Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1J5

Ighv9-3, Immunoglobulin heavy variable V9-3 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,16■■■□□ 2,58
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ighv9-3A0A0B4J1J5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,46■■□□□ 1,99
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,08■■□□□ 1,77
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ighv9-3A0A0B4J1J5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ighv9-3A0A0B4J1J5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
Ighv9-3A0A0B4J1J5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,51■■□□□ 1,51
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,15■■□□□ 1,46
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,08■■□□□ 1,45
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,08■■□□□ 1,45
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,9■■□□□ 1,42
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,78■■□□□ 1,4
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,78■■□□□ 1,4
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ighv9-3A0A0B4J1J5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,55■■□□□ 1,36
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,46■■□□□ 1,35
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,41■■□□□ 1,34
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ighv9-3A0A0B4J1J5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ighv9-3A0A0B4J1J5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ighv9-3A0A0B4J1J5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
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