RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 CENPXA8MT69 81 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 PANO1I0J062 215 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 SEC11BP0C7V7 166 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 C14orf177Q52M58 125 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 KHDC3LQ587J8 217 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 PGPA6NDG6 321 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 UBE2WQ96B02 151 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 ASIPP42127 132 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 NMES1Q9C002 83 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRU-209ENST00000526080 A8MWV9 139 aa8.83□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 TAAR5O14804 337 aa8.83□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 PLA2G10O15496 165 aa8.83□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 IL7P13232 177 aa8.83□□□□□ -1
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PTPRU-209ENST00000526080 GNG5P63218 68 aa8.83□□□□□ -1
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PTPRU-209ENST00000526080 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.82□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 TAS2R45P59539 299 aa8.82□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 Q0VG73 95 aa8.82□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 ELOBQ15370 118 aa8.82□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.82□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 ENHOQ6UWT2 76 aa8.82□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.82□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.82□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 TRAV6A0A075B6T7 132 aa8.81□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 USP17L23D6RBM5 183 aa8.81□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 GCGP01275 180 aa8.81□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 TCRBP04435 133 aa8.81□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 PRSS1P07477 247 aa8.81□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.81□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.81□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 SGK494Q96LW2 274 aa8.81□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.81□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 JPT2Q9H910 190 aa8.81□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.81□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 A0A087WX48 190 aa8.8□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.8□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.8□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.8□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 NUDT15Q9NV35 164 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRU-209ENST00000526080 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.79□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 A0A0D9SG52 128 aa8.79□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.79□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 H0YIZ8 118 aa8.79□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 LYRM1O43325 122 aa8.79□□□□□ -1
PTPRU-209ENST00000526080 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
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PTPRU-209ENST00000526080 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRU-209ENST00000526080 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 SMUG1Q53HV7 270 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 LINC01600Q96MT4 127 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 HLA-DQA1P01909 254 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 UBE2D3P61077 147 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 UBE2D2P62837 147 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 MPV17L2Q567V2 206 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 IL36BQ9NZH7 164 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 CRPP02741 224 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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PTPRU-209ENST00000526080 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 SUN5Q8TC36 379 aa8.75□□□□□ -1.01
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PTPRU-209ENST00000526080 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.74□□□□□ -1.01
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PTPRU-209ENST00000526080 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 CCDC160A6NGH7 325 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 H3BVH4 76 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 SIX6O95475 246 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 RAB2AP61019 212 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 PRNTQ86SH4 94 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRU-209ENST00000526080 RNF185Q96GF1 192 aa8.73□□□□□ -1.01
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