Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Nkx2-1P50220 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
Nkx2-1P50220 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Nkx2-1P50220 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Nkx2-1P50220 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Nkx2-1P50220 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Nkx2-1P50220 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Nkx2-1P50220 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Nkx2-1P50220 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Nkx2-1P50220 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Nkx2-1P50220 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Nkx2-1P50220 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Nkx2-1P50220 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nkx2-1P50220 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nkx2-1P50220 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Nkx2-1P50220 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Nkx2-1P50220 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Nkx2-1P50220 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
Nkx2-1P50220 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Nkx2-1P50220 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
Nkx2-1P50220 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Nkx2-1P50220 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Nkx2-1P50220 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Nkx2-1P50220 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Nkx2-1P50220 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Nkx2-1P50220 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
Nkx2-1P50220 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Nkx2-1P50220 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Nkx2-1P50220 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Nkx2-1P50220 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
Nkx2-1P50220 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Nkx2-1P50220 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Nkx2-1P50220 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Nkx2-1P50220 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Nkx2-1P50220 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Nkx2-1P50220 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,09■■□□□ 1,45
Nkx2-1P50220 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,08■■□□□ 1,45
Nkx2-1P50220 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Nkx2-1P50220 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Nkx2-1P50220 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Nkx2-1P50220 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Nkx2-1P50220 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Nkx2-1P50220 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Nkx2-1P50220 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,94■■□□□ 1,42
Nkx2-1P50220 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Nkx2-1P50220 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Nkx2-1P50220 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Nkx2-1P50220 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Nkx2-1P50220 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Nkx2-1P50220 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Nkx2-1P50220 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Nkx2-1P50220 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Nkx2-1P50220 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Nkx2-1P50220 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Nkx2-1P50220 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,55■■□□□ 1,36
Nkx2-1P50220 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Nkx2-1P50220 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Nkx2-1P50220 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Nkx2-1P50220 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Nkx2-1P50220 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Nkx2-1P50220 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Nkx2-1P50220 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Nkx2-1P50220 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,33■■□□□ 1,32
Nkx2-1P50220 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Nkx2-1P50220 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,29■■□□□ 1,32
Nkx2-1P50220 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Nkx2-1P50220 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Nkx2-1P50220 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Nkx2-1P50220 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Nkx2-1P50220 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Nkx2-1P50220 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Nkx2-1P50220 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Nkx2-1P50220 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Nkx2-1P50220 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Nkx2-1P50220 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Nkx2-1P50220 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Nkx2-1P50220 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Nkx2-1P50220 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Nkx2-1P50220 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Nkx2-1P50220 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Nkx2-1P50220 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Nkx2-1P50220 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Nkx2-1P50220 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Nkx2-1P50220 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Nkx2-1P50220 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,88■■□□□ 1,25
Nkx2-1P50220 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Nkx2-1P50220 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Nkx2-1P50220 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,79■■□□□ 1,24
Nkx2-1P50220 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Nkx2-1P50220 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Nkx2-1P50220 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Nkx2-1P50220 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Nkx2-1P50220 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Nkx2-1P50220 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Nkx2-1P50220 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Nkx2-1P50220 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Nkx2-1P50220 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,2
Nkx2-1P50220 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Nkx2-1P50220 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Nkx2-1P50220 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,1 ms