RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr87Q99MT7 358 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrpl54Q9CPW3 135 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ndufa13Q9ERS2 144 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Elovl1Q9JLJ5 279 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-39A0A075B5V5 117 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Esp6A8R0U0 136 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tomm5B1AXP6 51 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem262D3Z338 116 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccnb1ip1D3Z3K2 276 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm9732F6QVC4 198 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6460F6YJZ8 199 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8104K7N744 198 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhox6O70238 227 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcte3P11985 191 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gsc2P56916 198 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CenptQ3TJM4 515 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav8d-1Q5R1H8 112 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ang2Q64438 145 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zc4h2Q68FG0 224 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il22ra1Q80XZ4 581 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr523Q8VFE7 317 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Isoc1Q91V64 297 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc167Q9D162 97 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tspan4Q9DCK3 238 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cxcr6Q9EQ16 351 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klf13Q9JJZ6 289 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mpdu1Q9R0Q9 247 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-52A0A0A6YXC3 117 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr587-ps1A0A1B0GSS1 159 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv4-51A0N8I8 119 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930402F06RikA2AUQ8 332 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r232A2RTT5 351 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lipo5F6QKH6 233 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3443F7CCV5 94 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm4791J3QQ14 102 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EndogO08600 294 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Csn1s1P19228 313 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CtdsplP58465 276 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nr2c2apQ3TV70 140 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Jagn1Q5XKN4 183 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CrygcQ61597 174 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tbpl2Q6SJ95 350 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1106Q7TR57 312 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pygo2Q80V76 405 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tor2aQ8R1J9 321 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr794Q8VF26 320 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q99LU8 229 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc24a3Q99PD7 645 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ceacam18Q9D871 376 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hoga1Q9DCU9 321 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dtd1Q9DD18 209 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Crybb3Q9JJU9 211 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psmb3Q9R1P1 205 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ly6g6cQ9Z1Q4 126 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnah7cA0A087WR13 4024 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scgb1b24B1B0N6 92 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10036E9PYL9 178 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp820E9Q5G8 549 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21970F6XX07 295 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6882J3KMT3 313 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5294J3QP53 216 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-M10.1O19443 331 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01915 264 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mup3P04939 184 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fabp6P51162 128 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dynlt3P56387 116 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10662Q3UT86 313 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rasl2-9Q61820 216 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stoml3Q6PE84 287 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam206aQ80ZQ9 193 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1271Q8VG62 305 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SNORCQ9CXL7 121 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PigcQ9CXR4 297 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arv1Q9D0U9 266 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mapk1ip1Q9D7G9 263 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EppinQ9DA01 134 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dynlrb2Q9DAJ5 96 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9DAL9 119 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P2ry14Q9ESG6 338 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cbln1Q9R171 193 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-67A0A0G2JFN9 117 aa8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1189A2AV11 306 aa8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h1bP43276 223 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mcpt8P43430 247 aa8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spam1P48794 512 aa8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HrkP62816 92 aa8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prrc1Q3UPH1 443 aa8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf474Q6V5K9 347 aa8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1472Q7TQQ9 314 aa8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ifna16Q810G1 189 aa8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FevQ8QZW2 237 aa8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp6v0bQ91V37 205 aa8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TsnaxQ9QZE7 290 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcrg-C4A0A075B6C7 190 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1436A0PK57 315 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BC030500E9Q6W0 185 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr707K7N662 307 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sult2a4L7N245 285 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01881 257 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.8 ms