RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 ISOC2Q96AB3 205 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRD-210ENST00000481079 CT83Q5H943 113 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 WDR73Q6P4I2 378 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 C15orf54Q8N8G6 183 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 GTSF1Q8WW33 167 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 SMIM17P0DL12 118 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 NTF3P20783 257 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 CTRLP40313 264 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 AP1S3Q96PC3 154 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 IGHV3-30P01768 117 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 IGHV3-33P01772 117 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 Q8N3U1 123 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 F5H697 171 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 EREGO14944 169 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 RAB4BP61018 213 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF56Q15929 161 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 OR10G8Q8NGN5 311 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 TWIST1Q15672 202 aa16.04■□□□□ 0.16
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PTPRD-210ENST00000481079 PGLYRP4Q96LB8 373 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 CNFNQ9BYD5 112 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 CDPF1Q6NVV7 123 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRD-210ENST00000481079 V9GYV3 84 aa16.03■□□□□ 0.16
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PTPRD-210ENST00000481079 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa16.01■□□□□ 0.15
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PTPRD-210ENST00000481079 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRD-210ENST00000481079 Q9HAA7 133 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRD-210ENST00000481079 FAM231BA6NCW3 169 aa16■□□□□ 0.15
PTPRD-210ENST00000481079 MGPP08493 103 aa16■□□□□ 0.15
PTPRD-210ENST00000481079 UQCC3Q6UW78 93 aa16■□□□□ 0.15
PTPRD-210ENST00000481079 HIGD1CA8MV81 97 aa15.99■□□□□ 0.15
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PTPRD-210ENST00000481079 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRD-210ENST00000481079 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRD-210ENST00000481079 PSCAO43653 123 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRD-210ENST00000481079 SMIM15Q7Z3B0 74 aa15.96■□□□□ 0.15
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PTPRD-210ENST00000481079 A0A1B0GUT8 65 aa15.95■□□□□ 0.14
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PTPRD-210ENST00000481079 NUP35Q8NFH5 326 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRD-210ENST00000481079 NAT8BQ9UHF3 227 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRD-210ENST00000481079 DNAH8Q96JB1 4490 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRD-210ENST00000481079 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRD-210ENST00000481079 LINC00862A6NCI5 91 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRD-210ENST00000481079 M0QY20 66 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRD-210ENST00000481079 H7C1H1 209 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRD-210ENST00000481079 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa15.91■□□□□ 0.14
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PTPRD-210ENST00000481079 XGP55808 180 aa15.91■□□□□ 0.14
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PTPRD-210ENST00000481079 Q8N814 137 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRD-210ENST00000481079 WFDC2Q14508 124 aa15.9■□□□□ 0.14
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PTPRD-210ENST00000481079 TM2D2Q9BX73 214 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRD-210ENST00000481079 MT-ND4LP03901 98 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 ADCYAP1P18509 176 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 RASL11AQ6T310 242 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 GCSHP23434 173 aa15.88■□□□□ 0.13
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PTPRD-210ENST00000481079 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 ANAPC16Q96DE5 110 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM191AQ9H0A3 160 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 GATD1Q8NB37 220 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 SEC11CQ9BY50 192 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 NIT2Q9NQR4 276 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 KLK12Q9UKR0 248 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 A0A087WX48 190 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRD-210ENST00000481079 CAMPP49913 170 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 ATRAIDQ6UW56 229 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 FRZBQ92765 325 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRD-210ENST00000481079 A0A1B0GW15 77 aa15.81■□□□□ 0.12
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