Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Csn1s1P19228 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Csn1s1P19228 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Csn1s1P19228 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Csn1s1P19228 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Csn1s1P19228 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Csn1s1P19228 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Csn1s1P19228 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Csn1s1P19228 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Csn1s1P19228 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Csn1s1P19228 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Csn1s1P19228 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Csn1s1P19228 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Csn1s1P19228 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Csn1s1P19228 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Csn1s1P19228 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Csn1s1P19228 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csn1s1P19228 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csn1s1P19228 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Csn1s1P19228 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Csn1s1P19228 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Csn1s1P19228 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csn1s1P19228 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csn1s1P19228 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Csn1s1P19228 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Csn1s1P19228 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csn1s1P19228 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Csn1s1P19228 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Csn1s1P19228 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Csn1s1P19228 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Csn1s1P19228 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Csn1s1P19228 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Csn1s1P19228 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Csn1s1P19228 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Csn1s1P19228 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Csn1s1P19228 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Csn1s1P19228 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Csn1s1P19228 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Csn1s1P19228 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Csn1s1P19228 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Csn1s1P19228 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Csn1s1P19228 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Csn1s1P19228 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Csn1s1P19228 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Csn1s1P19228 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Csn1s1P19228 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Csn1s1P19228 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Csn1s1P19228 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Csn1s1P19228 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Csn1s1P19228 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csn1s1P19228 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Csn1s1P19228 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csn1s1P19228 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Csn1s1P19228 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Csn1s1P19228 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Csn1s1P19228 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Csn1s1P19228 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csn1s1P19228 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csn1s1P19228 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csn1s1P19228 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csn1s1P19228 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csn1s1P19228 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csn1s1P19228 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csn1s1P19228 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csn1s1P19228 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Csn1s1P19228 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Csn1s1P19228 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csn1s1P19228 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csn1s1P19228 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csn1s1P19228 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csn1s1P19228 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csn1s1P19228 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csn1s1P19228 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Csn1s1P19228 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Csn1s1P19228 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csn1s1P19228 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csn1s1P19228 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csn1s1P19228 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csn1s1P19228 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csn1s1P19228 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csn1s1P19228 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csn1s1P19228 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Csn1s1P19228 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Csn1s1P19228 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csn1s1P19228 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csn1s1P19228 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csn1s1P19228 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csn1s1P19228 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csn1s1P19228 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csn1s1P19228 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csn1s1P19228 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csn1s1P19228 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csn1s1P19228 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csn1s1P19228 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csn1s1P19228 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csn1s1P19228 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csn1s1P19228 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csn1s1P19228 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csn1s1P19228 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csn1s1P19228 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms