Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rhox6O70238 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rhox6O70238 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Rhox6O70238 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rhox6O70238 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rhox6O70238 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Rhox6O70238 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rhox6O70238 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhox6O70238 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rhox6O70238 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox6O70238 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rhox6O70238 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox6O70238 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rhox6O70238 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rhox6O70238 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox6O70238 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rhox6O70238 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rhox6O70238 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox6O70238 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rhox6O70238 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rhox6O70238 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rhox6O70238 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rhox6O70238 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rhox6O70238 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rhox6O70238 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rhox6O70238 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rhox6O70238 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rhox6O70238 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rhox6O70238 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rhox6O70238 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rhox6O70238 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rhox6O70238 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rhox6O70238 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rhox6O70238 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rhox6O70238 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rhox6O70238 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rhox6O70238 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rhox6O70238 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rhox6O70238 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rhox6O70238 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rhox6O70238 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rhox6O70238 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rhox6O70238 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rhox6O70238 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rhox6O70238 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rhox6O70238 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rhox6O70238 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rhox6O70238 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rhox6O70238 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rhox6O70238 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rhox6O70238 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rhox6O70238 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rhox6O70238 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rhox6O70238 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rhox6O70238 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rhox6O70238 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rhox6O70238 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rhox6O70238 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rhox6O70238 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rhox6O70238 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rhox6O70238 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rhox6O70238 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rhox6O70238 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rhox6O70238 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhox6O70238 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rhox6O70238 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rhox6O70238 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rhox6O70238 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rhox6O70238 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rhox6O70238 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rhox6O70238 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rhox6O70238 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rhox6O70238 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rhox6O70238 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rhox6O70238 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rhox6O70238 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rhox6O70238 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rhox6O70238 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rhox6O70238 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhox6O70238 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rhox6O70238 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rhox6O70238 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rhox6O70238 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rhox6O70238 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rhox6O70238 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rhox6O70238 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rhox6O70238 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rhox6O70238 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rhox6O70238 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rhox6O70238 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rhox6O70238 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rhox6O70238 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rhox6O70238 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rhox6O70238 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rhox6O70238 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhox6O70238 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rhox6O70238 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhox6O70238 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhox6O70238 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhox6O70238 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms