RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027127.13

Sf3b1-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b1, Length 6,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Scrt1Q99M85 348 aa6.99□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr959Q9EQ86 311 aa6.99□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ighv9-3A0A0B4J1J5 117 aa6.99□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r78K7N608 313 aa6.99□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 BokO35425 213 aa6.99□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 P01783 136 aa6.99□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hoxa3P02831 443 aa6.99□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm9733Q1AN91 178 aa6.99□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rnase6Q9D244 153 aa6.99□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem183Q9JJB9 375 aa6.99□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Col27a1Q5QNQ9 1845 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Igkv1-132A0A0B4J1H9 120 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm21974F6W3F3 119 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hoxa5P09021 270 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ccl1P10146 92 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr481Q8VGI5 312 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Immp1lQ9CQU8 166 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmub1Q9JMG3 245 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ceacam15A0A0B4J1L0 234 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1191-ps1A0A1L1STD5 311 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1116E9PXB8 307 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sfrp2P97299 295 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cd200r3Q5UKY4 296 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Poc1aQ8JZX3 405 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rhbdd2Q8VEK2 361 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem238lA0A1B0GS74 79 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr177E9Q7W1 309 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr978E9Q985 311 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc25a17O70579 307 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm44596A0A0N4SVA0 210 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm5426J3QNM7 103 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rnf5O35445 180 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 TcapO70548 167 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Snrnp40Q6PE01 358 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Aqp11Q8BHH1 271 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Josd1Q9DBJ6 202 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 AplnrQ9WV08 377 aa6.98□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ighv4-1A0A075B5R5 116 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trbv19A0A0B4J1H4 117 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm5741B2RVA4 72 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm21616B6ZB74 166 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm4133K9J7G6 307 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Emp2O88662 172 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 P01723 117 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 P04212 136 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 TgfaP48030 159 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Foxc2Q61850 494 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cbln4Q8BME9 198 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ido2Q8R0V5 405 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Prr12E9PYL2 2035 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dock9Q8BIK4 2055 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ighv7-2A0A0A6YX91 119 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cnn1Q08091 297 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ube2d2bQ6ZWY6 147 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmed6Q9CQG0 239 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rnf115Q9D0C1 305 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ndufaf3Q9JKL4 185 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Spint5J3KMK8 105 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pate4Q09098 99 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1382Q7TQT3 311 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Glrx2Q923X4 156 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem170aQ9D342 144 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rnd2Q9QYM5 227 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Igkv1-131A0A140T8M8 120 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1336Q8VGH5 314 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gatad1Q920S3 266 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 MmdQ9CQY7 238 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tspo2Q9CRZ8 162 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gp2Q9D733 531 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r46Q9EQ45 309 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr961Q9EQ84 314 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm21913J3KML9 361 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm21776J3QPJ5 361 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm15292L7N231 93 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ptbp1P17225 527 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Prrx2Q06348 247 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm10192Q3V0S1 108 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Btf3Q64152 204 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cd52Q64389 74 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gpa33Q9JKA5 319 aa6.97□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trav4-4-dv10A0A075B651 110 aa6.96□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Scgb1b24B1B0N6 92 aa6.96□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Irf2bp2E9Q1P8 570 aa6.96□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nkx2-8O70584 235 aa6.96□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Srd5a2Q99N99 254 aa6.96□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Crim1Q9JLL0 1037 aa6.96□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 St6galnac6Q9JM95 333 aa6.96□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Efnb3O35393 340 aa6.96□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Khdc1bP0C7A0 126 aa6.96□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 C1qtnf5Q8K479 243 aa6.96□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 4931428L18RikQ9D4S9 127 aa6.96□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 H2al3Q9D4U4 128 aa6.96□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hdgfl3Q9JMG7 202 aa6.96□□□□□ -1.29
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1331K7N684 317 aa6.96□□□□□ -1.3
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cd3eP22646 189 aa6.96□□□□□ -1.3
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1333Q7TQV7 317 aa6.96□□□□□ -1.3
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Plppr2Q8VCY8 343 aa6.96□□□□□ -1.3
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr435Q8VFS3 313 aa6.96□□□□□ -1.3
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ndufb3Q9CQZ6 104 aa6.96□□□□□ -1.3
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Defb3Q9WTL0 63 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 64.5 ms