■■□□□ 1.82
TIMM13-201ENST00000215570 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.39■■□□□ 1.82
TIMM13-201ENST00000215570 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
TIMM13-201ENST00000215570 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.36■■□□□ 1.81
TIMM13-201ENST00000215570 TRIM52Q96A61 297 aa26.35■■□□□ 1.81
TIMM13-201ENST00000215570 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.33■■□□□ 1.81
TIMM13-201ENST00000215570 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.33■■□□□ 1.81
TIMM13-201ENST00000215570 ROCK1Q13464 1354 aa26.29■■□□□ 1.8
TIMM13-201ENST00000215570 KIAA0556O60303 1618 aa26.27■■□□□ 1.8
TIMM13-201ENST00000215570 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.27■■□□□ 1.8
TIMM13-201ENST00000215570 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
TIMM13-201ENST00000215570 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
TIMM13-201ENST00000215570 DISP1Q96F81 1524 aa26.24■■□□□ 1.79
TIMM13-201ENST00000215570 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
TIMM13-201ENST00000215570 DAPK1P53355 1430 aa26.22■■□□□ 1.79
TIMM13-201ENST00000215570 KDM6BO15054 1643 aa26.22■■□□□ 1.79
TIMM13-201ENST00000215570 NEFLP07196 543 aa26.21■■□□□ 1.79
TIMM13-201ENST00000215570 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.2■■□□□ 1.78
TIMM13-201ENST00000215570 GRIN2AQ12879 1464 aa26.19■■□□□ 1.78
TIMM13-201ENST00000215570 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.19■■□□□ 1.78
TIMM13-201ENST00000215570 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
TIMM13-201ENST00000215570 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
TIMM13-201ENST00000215570 ARID3CA6NKF2 412 aa26.18■■□□□ 1.78
TIMM13-201ENST00000215570 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
TIMM13-201ENST00000215570 FKBP8Q14318 412 aa26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms