Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B651

Trav4-4-dv10, T cell receptor alpha variable 4-4-DV10 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-4-dv10A0A075B651 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trav4-4-dv10A0A075B651 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Trav4-4-dv10A0A075B651 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trav4-4-dv10A0A075B651 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trav4-4-dv10A0A075B651 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trav4-4-dv10A0A075B651 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trav4-4-dv10A0A075B651 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trav4-4-dv10A0A075B651 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trav4-4-dv10A0A075B651 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trav4-4-dv10A0A075B651 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trav4-4-dv10A0A075B651 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trav4-4-dv10A0A075B651 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trav4-4-dv10A0A075B651 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trav4-4-dv10A0A075B651 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trav4-4-dv10A0A075B651 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trav4-4-dv10A0A075B651 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trav4-4-dv10A0A075B651 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trav4-4-dv10A0A075B651 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trav4-4-dv10A0A075B651 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trav4-4-dv10A0A075B651 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trav4-4-dv10A0A075B651 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trav4-4-dv10A0A075B651 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trav4-4-dv10A0A075B651 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trav4-4-dv10A0A075B651 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trav4-4-dv10A0A075B651 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trav4-4-dv10A0A075B651 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trav4-4-dv10A0A075B651 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trav4-4-dv10A0A075B651 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trav4-4-dv10A0A075B651 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trav4-4-dv10A0A075B651 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trav4-4-dv10A0A075B651 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trav4-4-dv10A0A075B651 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trav4-4-dv10A0A075B651 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trav4-4-dv10A0A075B651 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trav4-4-dv10A0A075B651 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trav4-4-dv10A0A075B651 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trav4-4-dv10A0A075B651 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trav4-4-dv10A0A075B651 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trav4-4-dv10A0A075B651 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trav4-4-dv10A0A075B651 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trav4-4-dv10A0A075B651 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trav4-4-dv10A0A075B651 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trav4-4-dv10A0A075B651 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trav4-4-dv10A0A075B651 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trav4-4-dv10A0A075B651 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trav4-4-dv10A0A075B651 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trav4-4-dv10A0A075B651 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trav4-4-dv10A0A075B651 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trav4-4-dv10A0A075B651 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trav4-4-dv10A0A075B651 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trav4-4-dv10A0A075B651 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trav4-4-dv10A0A075B651 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trav4-4-dv10A0A075B651 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trav4-4-dv10A0A075B651 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trav4-4-dv10A0A075B651 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trav4-4-dv10A0A075B651 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trav4-4-dv10A0A075B651 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trav4-4-dv10A0A075B651 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trav4-4-dv10A0A075B651 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trav4-4-dv10A0A075B651 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trav4-4-dv10A0A075B651 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trav4-4-dv10A0A075B651 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trav4-4-dv10A0A075B651 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trav4-4-dv10A0A075B651 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trav4-4-dv10A0A075B651 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trav4-4-dv10A0A075B651 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trav4-4-dv10A0A075B651 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trav4-4-dv10A0A075B651 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trav4-4-dv10A0A075B651 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trav4-4-dv10A0A075B651 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trav4-4-dv10A0A075B651 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trav4-4-dv10A0A075B651 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trav4-4-dv10A0A075B651 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trav4-4-dv10A0A075B651 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trav4-4-dv10A0A075B651 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trav4-4-dv10A0A075B651 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trav4-4-dv10A0A075B651 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trav4-4-dv10A0A075B651 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trav4-4-dv10A0A075B651 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trav4-4-dv10A0A075B651 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trav4-4-dv10A0A075B651 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trav4-4-dv10A0A075B651 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trav4-4-dv10A0A075B651 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trav4-4-dv10A0A075B651 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trav4-4-dv10A0A075B651 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trav4-4-dv10A0A075B651 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trav4-4-dv10A0A075B651 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trav4-4-dv10A0A075B651 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trav4-4-dv10A0A075B651 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trav4-4-dv10A0A075B651 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trav4-4-dv10A0A075B651 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trav4-4-dv10A0A075B651 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trav4-4-dv10A0A075B651 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trav4-4-dv10A0A075B651 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trav4-4-dv10A0A075B651 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trav4-4-dv10A0A075B651 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav4-4-dv10A0A075B651 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trav4-4-dv10A0A075B651 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trav4-4-dv10A0A075B651 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trav4-4-dv10A0A075B651 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
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