RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 TWIST1Q15672 202 aa10.23□□□□□ -0.77
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SH3BP2-225ENST00000513069 KIAA1109Q2LD37 5005 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-225ENST00000513069 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10.22□□□□□ -0.77
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SH3BP2-225ENST00000513069 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.22□□□□□ -0.77
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SH3BP2-225ENST00000513069 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
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SH3BP2-225ENST00000513069 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa10.11□□□□□ -0.79
SH3BP2-225ENST00000513069 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.1□□□□□ -0.79
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SH3BP2-225ENST00000513069 KCNIP4Q6PIL6 250 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM243Q9BU79 118 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 TM2D2Q9BX73 214 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A1B0GXF2 115 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-225ENST00000513069 SMKR1H3BMG3 65 aa10.06□□□□□ -0.8
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SH3BP2-225ENST00000513069 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
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