RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Srrm4Q8BKA3 608 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Wfdc21Q8BTE6 63 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr873Q8VFJ0 319 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cacng8Q8VHW2 423 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ctxnd1A0A1B0GST9 59 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Obp2bA2BHR0 176 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr747E9PXH6 313 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 FusP56959 518 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Defb33Q30KN3 62 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr876Q7TRE4 310 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zfp119bQ8K0G9 543 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ttc32Q9DAC7 148 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr1293-psA0A1L1SVB5 326 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ighv9-2A0A0B4J1J4 117 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SepsecsQ6P6M7 504 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 HaaoQ78JT3 286 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccl28Q9JIL2 130 aa13.16□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Treml4Q3LRV9 263 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Apobec4Q497M3 374 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr987Q7TRA2 309 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ntn3Q9R1A3 580 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Lnp1A0A1B0GSK3 178 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rom1P32958 351 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zfp92Q62396 488 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Scnm1Q8K136 229 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Malsu1Q9CWV0 228 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trav15-2-dv6-2A0A075B650 123 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Foxn4Q8K3Q3 521 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slc37a1Q8R070 531 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Prss41Q920S2 322 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cldn10Q9Z0S6 231 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gstp1P19157 210 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rbfox2Q8BP71 449 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cldn16Q925N4 235 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gar1Q9CY66 231 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm10666K7N6B8 321 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Znf48Q3US17 591 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr1339Q8VGB1 315 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Neurl1Q923S6 574 aa13.15□□□□□ -0.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 TskuQ8CBR6 354 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fcrl1Q8R4Y0 343 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ighv1-13A0A075B5I0 98 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr1214A2ATG3 311 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sult2a4L7N245 285 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sox15P43267 231 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 ElobP62869 118 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Herpud1Q9JJK5 391 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slc17a3G3UWD9 498 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Vdac1Q60932 296 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Q8VCE4 163 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr1441Q8VFV3 318 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dctn5Q9QZB9 182 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Defa30E9QPZ2 93 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 FmodP50608 376 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mrgprb2Q3KNA1 338 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Smim9Q3V0X1 137 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sfxn3Q91V61 321 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Defb3Q9WTL0 63 aa13.14□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Platr25A0A1Y7VIZ1 466 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fndc7A2AED3 737 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fam240aJ3QNP9 97 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slc25a17O70579 307 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ca2P00920 260 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dhrs7cQ8CHS7 311 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 C1qtnf4Q8R066 326 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ighv14-2A0A075B5R7 117 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Scgb1b15A0A087WP50 93 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Igf2P09535 180 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rpl8P62918 257 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr1336Q8VGH5 314 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trbv29A0A0G2LB96 114 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 GzmbP04187 247 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dhrs2Q149L0 282 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mettl26Q9DCS2 204 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 DeddQ9Z1L3 318 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pde4dipQ80YT7 2224 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trbv17A0A140T8P8 114 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Igsf23B2RTN2 239 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cd3eP22646 189 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Phf7Q9DAG9 307 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trpm7Q923J1 1863 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm10799F7C7U2 104 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gimap1P70224 277 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Bcl2l2P70345 193 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm16503Q8C6M9 103 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rtn4rQ99PI8 473 aa13.13□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 PikfyveQ9Z1T6 2097 aa13.12□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ptbp1P17225 527 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cdkn1bP46414 197 aa13.12□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Defa13P50711 93 aa13.12□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Vax1Q2NKI2 338 aa13.12□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AdtrpQ8C138 230 aa13.12□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Meox2P32443 303 aa13.12□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Defa9P50707 93 aa13.12□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 BC049730Q810N3 246 aa13.12□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Uqcc3Q8K2T4 89 aa13.12□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Vmn1r232A2RTT5 351 aa13.12□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccl2P10148 148 aa13.12□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 HhexP43120 271 aa13.12□□□□□ -0.31
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 MlanaQ2TA50 113 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.9 ms