RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 P04219 140 aa9.51□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cox7a2P48771 83 aa9.51□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnajc30P59041 219 aa9.51□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rtl4Q3URY0 304 aa9.51□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav6-3Q5R1E6 112 aa9.51□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r222Q8R269 308 aa9.51□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r226Q8R2A8 298 aa9.51□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1444Q8VFX2 319 aa9.51□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mpped1Q91ZG2 326 aa9.51□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bin3Q9JI08 253 aa9.51□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pxmp4Q9JJW0 212 aa9.51□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gdf15Q9Z0J7 303 aa9.51□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav6-1A0A075B5Z8 112 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd79bP15530 228 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lgals3P16110 264 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 ErhP84089 104 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 FuomQ8R2K1 153 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1370Q8VFG4 316 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr206Q8VGP9 306 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf141Q99MB7 230 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 DeddQ9Z1L3 318 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm12887B1AVM1 119 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01803 113 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 B2mP01887 119 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sssca1P56873 199 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdk2P97377 346 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 CenptQ3TJM4 515 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm648Q3UJ22 213 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm1673Q3UR78 90 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf150Q5DTZ6 437 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Patz1Q5NBY9 687 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zc2hc1aQ8BJH1 324 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm9913Q8BQQ2 135 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ercc8Q8CFD5 397 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Med6Q921D4 246 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 FibinQ9CQS3 217 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r50Q9EP51 310 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Opn3Q9WUK7 400 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ncoa6Q9JL19 2067 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr399Q7TRX3 311 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ifna12Q80SS5 189 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mmp28Q8CGV8 520 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc50a1Q9CXK4 221 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrpl30Q9D7N6 160 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cmya5Q70KF4 3739 aa9.5□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1289A0A288CFY5 326 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm11565A2A4M7 156 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm6904E9PVF1 202 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr177E9Q7W1 309 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 1700067P10RikG3X8U2 183 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr141Q60880 325 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tceal8Q9CZY2 117 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tsc22d3Q9Z2S7 137 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Svep1A2AVA0 3567 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv1-20A0A0A6YX66 117 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv7-2A0A0A6YX91 119 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr364-ps1A0A140T8Q2 307 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defb2P82020 71 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam3dP97805 223 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd52Q64389 74 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Elovl6Q920L5 267 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930467E23RikD3Z1P8 350 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm15319E9Q637 350 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1204Q7TR10 309 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm21119Q8C646 350 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr513Q8VFZ3 309 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr916Q8VG53 310 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1413Q8VGU3 323 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 PpifQ99KR7 206 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp1r1aQ9ERT9 171 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr154Q9QY00 318 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pus1Q9WU56 423 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 ArtnQ9Z0L2 224 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gab2Q9Z1S8 665 aa9.49□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm45871A0A1B0GRI9 540 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr191L7N1Z8 309 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 ApcsP12246 224 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prkar2aP12367 401 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ube2e1P52482 193 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 MidnQ3TPJ7 465 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1290Q7TQX8 312 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Exosc2Q8VBV3 293 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lelp1Q9DAE3 120 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mixl1Q9WUI0 231 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 LenepQ9WVB6 61 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Osr1Q9WVG7 266 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r78K7N608 313 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hoxa1P09022 331 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 PmchP56942 165 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 MffQ6PCP5 291 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cacfd1Q8BG21 171 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q8BN57 294 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r211Q8R266 298 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr476Q8VGI4 310 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prss22Q9ER10 306 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plekha2Q9ERS5 425 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm12728V9GX31 77 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr893K7N678 312 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cldn1O88551 211 aa9.48□□□□□ -0.89
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem95P0DJF3 176 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 67.2 ms