Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1J5

Ighv9-3, Immunoglobulin heavy variable V9-3 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ighv9-3A0A0B4J1J5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ighv9-3A0A0B4J1J5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ighv9-3A0A0B4J1J5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ighv9-3A0A0B4J1J5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ighv9-3A0A0B4J1J5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ighv9-3A0A0B4J1J5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighv9-3A0A0B4J1J5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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