Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMN8

Zfp420, MCG144734, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp420Q7TMN8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Zfp420Q7TMN8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zfp420Q7TMN8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zfp420Q7TMN8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Zfp420Q7TMN8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zfp420Q7TMN8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfp420Q7TMN8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Zfp420Q7TMN8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp420Q7TMN8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp420Q7TMN8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zfp420Q7TMN8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zfp420Q7TMN8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfp420Q7TMN8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfp420Q7TMN8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfp420Q7TMN8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zfp420Q7TMN8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zfp420Q7TMN8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Zfp420Q7TMN8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp420Q7TMN8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp420Q7TMN8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp420Q7TMN8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zfp420Q7TMN8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp420Q7TMN8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp420Q7TMN8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp420Q7TMN8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zfp420Q7TMN8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp420Q7TMN8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp420Q7TMN8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp420Q7TMN8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp420Q7TMN8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp420Q7TMN8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp420Q7TMN8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp420Q7TMN8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp420Q7TMN8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp420Q7TMN8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp420Q7TMN8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp420Q7TMN8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp420Q7TMN8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp420Q7TMN8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp420Q7TMN8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp420Q7TMN8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp420Q7TMN8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp420Q7TMN8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp420Q7TMN8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp420Q7TMN8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp420Q7TMN8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp420Q7TMN8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp420Q7TMN8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp420Q7TMN8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp420Q7TMN8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp420Q7TMN8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp420Q7TMN8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp420Q7TMN8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp420Q7TMN8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp420Q7TMN8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp420Q7TMN8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp420Q7TMN8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp420Q7TMN8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp420Q7TMN8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp420Q7TMN8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp420Q7TMN8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp420Q7TMN8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp420Q7TMN8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp420Q7TMN8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp420Q7TMN8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp420Q7TMN8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp420Q7TMN8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp420Q7TMN8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp420Q7TMN8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp420Q7TMN8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp420Q7TMN8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp420Q7TMN8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp420Q7TMN8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp420Q7TMN8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp420Q7TMN8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp420Q7TMN8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp420Q7TMN8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp420Q7TMN8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp420Q7TMN8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp420Q7TMN8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp420Q7TMN8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp420Q7TMN8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp420Q7TMN8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp420Q7TMN8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp420Q7TMN8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp420Q7TMN8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp420Q7TMN8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp420Q7TMN8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp420Q7TMN8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp420Q7TMN8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp420Q7TMN8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp420Q7TMN8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp420Q7TMN8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp420Q7TMN8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp420Q7TMN8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp420Q7TMN8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp420Q7TMN8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp420Q7TMN8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp420Q7TMN8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp420Q7TMN8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms