RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P06335 190 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ercc1P07903 298 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdx1P18111 268 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Map2k4P47809 397 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CamlgP49070 294 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ApohQ01339 345 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdx4Q07424 282 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnase11Q5GAM9 192 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clns1aQ61189 236 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 March1Q6NZQ8 289 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scml4Q80VG1 408 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ubac2Q8R1K1 345 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aspscr1Q8VBT9 550 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Uxs1Q91XL3 420 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab29Q91YQ1 204 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gorasp2Q99JX3 451 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Elp5Q99L85 300 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnah17Q69Z23 4481 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp961E9Q4R5 444 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cldn34c3J3QJW5 233 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cldn34c2J3QNM1 233 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr117L7N1Z1 317 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lgals9O08573 353 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lgals3P16110 264 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ucp2P70406 309 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dhrs2Q149L0 282 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr688Q6W049 321 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TMEM229BQ8BFQ2 167 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cldn34c1Q8K193 234 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r228Q8R2A7 333 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr130Q8VFC1 317 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr410Q8VFX7 315 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr539Q8VGL9 319 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Etfrf1Q91V16 86 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nmnat3Q99JR6 245 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ufc1Q9CR09 167 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 3110018I06RikQ9CXS0 120 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ms4a4cQ9D3F6 226 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Naa60Q9DBU2 242 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 St6galnac5Q9QYJ1 336 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klk11Q9QYN3 276 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vma21-psA0A140T8R2 101 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Akirin2B1AXD8 201 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sult6b2B7ZWN4 290 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccl6P27784 116 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ewsr1Q61545 655 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 St8sia3Q64689 380 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tgfbr1Q64729 503 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Onecut2Q6XBJ3 505 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr823Q7TRH2 315 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ahsa1Q8BK64 338 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AdtrpQ8C138 230 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SbsnQ8CIT9 700 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr824Q8VFU4 315 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr401Q8VFX6 315 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MpiQ924M7 423 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ms4a6bQ99N09 244 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psma1Q9R1P4 263 aa8.35□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv7-2A0A0A6YX91 119 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A0A286YDM5 308 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20715E9Q3L7 95 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fhl2O70433 279 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ApcsP12246 224 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PvalbP32848 110 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ElobP62869 118 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ErhP84089 104 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pilrb2Q2YFS1 225 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SelenohQ3UQA7 116 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Reep5Q60870 185 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rasl11aQ6IMB1 242 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr923Q7TRB9 317 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dppa1Q810Y7 116 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IrgcQ8C262 412 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdcd10Q8VE70 212 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1151Q8VFQ8 308 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mgat4cQ9D306 478 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HpgdsQ9JHF7 199 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gstz1Q9WVL0 216 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trbv15A0A0A6YYE3 115 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-77A0A0G2JGS9 117 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem201A2A8U2 664 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm7075D3Z497 112 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr746E9Q840 314 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 2310050C09RikG5E8Z3 280 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nkx2-1P50220 372 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ear1P97426 155 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Txn2P97493 166 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lcn3Q62471 182 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nhlh2Q64221 135 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf740Q6NZQ6 180 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SepsecsQ6P6M7 504 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem230Q8CIB6 120 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il19Q8CJ70 176 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Habp2Q8K0D2 558 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gipc3Q8R5M0 297 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr810Q8VFH9 312 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1466Q8VFW4 310 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr73Q920P2 313 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 2610524H06RikQ9CZU9 139 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc107Q9DCC3 242 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.5 ms