Protein–RNA interactions for Protein: P59041

Dnajc30, DnaJ homolog subfamily C member 30, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc30P59041 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Dnajc30P59041 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dnajc30P59041 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Dnajc30P59041 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnajc30P59041 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnajc30P59041 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnajc30P59041 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Dnajc30P59041 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnajc30P59041 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnajc30P59041 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnajc30P59041 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnajc30P59041 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnajc30P59041 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnajc30P59041 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnajc30P59041 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Dnajc30P59041 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnajc30P59041 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnajc30P59041 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnajc30P59041 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnajc30P59041 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnajc30P59041 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnajc30P59041 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnajc30P59041 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnajc30P59041 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc30P59041 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajc30P59041 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnajc30P59041 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajc30P59041 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnajc30P59041 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc30P59041 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajc30P59041 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc30P59041 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc30P59041 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajc30P59041 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajc30P59041 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajc30P59041 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajc30P59041 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnajc30P59041 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc30P59041 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc30P59041 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc30P59041 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnajc30P59041 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnajc30P59041 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnajc30P59041 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc30P59041 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc30P59041 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc30P59041 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc30P59041 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc30P59041 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnajc30P59041 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnajc30P59041 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnajc30P59041 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajc30P59041 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnajc30P59041 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc30P59041 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajc30P59041 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc30P59041 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc30P59041 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc30P59041 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajc30P59041 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnajc30P59041 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc30P59041 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnajc30P59041 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnajc30P59041 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnajc30P59041 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajc30P59041 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnajc30P59041 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnajc30P59041 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajc30P59041 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc30P59041 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc30P59041 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajc30P59041 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc30P59041 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dnajc30P59041 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc30P59041 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnajc30P59041 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc30P59041 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc30P59041 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc30P59041 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc30P59041 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc30P59041 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajc30P59041 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajc30P59041 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajc30P59041 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajc30P59041 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajc30P59041 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnajc30P59041 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajc30P59041 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajc30P59041 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajc30P59041 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajc30P59041 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajc30P59041 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc30P59041 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc30P59041 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc30P59041 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajc30P59041 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc30P59041 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnajc30P59041 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc30P59041 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc30P59041 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms