RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tmem100Q9CQG9 134 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm44501A8R0T9 150 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Irf2bp2E9Q1P8 570 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Il2raP01590 268 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Snrnp40Q6PE01 358 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Vmn1r216Q8R257 298 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CenpvQ9CXS4 252 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dock11A2AF47 2073 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 D830044I16RikA0A1D5RM53 117 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NgfP01139 241 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SbpP15501 199 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Prss44Q402U7 372 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr904Q7TRC9 310 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Srp19Q9D7A6 144 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Foxj2Q9ES18 565 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 St6galnac6Q9JM95 333 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 H2-Ab1P01921 265 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dynlt3P56387 116 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AdmP97297 184 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 RprmlQ3URD2 117 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cd200r1lQ6XJV6 249 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zfp420Q7TMN8 578 aa12.78□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zdhhc16Q9ESG8 361 aa12.77□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CirbpP60824 172 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AdoQ6PDY2 256 aa12.77□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Prelid3aQ8VE85 172 aa12.77□□□□□ -0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm10073E9Q3T0 114 aa12.77□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr263Q7TQT8 317 aa12.77□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 StrcQ8VIM6 1809 aa12.77□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ighv1-20A0A0A6YX66 117 aa12.77□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 ElaneQ3UP87 265 aa12.77□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Siglec12Q91Y57 467 aa12.77□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ighv7-2A0A0A6YX91 119 aa12.77□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ighv5-16A0A0B4J1P4 117 aa12.77□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cxcl13O55038 109 aa12.77□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Csrp1P97315 193 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Repin1Q5U4E2 545 aa12.77□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr1258Q8VGN6 311 aa12.77□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 RttnQ8R4Y8 2226 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SpxD3Z752 116 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ly6lH3BJG9 140 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SlaQ60898 281 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rbfox3Q8BIF2 374 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Avpi1Q9D7H4 142 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trav16A0A075B653 116 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm17430F6RSK3 157 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm21913J3KML9 361 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm21776J3QPJ5 361 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Loxl2P58022 776 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Shisa6Q3UH99 525 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm21974F6W3F3 119 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Elovl5Q8BHI7 299 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 BC106179Q8C9L1 186 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mcrip2Q9CQB2 160 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm21983D6RFS9 131 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 3110082J24RikF6Z6Z2 108 aa12.76□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Loxhd1C8YR32 2068 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Shisa3Q3UPR0 238 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm4792Q569Q2 183 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ndufaf3Q9JKL4 185 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dusp14Q9JLY7 198 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Itgb1bp1O35671 200 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sod1P08228 154 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 D130052B06RikQ3UW13 202 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Timm23Q9WTQ8 209 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Wdr86D3Z757 380 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm21874J3QNZ6 232 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr1419Q7TQS2 343 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SelenokQ9JLJ1 94 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Try10Q792Z1 246 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zg16Q8K0C5 167 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slc17a9Q8VCL5 447 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Necap2Q9D1J1 266 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Smim13E9Q942 88 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ca11O70354 328 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ypel2Q65Z95 119 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 D630044L22RikQ8C701 164 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Chchd1Q9CQA6 118 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ypel1Q9ESC7 118 aa12.75□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pglyrp3A1A547 347 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr148Q60887 310 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Prima1Q810F0 153 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ms4a8Q99N10 290 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Itgb4A2A863 1818 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Spink1P09036 80 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm21394Q497R7 227 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gpr132Q9Z282 382 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm28372A0A087WNV0 220 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 B1ARW8 110 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm17732E9Q5I2 61 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zfp977L7N2E7 438 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Efna4O08542 206 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Htr1dQ61224 374 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Morn2Q6UL01 79 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Iqcf6G3UWF2 157 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm17334Q8C6U3 126 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trav12d-1A0N8R0 115 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Neurog3P70661 214 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 RhogP84096 191 aa12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.3 ms